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1:128137/1‑168 (MQ=255) cTTAAAAGCCCCGGCATTTGCGGTTATCGTAAAAGCAGCGGCAAAAGCGAAAAACT‑AATTTCCTTTCTTCTGCTCAGGGTCGGTCAAGCCGACCCTTTTTGTTTTCAGATTTCACAAACTTCCGCTATAATGACCGCACTTTTTTAACCTTAATTTAAAGGAATTTCTCATGCAAAATCCGAAAGATGATGTGTTTTATGCGCCGGTAGAGTGGATCGATCACAGCGCggg > 1:65074/1‑231 (MQ=255) cTTAAAAGCCCCGGCATTTGCGGTTATCGTAAAAGCAGCGGCAAAAGCGAAAAACT‑AATTTCCTTTCTTCTGCTCAGGGTCGGTCAAGCCGACCCTTTTTGTTTTCAGATTTCACAAACTTCCGCTATAATGACCGCACTTTTTTAACCTTAATTTAAAGGAATTTCTCATGCAAAATCCGAAAGATGATGTGTTTTATGCGCCGGTAGAGTGGATCGATCACAGCGCGGGCTACACCGATATTCGTTAc > 1:574160/1‑250 (MQ=255) ttAAAAGCCCCGGCATTTGCGGTTATCGTAAAAGCAGCGGCAAAAGCGAAAAACT‑AATTTCCTTTCTTCTGCTCAGGGTCGGTCAAGCCGACCCTTTTTGTTTTCAGATTTCACAAACTTCCGCTATAATGACCGCACTTTTTTAACCTTAATTTAAAGGAATTTCTCATGCAAAATCCGAAAGATGATGTGTTTTATGCGCCGGTAGAGTGGATCGATCACAGCGCGGGCTACACCGATATTCGTTACca > 1:212575/1‑251 (MQ=255) ttAAAAGCCCCGGCATTTGCGGTTATCGTAAAAGCAGCGGCAAAAGCGAAAAACT‑AATTTCCTTTCTTCTGCTCAGGGTCGGTCAAGCCGACCCTTTTTGTTTTCAGATTTCACAAACTTCCGCTATAATGACCGCACTTTTTTAACCTTAATTTAAAGGAATTTCTCATGCAAAATCCGAAAGATGATGTGTTTTATGCGCCGGTAGAGTGGATCGATCACAGCGCGGGCTACACCGATATTCGTTACca < 1:332897/251‑1 (MQ=255) gCCCCGGCATTTGCGGTTATCGTAAAAGCAGCGGCAAAAGCGAAAAACT‑AATTTCCTTTCTTCTGCTCAGggt < 1:345556/73‑1 (MQ=255) gCCCCGGCATTTGCGGTTATCGTAAAAGCAGCGGCAAAAGCGAAAAACT‑AATTTCCTTTCTTCTGCTCAGGGTCGGTCAAGCCGACCCTTTTTGTTTTCAGATTTCACAAACTTCCGCTATAATGACCGCACTTTTTTAACCTTAATTTAAAgg > 1:358244/1‑154 (MQ=255) ccccGGCATTTGCGGTTATCGTAAAAGCAGCGGCAAAAGCGAAAAACT‑AATTTCCTTTCTTCTGCTCAGGGTCGGTCAAGCCGACCCTTTTTGTTTTCAGATTTCACAAACTTCCGCTATAATGACCGCACTTTTTTAACCTTAATTTAAAGGAATTTCTCATGCAAAATCCGAAAGATGATGTGTTTTATGCGCCGGTAGAGTGGATCGATCACAGCGCGGGCTACACCGATATTCGTTACCACAAATc < 1:741802/250‑1 (MQ=255) | CCTACGAACCGATTTGGGCAATCGGCACCGGGAAATCTGCCACTCCGGCGCAAGCGCAAGCGGTACACGCGTTCATTCGCGGTCATATCGCGAAAAAATCCCAAGCGGTTGCCGATCAAGTTATTATTCAATACGGCGGTTCCGTAAACGATGCCAACGCGGC‑GGAATTGTTCACCCAACCGGATATTGACGGTG‑CATTGGTGGGCGGCGC‑GTCCTTAAAAGCCCCGGTATTTGCGGTTATCGTAAAAGCAGCGGCAAAAGCGAAAAACT‑AATTTCCTTTCTTCTGCTCAGGGTCGGTCAAGCCGACCCTTTTTGTTTTCAGATTTCACAAACTTCCGCTATAATGACCGCACTTTTTTAACCTTAATTTAAAGGAATTTCTCATGCAAAATCCGAAAGATGATGTGTTTTATGCGCCGGTAGAGTGGATCGATCACAGCGCGGGCTACACCGATATTCGTTACCACAAATC > 1/112590‑113061 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |