| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,053,043 | A→G | intergenic (+87/‑61) | unknown → / → unknown | LSU ribosomal protein L25p/lipoprotein HlpB |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,053,043 | 0 | A | G | 100.0% | 148.0 / NA | 52 | intergenic (+87/‑61) | unknown/unknown | LSU ribosomal protein L25p/lipoprotein HlpB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (30/22); total (30/22) | |||||||||||
ATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTAAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGACCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAATATGAACAAATTTACTAAAATCAGTGCAACTGCTTTATTTGCTCTTTTCTTGACTGCTTGTGATAAACCGGCAGACAAAGCGCCGGATGCAAAACCGGAAGCGGCAGCCCAAACACAATCAGCACCGGCGACTGCCGAAGCGGCAAAAGCCGATGAGA > 1/1052802‑1053260 | atgatgatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGttt > 1:16221/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) ttACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAGTTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAat < 1:621935/251‑1 (MQ=255) aCGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGttt > 1:888315/1‑198 (MQ=255) cGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTTTCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAata < 1:880934/249‑1 (MQ=255) 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1:675291/1‑189 (MQ=255) aTGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATc > 1:509488/1‑180 (MQ=255) cGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAATATGAACAAATTTACTAAAATCAGTGCAACTGCTTTATTTGCTCTTTTCTTGAc < 1:517525/251‑1 (MQ=255) cGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGGTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAATATGAACAAATTTACTAAAATCAGTGCAACTGCTTTATTTGCTCTTTTCTTGAc < 1:435726/251‑1 (MQ=255) ccAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATAc < 1:139462/154‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |