| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,047,270 | A→C | I360I (ATA→ATC) | unknown → | Glucose‑1‑phosphate adenylyltransferase (EC 2.7.7.27) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,047,270 | 0 | A | C | 100.0% | 213.6 / NA | 77 | I360I (ATA→ATC) | unknown | Glucose‑1‑phosphate adenylyltransferase (EC 2.7.7.27) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (29/48); total (29/48) | |||||||||||
GACAGCTTCTGGCAATCCAATATCGATTTGGTTTCCGAAAGTCCGCAATTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATAGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCGATGAAGAGCACCTGGATTAAAGTG > 1/1047028‑1047505 | gACAGCTTCTGGCAATCCAATATCGATTTGGTTTCCGAAAGTCCGCAATTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCAtt > 1:351639/1‑250 (MQ=255) cTTCTGGCAATCCAATATCGATTTGGTTTCCGAAAGTCCGCAATTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCg < 1:893525/248‑1 (MQ=255) tCTGGCAATCCAATATCGATTTGGTTTCCGAAAGTCCGCAATTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCgtggtg < 1:682402/251‑1 (MQ=255) aaTCCAATATCGATTTGGTTTCCGAAAGTCCGCAATTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCg < 1:409862/251‑1 (MQ=255) aTCCAATATCGATTTGGTTTCCGAAAGTCCGCAATTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCg > 1:137141/1‑250 (MQ=255) tCGATTTGGTTTCCGAAAGTCCGCAATTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCTATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGaa < 1:432007/251‑1 (MQ=255) ccGCAATTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGtt > 1:546363/1‑251 (MQ=255) cAATTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAac < 1:135524/251‑1 (MQ=255) aTTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCGAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAaca > 1:725826/1‑250 (MQ=255) aTTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAacac < 1:330963/251‑1 (MQ=255) atatTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTg < 1:125257/250‑1 (MQ=255) tACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGtattat < 1:678170/251‑1 (MQ=255) cGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTatcg < 1:217515/251‑1 (MQ=255) cGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTatcg < 1:609742/251‑1 (MQ=255) cGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTatcg < 1:521235/251‑1 (MQ=255) aCCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTatcgat > 1:555529/1‑251 (MQ=255) ccGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGtat < 1:485546/251‑1 (MQ=255) ccGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGtat < 1:474219/251‑1 (MQ=255) aTTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAacac > 1:749819/1‑223 (MQ=255) aTTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGtattat > 1:358922/1‑251 (MQ=255) tGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTatc < 1:391459/229‑1 (MQ=255) gTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGtat < 1:291212/241‑1 (MQ=255) aTCCGGTGCAACCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGt > 1:112247/1‑251 (MQ=255) ccGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTAt < 1:651506/251‑1 (MQ=255) gTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCgtg < 1:217769/201‑1 (MQ=255) gTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGAc < 1:739915/243‑1 (MQ=255) tGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCat < 1:670125/251‑1 (MQ=255) tGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCat < 1:308632/251‑1 (MQ=255) cAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCata < 1:307419/250‑1 (MQ=255) aaGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATc < 1:771834/251‑1 (MQ=255) aGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGtat > 1:759864/1‑228 (MQ=255) aGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCg > 1:710612/1‑251 (MQ=255) cATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCgtgg > 1:532422/1‑153 (MQ=255) tCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCG‑TCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGAt > 1:46302/1‑242 (MQ=255) cTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAAc > 1:305162/1‑172 (MQ=255) cTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGtat < 1:871241/210‑1 (MQ=255) tttATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGAt < 1:723073/251‑1 (MQ=255) cacCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAacac > 1:844677/1‑173 (MQ=255) cacCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGtattat < 1:397838/183‑1 (MQ=255) cacCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTatcg > 1:18419/1‑185 (MQ=255) cacCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCa > 1:758137/1‑216 (MQ=255) ccGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCgtgg > 1:291817/1‑118 (MQ=255) ctctctTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAg < 1:544064/251‑1 (MQ=255) ctctctTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAg > 1:412312/1‑251 (MQ=255) ctctTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCg > 1:61633/1‑113 (MQ=255) ctctTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGtattat < 1:180185/157‑1 (MQ=255) ctctTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATccc < 1:581917/178‑1 (MQ=255) ctTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGcc > 1:283230/1‑163 (MQ=255) ctTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGtat > 1:340715/1‑170 (MQ=255) ctTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGAtg < 1:22494/196‑1 (MQ=255) ctTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGa < 1:799394/206‑1 (MQ=255) ctTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGa < 1:858252/206‑1 (MQ=255) tCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTg < 1:467072/251‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGAt < 1:246848/207‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTg > 1:286802/1‑249 (MQ=255) gTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGt < 1:712784/250‑1 (MQ=255) tGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTAt < 1:452626/250‑1 (MQ=255) aTTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCt > 1:816503/1‑246 (MQ=255) aTTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGt < 1:378087/250‑1 (MQ=255) aTGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGtat > 1:261588/1‑124 (MQ=255) gCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTatcg > 1:399608/1‑127 (MQ=255) gCATCAATCAGTTATTCCGAGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGa > 1:66948/1‑176 (MQ=255) caGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAGTCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCa < 1:468966/150‑1 (MQ=255) caGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACAt < 1:825789/109‑1 (MQ=255) caGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCatat > 1:100799/1‑153 (MQ=255) gttgttTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCg > 1:564025/1‑251 (MQ=255) gttgttTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCg > 1:512211/1‑251 (MQ=255) ttgttTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATg < 1:5494/219‑1 (MQ=255) aaaTTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGAt < 1:152457/134‑1 (MQ=255) aaaTTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCGATGAAGAGCACCTGGAt < 1:780141/251‑1 (MQ=255) aaaTTAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCGATGAAGAGCACCTGGAt < 1:429564/251‑1 (MQ=255) ttAACGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCGATGAAGAGCACCTGGATTaa < 1:605656/251‑1 (MQ=255) aaCGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCGATGAAGAGCACCTGGATTAAAg < 1:729596/251‑1 (MQ=255) aaCGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCGATGAAGAGCACCTGGATTAAAg < 1:180277/251‑1 (MQ=255) aaCGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCGATGAAGAGCACCTGGATTAAAg < 1:83872/251‑1 (MQ=255) cGAAGGCTCGCAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCGATGAAGAGCACCTGGATTAAAGTg < 1:197519/251‑1 (MQ=255) cAAATCGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCGATGAAGAGCACCTGGATTAAAg < 1:222278/239‑1 (MQ=255) | GACAGCTTCTGGCAATCCAATATCGATTTGGTTTCCGAAAGTCCGCAATTGGATATTTACGACCAAACCTGGCCGATTCGTGGTAATCCGGTGCAAGCCTATCCATCTAAATTCTTTTATAAAAACACCAATATCAAACCGGTGGATAACTCTCTTATCGGTGGCGGCTGCGTGATTACCGATGCATCAATCAGTTATTCCGTGTTGTTTGACCGCATCAAAATTAACGAAGGCTCGCAAATAGATCATTCCGTGGTGTTACCGCAAGTGGAAATCGGGAAAAACTGCGTGTTAACACATTGTATTATCGATCGCCACTGTATTATCCCGGACGGTATGCATATCGATGTGGATAAAGAATTAGATCGCCAACGTTTCCGTGTCAGTTCCAGCGGTAAAGTGGTGTTGGTTACCCCTTCTATGTTGAAAAAATTAGAAGGGCGTGAAGTTGTCGATGAAGAGCACCTGGATTAAAGTG > 1/1047028‑1047505 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |