| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,013,715 | G→T | A2D (GCT→GAT) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,013,715 | 0 | G | T | 100.0% | 90.2 / NA | 35 | A2D (GCT→GAT) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (17/18); total (17/18) | |||||||||||
GTAAGATCCTTGCTGATATCGCCGTATTCGACAAAGTGGCTTTCGCTGCATTAGTTGAAAAAGCAAAATCTGCACTTTAATTTTAAAGTTTAGATAAAAAATAAGGGCGCTCATGAGCGTCCTTTTTATTATTGTTGATTTTCTGATTGATTGGCTATTTTTTCTTGTTTTGAATAATAGAAATAGAGCCAAATGAGTCCGATTGGTGAGATAAATAAAGCAAAAAAGTAACAGATAGCCATTGTTATCAGTTTTACTGTCATCATAAATAATGCATCTGTGATGAATATATTATCTCCCACAATGCATTCAACAATACCTTCATAAGTAAAGCGTGAATAAGGGTATAAAATTAAAGAAACTAAACCATAAACAATATTTGTTGCCAAAATATAATAGTTTCCACTTCTGTTGTAAGGTTGACAACCAAAATTCAAGATACA > 1/1013478‑1013920 | gTAAGATCCTTGCTGATATCGCCGTATTCGACAAAGTGGCTTTCGCTGCATTAGTTGAAAAAGCAAAATCTGCACTTTAATTTTAAAGTTTAGATAAAAAATAAGGGCGCTCATGAGCGTCCTTTTTATTATTGTTGATTTTCTGATTGATTGGCTATTTTTTCTTGTTTTGAATAATAGAAATAGAGCCAAATGAGTCCGATTGGTGAGATAAATAAAGCAAAAAAGTAACAGATATCCATTcattctaa > 1:586244‑M1/1‑243 (MQ=255) aTCCTTGCTGATATCGCCGTATTCGACAAAGTGGCTTTCGCTGCATTAGTTGAAAAAGCAAAATCTGCACTTTAATTTTAAAGTTTAGATAAAAAATAAGGGCGCTCATGAGCGTCCTTTTTATTATTGTTGATTTTCTGATTGATTGGCTATTTTTTCTTGTTTTGAATAATAGAAATAGAGCCAAATGAGTCCGATTGGTGAGATAAATAAAGCAAAAAAGTAACAGATATCCATTcattctaatga < 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |