| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,034,142 | C→G | intergenic (+95/+178) | unknown → / ← unknown | Esterase/lipase/Efflux transport system, outer membrane factor (OMF) lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,034,142 | 0 | C | G | 100.0% | 183.9 / NA | 65 | intergenic (+95/+178) | unknown/unknown | Esterase/lipase/Efflux transport system, outer membrane factor (OMF) lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (31/34); total (31/34) | |||||||||||
GTGATACTTCGCACGCTATCGGTGCTATGTTAGCTATAAAATTGCGTATGGCGGGTAAGCAGGTGGATTATGAAACGCCATGGGGCGTGCCGCATGCGGGGGATTATGATTTGGATGAGTTGTTTCAGTGGGTGGATAGTATTAGCAAATAGTTTACGGGAATGGTAAAAGTGCGGTGGTGTTTTACATAAAGCATCGGCACTCACTACTGTAGAGGACGATCGTTGAGCTTGAGTCAGAGCTTGTCGAGCTTCTGGCTATCAAAACATTGGGCCTGTTCCACTGGGACATGAAATAGCAATGTAATACCTAAGGGTGGTTGAAAAATAATCACCCTATAACTTA‑GGGGGACATATAAAAGCAAAAACGGCACTTTTCATAAAGCACCGTTGTATGCTAAACACATAAGCGCGGTTGTTTCACATTATTTTTTTACGGAATAATAACCCGCCATAGAACTGTAAAC > 1/1033896‑1034361 | gTGATACTTCGCACGCTATTGGTGCTATGTTAGCTATAAAATTGCGTATGGCGGGTAAGCAGGTGGATTATGAAACGCCATGGGGCGTGCCGCATGCGGGGGATTATGATTTGGATGAGTTGTTTCAGTGGGTGGATAGTATTAGCAAATAGTTTACGGGAATGGTAAAAGTGCGGTGGTGTTTTACATAAAGCATCGGCACTCACTACTGTAGAGGACGATCGTTGAGCTTGAGTCAGAGCTTGTGGAg > 1:798733/1‑250 (MQ=255) 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gTAGAGGACGATCGTTGAGCTTGAGTCAGAGCTTGTGGAGCTTCTGGCTATCAAAACATTGGGCCTGTTCCACTGGGACATGAAATAGCAATGTAATACCTAAGGGTGGTTAAAAAATAATCACCCTATAACTTAGGGGGGACATATAAAAGCAAAAACGGCACTTTTCGTAAAGCACCGTTGTATGCTAAACACATAAGCGCGGTTGTTTCACATTATTTTTTTACGGAATAATAACCCGCCATAGAAc > 1:426891/1‑250 (MQ=255) agCTTGTGGAGCTTCTGGCTATCAAAACATTGGGCCTGTTCCACTGGGACATGAAATAGCAATGTAATACCTAAGGGTGGTTAAAAAATAATCACCCTATAACTTAGGGGGGACATATAAAAGCAAAAACGGCACTTTTCATAAAGCACCGTTGTATGCTAAACACATAAGCGCGGTTGTTTCACATTATTTTTTTACGGAATAATAACCCGCCATAGAACTGTAAAc > 1:128865/1‑228 (MQ=255) | GTGATACTTCGCACGCTATCGGTGCTATGTTAGCTATAAAATTGCGTATGGCGGGTAAGCAGGTGGATTATGAAACGCCATGGGGCGTGCCGCATGCGGGGGATTATGATTTGGATGAGTTGTTTCAGTGGGTGGATAGTATTAGCAAATAGTTTACGGGAATGGTAAAAGTGCGGTGGTGTTTTACATAAAGCATCGGCACTCACTACTGTAGAGGACGATCGTTGAGCTTGAGTCAGAGCTTGTCGAGCTTCTGGCTATCAAAACATTGGGCCTGTTCCACTGGGACATGAAATAGCAATGTAATACCTAAGGGTGGTTGAAAAATAATCACCCTATAACTTA‑GGGGGACATATAAAAGCAAAAACGGCACTTTTCATAAAGCACCGTTGTATGCTAAACACATAAGCGCGGTTGTTTCACATTATTTTTTTACGGAATAATAACCCGCCATAGAACTGTAAAC > 1/1033896‑1034361 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |