| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,033,915 | C→T | I329I (ATC→ATT) | unknown → | Esterase/lipase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,033,915 | 0 | C | T | 100.0% | 146.4 / NA | 54 | I329I (ATC→ATT) | unknown | Esterase/lipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (25/29); total (25/29) | |||||||||||
ATCGCCACCGGCATTTGATGCGCTGAATTTGAGTTCGGGCGAAAATAATTTATTTGGTACGGAAACCGTGAATAATCAGCATTTCACCGTTTTTTCTTGGCAACACAGCACGGAAAAGGGAAAGATGGCGGATAAAAATGTGGTGTGCTTAATGAACGCCATGAATTATGTGGATCAAAGTAAAACGCAGCATTGGCGCATTCGGGTCGGCACCTCCGACCGTGATACTTCGCACGCTATCGGTGCTATGTTAGCTATAAAATTGCGTATGGCGGGTAAGCAGGTGGATTATGAAACGCCATGGGGCGTGCCGCATGCGGGGGATTATGATTTGGATGAGTTGTTTCAGTGGGTGGATAGTATTAGCAAATAGTTTACGGGAATGGTAAAAGTGCGGTGGTGTTTTACATAAAGCATCGGCACTCACTACTGTAGAGGACGATCGTTGAGCTTGAGTCAGAGCTTGTCGAGCTTCTGGCTATCAAAA > 1/1033675‑1034161 | aTCGCCACCGGCATTTGATGCGCTGAATTTGAGTTCGGGCGAAAATAATTTATTTGGTACGGAAACCGTGAATAATCAGCATTTCACCGTTTTTTCTTGGCAACACAGCACGGAAAAGGGAAAGATGGCGGATAAAAATGTGGTGCGCTTAATGAACGCCATGAATTATGTGGATCAAAGTAAAACGCAGCATTGGCGCACTCGGGTCGGCACCTCCGACCGTGATACTTCGCACGCTATTGGTGCTATGt < 1:45715/251‑1 (MQ=255) 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1:35027/251‑1 (MQ=255) gCATTTCACCGTTTTTTCTTGGCAACACAGCACGGAAAAGGGAAAGATGGCGGATAAAAATGTGGTGCGCTTAATGAACGCCATGAATTATGTGGATCAAAGTAAAACGCAGCATTGGCGCACTCGGGTCGGCACCTCCGACCGTGATACTTCGCACGCTATTGGTGCTATGTTAGCt > 1:147507/1‑178 (MQ=255) gCATTTCACCGTTTTTTCTTGGCAACACAGCACGGAAAAGGGAAAGATGGCGGATAAAAATGTGGTGCGCTTAATGAACGCCATGAATTATGTGGATCAAAGTAAAACGCAGCATTGGCGCACTCGGGTCGGCACCTCCGACCGTGATACTTCGCACGCTATTGGTGCTATGTTAGCTATAAAATTGCGTATGGCGGGTAAGCAGGTGGATTATGa < 1:347831/216‑1 (MQ=255) ccGTTTTTTCTTGGCAACACAGCACGGAAAAGGGAAAGATGGCGGATAAAAATGTGGTGCGCTTAATGAACGCCATGAATTATGTGGATCAAAGTAAAACGCAGCATTGGCGCACTCGGGTCGGCACCTCCGACCGTGATACTTCGCACGCTATTGGTGCTATGTTAGCTATAAAATTGCGTATGGCGGGTAAGCAGGTGGATTATGAAACGCCATGGGGCGTGCCGCATGCGGGGGATTATGATTTGGAt < 1:886790/251‑1 (MQ=255) cAACACAGCACGGAAAAGGGAAAGATGGCGGATAAAAATGTGGTGCGCTTAATGAACGCCATGAATTATGTGGATCAAAGTAAAACGCAGCATTGGCGCACTCGGGTCGGCACCTCCGACCGTGATACTTCGCACGCTATTGGTg > 1:679117/1‑145 (MQ=255) 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cTATTGGTGCTATGTTAGCTATAAAATTGCGTATGGCGGGTAAGCAGGTGGATTATGAAACGCCATGGGGCGTGCCGCATGCGGGGGATTATGATTTGGATGAGTTGTTTCAGTGGGTGGATAGTATTAGCAAATAGTTTACGGGAATGGTaa < 1:804225/153‑1 (MQ=255) cTATTGGTGCTATGTTAGCTATAAAATTGCGTATGGCGGGTAAGCAGGTGGATTATGAAACGCCATGGGGCGTGCCGCATGCGGGGGATTATGATTTGGATGAGTTGTTTCAGTGGGTGGATAGTATTAGCAAATAGTTTACGGGAATGGTAAAAGTGCGGTGGTGTTTTACATAAAGCATCGGCACTCACTACTGTAGAGGACGATCGTTGAGCTTGAg < 1:461362/220‑1 (MQ=255) cTATTGGTGCTATGTTAGCTATAAAATTGCGTATGGCGGGTAAGCAGGGGGATTATGAAACGCCATGGGGCGTGCCGCATGCGGGGGATTATGATTTGGATGAGTTGTTTCAGTGGGTGGATAGTATTAGCAAATAGTTTACGGGAATGGTAAAAGTGCGGTGGTGTTTTACATAAAGCATCGGCACTCACTACTGTAGAGGACGATCGTTGAGCTTGAGTCAGAGCTTGTGGAGCTTCTGGCTATCaaaa > 1:477184/1‑251 (MQ=255) | ATCGCCACCGGCATTTGATGCGCTGAATTTGAGTTCGGGCGAAAATAATTTATTTGGTACGGAAACCGTGAATAATCAGCATTTCACCGTTTTTTCTTGGCAACACAGCACGGAAAAGGGAAAGATGGCGGATAAAAATGTGGTGTGCTTAATGAACGCCATGAATTATGTGGATCAAAGTAAAACGCAGCATTGGCGCATTCGGGTCGGCACCTCCGACCGTGATACTTCGCACGCTATCGGTGCTATGTTAGCTATAAAATTGCGTATGGCGGGTAAGCAGGTGGATTATGAAACGCCATGGGGCGTGCCGCATGCGGGGGATTATGATTTGGATGAGTTGTTTCAGTGGGTGGATAGTATTAGCAAATAGTTTACGGGAATGGTAAAAGTGCGGTGGTGTTTTACATAAAGCATCGGCACTCACTACTGTAGAGGACGATCGTTGAGCTTGAGTCAGAGCTTGTCGAGCTTCTGGCTATCAAAA > 1/1033675‑1034161 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |