| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,001,840 | C→T | A30A (GCC→GCT) | unknown → | NADH dehydrogenase (EC 1.6.99.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,001,840 | 0 | C | T | 100.0% | 149.7 / NA | 55 | A30A (GCC→GCT) | unknown | NADH dehydrogenase (EC 1.6.99.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (34/21); total (34/21) | |||||||||||
CTTAAAGGCAATTTTATGTTGCCTTTTTTTGTATTTACATAACGGTAACGAAGTATTTTCCTTTTTTACAAATCAACCCTAAGCAAAAATAATAAATTGGTGTTAAAATATTGTTAATTAAATTTTGCAATTTTTTTATTTAGTTTAGAGGTAGTTATGAAAAACATCGTTATTGTCGGTGGTGGCGCCGGCGGGTTAGAACTTGCCACCCACTTAGGCAACAAACTTGGACGCAAAAAACGCGCCAATGTCACTTTAATTGATCGCAACCAAACCCATTTATGGAAACCGTTATTGCATGAATTGGCAACAGGCGCATTAGATGACGGCGTAGAAGCTTTGAGTTATCGTGCCCATGCCTGCAATCATCATTTCAATTTTGAGCAAGGCTCCATGGTTGGCTTAAATCGTCAGCATAAATATGTAGAACTTGCCCCGGTTTACGGTGAAGACGGCGATATGATCGTGGTTTCCCGTCGCATTCCTTATG > 1/1001595‑1002084 | ctTAAAGGCAATTTTATGTTGCCTTTTTTTGTATTTACATAACGGTAACGAAGTATTTTCCTTTTTTACAAATCAACCCTAAGCAAAAATAATAAATTGGTGTTAAAATATTGTTAATTAAATTTTGCAATTTTTTTATTTAGTTTAGAGGTAGTTATGAAAAACATCGTTATTGTCGGTGGTGGCGCCGGCGGGTTAGAACTTGCCACCCACTTAGGCAACAAACTTGGACGCAAAAAACGCGCTAATGt > 1:5391/1‑251 (MQ=255) 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caacaaACTTGGACGCAAAAAACGCGCTAATGTCACTTTAATTGATCGCAACCAAACCCATTTATGGAAACCGTTATTGCATGAATTGGCAACAGGCGCATTAGATGACGGCGTAGAAGCTTTGAGTTATCGTGCCCATGCCTGCAATCATCATTTCAATTTTGAGCAAGGCTCCATGGTTGGCTTAAATCGTCAGCATAAATATGTAGAACTTGCCCCGGTTTACGGTGAAGACGGCGATATGATCGTgg < 1:798266/251‑1 (MQ=255) aacaaACTTGGACGCAAAAAACGCGCTAATGTCACTTTAATTGATCGCAACCAAACCCATTTATGGAAACCGTTATTGCATGAATTGGCAACAGGCGCATTAGATGACGGCGTAGAAGCTTTGAGTTATCGTGCCCATGCCTGCAATCATCATTTCAATTTTGAGCAAGGCTCCATGGTTGGCTTAAATCGTCAGCATAAATATGTAGAACTTGCCCCGGTTTACGGTGAAGACGGCGATATGATCGTGGt < 1:291690/251‑1 (MQ=255) aCGCAAAAAACGCGCTAATGTCACTTTAATTGATCGCAACCAAACCCATTTATGGAAACCGTTATTGCATGAATTGGCAACAGGCGCATTAGATGACGGCGTAGAAGCTTTGAGTTATCGTGCCCATGCCTACAATCATCATTTCAATTTTGAGCAAGGCTCCATGGTTGGCTTAAATCGTCAGCATAAATATGTAGAACTTGCCCCGGTTTACGGTGAAGACGGCGATATGATCGTGGTTTCCCGTCGc < 1:364180/250‑1 (MQ=255) 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1/1001595‑1002084 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |