| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,000,414 | T→C | S144P (TCA→CCA) | unknown → | Glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase (EC 1.1.5.3) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,000,414 | 0 | T | C | 100.0% | 194.2 / NA | 70 | S144P (TCA→CCA) | unknown | Glycerol‑3‑phosphate dehydrogenase (EC 1.1.5.3) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (37/33); total (37/33) | |||||||||||
ACGGCGGCGTGCGTTATTTGGCGGCCGGCGATGTGGCGTTAGTGAAAGAGGCGTTGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTATCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCGTGCATGGTACGGCAGTGATTAACGCCACCG > 1/1000169‑1000657 | aCGGCGGCGTGCGTTATTTGGCGGCCGGCGATGTGGCGTTAGTGAAAGAGGCGTTGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAAcc < 1:416089/251‑1 (MQ=255) cgtgcgtTATTTGGCGGCCGGCGATGTGGCGTTAGTGAAAGAGGCGTTGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAaac < 1:251805/250‑1 (MQ=255) gcgtTATTTGGCGGCCGGCGATGTGGCGTTAGTGAAAGAGGCGTTGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAAGGGGTCCCACCGGTTCAAAATTAAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTTTGGACGGCGTGAAAAACCGGGTGGGGTTGGGGTTGTTTGTTTATTTGTCCGGGGATTTAGGTTGGGGAAAAACCATGGCGTTTAATAAGGAAACAAGGATGAAGGGTTTACCAACTTAAaacggaa > 1:147203/1‑251 (MQ=255) tAGTGAAAGAGGCGTTGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATaaa < 1:485063/251‑1 (MQ=255) tGAAAGAGGCGTTGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAg < 1:273107/249‑1 (MQ=255) tGAAAGAGGCGTTGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGa < 1:565381/250‑1 (MQ=255) tGAAAGAGGCGTTGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGa < 1:519763/250‑1 (MQ=255) tGAAAGAGGCGTTGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGAGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGAATTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGa < 1:613215/250‑1 (MQ=255) aaGAGGCGTTGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGa > 1:874567/1‑247 (MQ=255) ttGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAAc < 1:206607/222‑1 (MQ=255) gCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACg > 1:793386/1‑251 (MQ=255) cGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGa < 1:619974/251‑1 (MQ=255) cAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGCCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAat < 1:449667/251‑1 (MQ=255) cgTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAat > 1:300434/1‑242 (MQ=255) ccACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCg < 1:130326/251‑1 (MQ=255) gTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGaaaaa > 1:123648/1‑180 (MQ=255) gTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTg > 1:657304/1‑251 (MQ=255) cAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAAc < 1:856791/251‑1 (MQ=255) aaaaTCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACaa < 1:560747/251‑1 (MQ=255) aaaaTCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACaa < 1:277744/251‑1 (MQ=255) attgtattatTCCGAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTAcc < 1:284195/247‑1 (MQ=255) ttattaTTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAat > 1:228217/1‑215 (MQ=255) ttattCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCtt < 1:42617/251‑1 (MQ=255) ttCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAaac > 1:26493/1‑140 (MQ=255) ttCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAAt < 1:269413/251‑1 (MQ=255) cTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAg < 1:24525/167‑1 (MQ=255) cTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAAc < 1:599315/224‑1 (MQ=255) cTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGa > 1:225260/1‑251 (MQ=255) aTTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAatat < 1:279484/199‑1 (MQ=255) gCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTa > 1:152232/1‑251 (MQ=255) gCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGACGTGGCATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTa > 1:632277/1‑251 (MQ=255) cGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCt > 1:197454/1‑173 (MQ=255) cGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAatat > 1:686878/1‑186 (MQ=255) cGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTaa > 1:511009/1‑251 (MQ=255) gTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTaaa > 1:496980/1‑251 (MQ=255) gTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTaaa > 1:223197/1‑251 (MQ=255) gTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTaaa > 1:155759/1‑251 (MQ=255) gtgtCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCaa > 1:143690/1‑251 (MQ=255) tgtCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAg > 1:803621/1‑224 (MQ=255) gggttggggttgTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTg > 1:253866/1‑145 (MQ=255) gggttggggttgTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAAt > 1:615655/1‑210 (MQ=255) gggttggggttgTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGt > 1:544082/1‑249 (MQ=255) gggttggggttgTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTaa > 1:51137/1‑251 (MQ=255) gggttggggttgTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTaa > 1:432838/1‑251 (MQ=255) gggttggggttgTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTAACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTaa > 1:875090/1‑251 (MQ=255) ggggttgTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCg > 1:651477/1‑197 (MQ=255) aTGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGa < 1:219847/226‑1 (MQ=255) gATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAAtt > 1:21013/1‑251 (MQ=255) gTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAAc < 1:831772/221‑1 (MQ=255) gggTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATaa > 1:745528/1‑90 (MQ=255) gggTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGCAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGaa > 1:539293/1‑250 (MQ=255) aaaCCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGTCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAatat < 1:642247/251‑1 (MQ=255) aaaCCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAatat < 1:812012/251‑1 (MQ=255) aCCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAg < 1:4336/251‑1 (MQ=255) aCCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAg < 1:827893/251‑1 (MQ=255) cATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCg < 1:59772/251‑1 (MQ=255) aTTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCGTGCATgg > 1:527497/1‑251 (MQ=255) ttAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGCGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAATTGTTAAAGGa > 1:425044/1‑181 (MQ=255) aataaAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCGTGCATGGTa > 1:570118/1‑250 (MQ=255) aataaAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCGTGCATGGTAc < 1:817114/251‑1 (MQ=255) ataaAGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCtt < 1:816007/146‑1 (MQ=255) aaaGACACCACGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCGTGCATGGTACGGc < 1:281212/251‑1 (MQ=255) ccaccaTGCAGCGTTTCCCCACCTTAAACGGAACTCACTTGAAAAACCGCGTGGTATATCAAGACGGTCAGTTTGCCGATTCCCGCCTTGCTATAAATATCTCTCAAACCGTGGTCGCCCTAGGCGGTACCGTGCCCACTCATGCGAAATTGACCTAGTTGTTCACCGCTGGGCAAGATAAAATCAACGGCGTTACATTTACCGATGCCTGCAACGGCGCACAATATAGCGTGCATGGTACGGCAGTCAtt > 1:738537/1‑251 (MQ=255) ccacGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCGTGCATGGTACGGCAGTGAtt > 1:341884/1‑251 (MQ=255) ccacGATGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCGTGCATGGTACGGCAGTGAtt < 1:482972/251‑1 (MQ=255) aTGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGa < 1:765941/164‑1 (MQ=255) aTGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAg > 1:646939/1‑224 (MQ=255) aTGCAGCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCGTGCATGGTACGGc > 1:603435/1‑239 (MQ=255) gCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCGTGCATGGt < 1:835754/229‑1 (MQ=255) gCGTTTACCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCGTGCATGGTACGGCAGTGATTAACGCCACCg > 1:830595/1‑251 (MQ=255) | ACGGCGGCGTGCGTTATTTGGCGGCCGGCGATGTGGCGTTAGTGAAAGAGGCGTTGCGTGAACGTGGTCGTTTAGCAAAAAACGCGTCCCACCTGTTCAAAAATCAGAATTTTATTATTCCTAACTATAATTTTATCGACAGCGTGAAATACCGTGTCGGGTTGGGGTTGTATGATTATTTGTCCGGCGATTTAAGTTTGGGTAAAACCATCGCGATTAATAAAGACACCACGATGCAGCGTTTATCAACCTTAAACGGAACGGACTTGAAAAACGGCGTGGTATATAAAGACGGTCAGTTTGACGATTCCCGCTTGGCGATAAATATCGCGCAAACCGTGGTTGAACAAGGCGGTACCGTGCTTAATTATGCGAAAGTGACTGAGTTGTTAAAGGACGGGCAAGGTAAAATCAACGGCGTTAAATTTACCGATGAATTAAACGGCGAACAATATAGCGTGCATGGTACGGCAGTGATTAACGCCACCG > 1/1000169‑1000657 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |