| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,052,887 | A→G | V73V (GTA→GTG) | unknown → | LSU ribosomal protein L25p |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,052,887 | 0 | A | G | 100.0% | 179.6 / NA | 66 | V73V (GTA→GTG) | unknown | LSU ribosomal protein L25p |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (36/30); total (36/30) | |||||||||||
TCTTTTTACATTAAGAGAATATTAAAATGGCATTTAAATTTAACGCTGAAGTTCGTACGGCGCAAGGTAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTAAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGACCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAATATGAACAAATTTACTAAAATC > 1/1052643‑1053124 | tCTTTTTACATTAAGAGAATATTAAAATGGCATTTAAATTTAACGCTGAAGTTCGTACGGCGCAAGGTAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTg > 1:521996/1‑251 (MQ=255) cATTAAGAGAATATTAAAATGGCATTTAAATTTAACGCTGAAGTTCGTACGGCGCAAGGTAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGc < 1:240611/248‑1 (MQ=255) cATTAAGAGAATATTAAAATGGCATTTAAATTTAACGCTGAAGTTCGTACGGCGCAAGGTAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAAt > 1:781042/1‑251 (MQ=255) cATTAAGAGAATATTAAAATGGCATTTAAATTTAACGCTGAAGTTCGTACGGCGCAAGGTAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAAt > 1:868128/1‑251 (MQ=255) cATTTAAATTTAACGCTGAAGTTCGTACGGCGCAAGGTAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCa > 1:6506/1‑251 (MQ=255) aGTTCGTACGGCGCAAGGTAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCaa > 1:60772/1‑228 (MQ=255) tACGGCGCAAGGTAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCaaa < 1:146919/250‑1 (MQ=255) aGGTAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGc < 1:611991/192‑1 (MQ=255) aGGTAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCaa > 1:825588/1‑199 (MQ=255) tAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAAtga < 1:848594/250‑1 (MQ=255) gggTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAAtgattga > 1:236341/1‑251 (MQ=255) aGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATaaaa > 1:50542/1‑249 (MQ=255) gccgccgccTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCaaa > 1:510394/1‑227 (MQ=255) gCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTg > 1:801178/1‑250 (MQ=255) gCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTg > 1:384469/1‑250 (MQ=255) cGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATaa > 1:164872/1‑251 (MQ=255) tttACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAgg < 1:79153/251‑1 (MQ=255) cGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAGCTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAgg < 1:859247/247‑1 (MQ=255) gtggtAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTc < 1:718916/206‑1 (MQ=255) gtggtAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAgg < 1:512106/245‑1 (MQ=255) ggtAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGaa > 1:197221/1‑250 (MQ=255) gtAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGTAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAAc > 1:427713/1‑250 (MQ=255) gtAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACt < 1:29640/174‑1 (MQ=255) gtAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAg > 1:519543/1‑218 (MQ=255) ggTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATaatttaattt > 1:151438/1‑251 (MQ=255) atgatgatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGttt > 1:16221/1‑251 (MQ=255) tgatgatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAAcc < 1:829530/120‑1 (MQ=255) gatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCAcc < 1:672370/106‑1 (MQ=255) gatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACg < 1:486613/143‑1 (MQ=255) gatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATaatttaattt > 1:56848/1‑226 (MQ=255) gatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCt > 1:611313/1‑233 (MQ=255) gatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGt < 1:112331/244‑1 (MQ=255) gatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTc > 1:32881/1‑250 (MQ=255) gatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTc > 1:643838/1‑250 (MQ=255) gatgTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGACGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAggc > 1:683557/1‑236 (MQ=255) aTGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAgg < 1:732727/194‑1 (MQ=255) aTGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGaa < 1:405977/201‑1 (MQ=255) gTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTc < 1:625322/85‑1 (MQ=255) gTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTc > 1:265732/1‑232 (MQ=255) tGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATAc < 1:547683/249‑1 (MQ=255) tGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATAc < 1:353264/249‑1 (MQ=255) aCGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATc < 1:206413/251‑1 (MQ=255) aCGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATc < 1:856159/251‑1 (MQ=255) aTACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCAt > 1:252494/1‑251 (MQ=255) tttCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGc > 1:856703/1‑63 (MQ=255) tttCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAAc < 1:114312/251‑1 (MQ=255) tttCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAAc < 1:301097/251‑1 (MQ=255) ttCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATAc > 1:617701/1‑238 (MQ=255) ttCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAAc > 1:421497/1‑250 (MQ=255) aTTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTc > 1:822756/1‑216 (MQ=255) cGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAgg < 1:316596/251‑1 (MQ=255) tGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATAc > 1:528643/1‑225 (MQ=255) tGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATAc < 1:371512/225‑1 (MQ=255) tGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGAtttt > 1:335932/1‑251 (MQ=255) gATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAgg < 1:374367/160‑1 (MQ=255) gATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGt < 1:589253/200‑1 (MQ=255) ttACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAGTTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAat < 1:621935/251‑1 (MQ=255) aCGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATaatttaattt > 1:829715/1‑178 (MQ=255) aCGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGttt > 1:888315/1‑198 (MQ=255) cGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTTTCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAata < 1:880934/249‑1 (MQ=255) cGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACt < 1:781236/232‑1 (MQ=255) cGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAATATg > 1:520463/1‑251 (MQ=255) cTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAATATGaa > 1:225945/1‑251 (MQ=255) gaAAAAGAAGTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAATATGAACAAATTTACTaa > 1:388785/1‑251 (MQ=255) aagaagTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAATATGAACAAATTTACTAAAATc < 1:742958/251‑1 (MQ=255) agaagTGGCCGTGAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGGCCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAAc > 1:379374/1‑212 (MQ=255) | TCTTTTTACATTAAGAGAATATTAAAATGGCATTTAAATTTAACGCTGAAGTTCGTACGGCGCAAGGTAAGGGTGCGAGCCGCCGCCTGCGTCATAACGGTCAAATTCCTGCTATCGTTTACGGTGGTAGTGAAGCGCCGGTTTCCATCATTTTAAATCATGATGATGTAAACAATGCACAAGTGCACGATACTTTCTATTCCGACGTGATTACGCTAGTGATTGATGAAAAAGAAGTGGCCGTAAAAGTGCAGGCAATGCAACGTCACCCGTTCAAACCAAAATTGGTTCACATTGACTTCAAACGTGTTTAATGATTGATAAAACTCCGGTTATTGCCGGAGTTTTTTCTTTAGGCGGAAATAAGGTTAGGAACAAATAATTTAATTTTCTGTCTAAGACCCATGTTTTGTCCGTTTATCGGATCAATACTTATCCATAAACTCATAAAGGATTTTAATATGAACAAATTTACTAAAATC > 1/1052643‑1053124 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |