| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,012,847 | G→A | V9V (GTC→GTT) | unknown ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,012,847 | 0 | G | A | 100.0% | 145.7 / NA | 54 | V9V (GTC→GTT) | unknown | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (30/24); total (30/24) | |||||||||||
ATCGGTTTGGACGTGTTAGAGCGTGTTAAAAATGATTTAGCCGAAATTGCCGTGGTGGAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAGACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAACAATCTCACTTACGTCATATTTTGACTAAGAAAGCAACAAAACGTAAACGTCACCTACGC > 1/1012607‑1013087 | atCGGTTTGGACGTGTTAGAGCGTGTTAAAAATGATTTAGCCGAAATTGCCGTGGTGGAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAg < 1:512541/251‑1 (MQ=255) cGGTTTGGACGTGTTAGAGCGTGTTAAAAATGATTTAGCCGAAATTGCCGTGGTGGAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGAc < 1:590527/251‑1 (MQ=255) gtgtTAGAGCGTGTTAAAAATGATTTAGCCGAAATTGCCGTGGTGGAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGAc < 1:892474/241‑1 (MQ=255) gtgtTAGAGCGTGTTAAAAATGATTTAGCCGAAATTGCCGTGGTGGAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGc > 1:302411/1‑246 (MQ=255) gtgtTAGAGCGTGTTAAAAATGATTTAGCCGAAATTGCCGTGGTGGAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAAttt > 1:140965/1‑251 (MQ=255) gtgtTAGAGCGTGTTAAAAATGATTTAGCCGAAATTGCCGTGGTGGAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAAttt > 1:570566/1‑251 (MQ=255) gtTAGAGCGTGTTAAAAATGATTTAGCCGAAATTGCCGTGGTGGAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTg > 1:241521/1‑250 (MQ=255) tAAAAATGATTTAGCCGAAATTGACGTGGTGGAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCgg < 1:679248/251‑1 (MQ=255) aTTTAGCCGAAATTGCCGTGGTGGAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACg < 1:198733/250‑1 (MQ=255) tggtggAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGa < 1:197543/250‑1 (MQ=255) aaTCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAgg > 1:563063/1‑250 (MQ=255) gCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGAt > 1:580133/1‑251 (MQ=255) cACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGAtt < 1:466427/251‑1 (MQ=255) gggTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCt > 1:573373/1‑227 (MQ=255) gggTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAgtg > 1:146756/1‑251 (MQ=255) ggTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAg > 1:877625/1‑182 (MQ=255) ggTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGa > 1:481299/1‑233 (MQ=255) aaTTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCgg > 1:279770/1‑204 (MQ=255) ccAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGt < 1:44337/251‑1 (MQ=255) gCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGttatt > 1:781341/1‑251 (MQ=255) ccATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGttatta > 1:875858/1‑251 (MQ=255) aTTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAgg > 1:566026/1‑215 (MQ=255) ttATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGAc < 1:776582/159‑1 (MQ=255) ttATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGAc < 1:172658/251‑1 (MQ=255) aTGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACTGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACaa < 1:438703/251‑1 (MQ=255) gAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCgg > 1:898912/1‑161 (MQ=255) gAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGAc > 1:629871/1‑229 (MQ=255) cATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTa < 1:174136/251‑1 (MQ=255) aTTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCgg < 1:838387/147‑1 (MQ=255) tttCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAg < 1:321573/251‑1 (MQ=255) aGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGttt > 1:756178/1‑251 (MQ=255) tAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGa > 1:671554/1‑206 (MQ=255) aCAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGAtt > 1:417496/1‑175 (MQ=255) tgtTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAg < 1:586063/250‑1 (MQ=255) cTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACaa > 1:557093/1‑166 (MQ=255) cTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAACAATCTCACtt < 1:17184/251‑1 (MQ=255) tATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAACAATCTCACTTACGt < 1:264944/251‑1 (MQ=255) gATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACgt > 1:641801/1‑91 (MQ=255) gATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGtgctgc < 1:387600/184‑1 (MQ=255) gATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCg < 1:5253/223‑1 (MQ=255) gATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAACAATCTCACTTACGTCATATTTTg > 1:885730/1‑251 (MQ=255) attattTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAACAATCTCACTTACGTCATATTTTGa > 1:644013/1‑251 (MQ=255) gtgATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAAc > 1:129072/1‑220 (MQ=255) gATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAACAATCTCACTTACGTCATAtt < 1:457288/238‑1 (MQ=255) gCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAg > 1:535744/1‑205 (MQ=255) gATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAATCGGTTTATCGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACATTGCGGAGTTATTAAACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTa > 1:726168/1‑162 (MQ=255) gATTTAAAGTGAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGAtt < 1:212332/97‑1 (MQ=255) gAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACgt > 1:367301/1‑57 (MQ=255) gAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCgg > 1:818439/1‑144 (MQ=255) gAGTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAACAATCTCACTTACGt > 1:711236/1‑208 (MQ=255) gTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCg < 1:791439/80‑1 (MQ=255) gTACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAACAATCTCACTTACGt > 1:124158/1‑206 (MQ=255) tACAAGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGAGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAACAATCTCACTTACGTCATATTTTGACTAAGAAAACAACAAAACGTAAACGTCACCTACGc < 1:6636/250‑1 (MQ=255) aGGCAAACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAACAATCTCACTTa < 1:322550/198‑1 (MQ=255) | ATCGGTTTGGACGTGTTAGAGCGTGTTAAAAATGATTTAGCCGAAATTGCCGTGGTGGAATCTGCACCGGGTAAATTGGAAGGTCGCCAAGCCATTATGGTGCTTGCTCCGAAAAAGAAATAATCAGTGCATTTCAAGTAACAAAAGTGCGGTGAAAATTCCAAGTGTTTTTTCAACCGCACTTTTATTCGCCTGATTATTTGTGATAGAGCCTTTTAGATTTAAAGTGAGTACAAGGCAGACCGCTGAAGACAGTGCAATTTGCACGGTGAAGCGGTTTAACGTAGTAATCGCTTTAAAGATAAAGGCGTGATTAGTGTTAAAAACAATGCGGAGTTATTAGACAATGCCTAAAATTAAAACAGCACGCGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACTGCTTCCGGTGGTTTCAAGCGTAAACAATCTCACTTACGTCATATTTTGACTAAGAAAGCAACAAAACGTAAACGTCACCTACGC > 1/1012607‑1013087 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |