| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 989,410 | T→C | A185A (GCA→GCG) | unknown ← | Fructose repressor FruR, LacI family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 989,410 | 0 | T | C | 100.0% | 221.6 / NA | 80 | A185A (GCA→GCG) | unknown | Fructose repressor FruR, LacI family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (38/42); total (38/42) | |||||||||||
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1:601519/251‑1 (MQ=255) ccTTCTTCCCGTTCCCGGCTTGTCGGCAAATCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTg > 1:23966/1‑251 (MQ=255) ccTTCTTCCCGTTCCCGGCTTGTCGGCAAATCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTg > 1:271567/1‑251 (MQ=255) ttcccgttcccgGCTTGTCGGCAAATCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGa < 1:664818/94‑1 (MQ=255) ccgttcccgGCTTGTCGGCAAATCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAAt < 1:496012/251‑1 (MQ=255) ccgttcccgGCTTGTCGGCAAATCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAAt < 1:396638/251‑1 (MQ=255) ttcccgGCTTGTCGGCAAATCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAAt > 1:471498/1‑248 (MQ=255) ttcccgGCTTGTCGGCAAATCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAATGtt > 1:7101/1‑251 (MQ=255) ttcccgGCTTGTCGGCAAATCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAATGt < 1:374952/250‑1 (MQ=255) ggCTTGTCGGCAAATCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGc < 1:32062/202‑1 (MQ=255) cTTGTCGGCAAATCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAATGTTTCACGc < 1:468358/250‑1 (MQ=255) aaaTCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAATGTTTCACGCAATCTTGCTc < 1:252791/251‑1 (MQ=255) aTCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAATGTTTCACGCAATCTTGCTCAt > 1:571356/1‑251 (MQ=255) aTCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAATGTTTCACGCAATCTTGCTCAt > 1:344712/1‑251 (MQ=255) aTCCGGTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAATGTTTCACGCAATCTTGCTCAt > 1:599865/1‑251 (MQ=255) gTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACgg > 1:237057/1‑122 (MQ=255) gTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGt < 1:638124/215‑1 (MQ=255) gTAACGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAATGTTTCACGCAATCTTGCTCATTTTc > 1:663308/1‑250 (MQ=255) | TCACTAAGTCTTTCGGCACCTGTCCCAGTTTTTGCAACAAGACCAATAACACTCCTTCCAACAAGGTAAAAGACGTGGTGAAAATTGCCGTTGGTAACGGATTATTTTCTAACCATTGGGCAAAACATTGCGCCGCTTCGTTTTTACGGAACATATCGCCGTAAAGATATTTGGCGGAAGCCTTCCGATACCTTAATGCCGAGCGAAATCCTTCTTCCCGTTCCCGGCTTGTCGGCAAATCCGGTAATGCACCGAAGAACAAAATTCTTTTTTGATGAGGGATTTTCAACAATTCCTTCGTTAAACGATATGCATCGCCTTCGTCGTCGGTCAGGGCATTCACCACTTTCGGGGAGCTAATACGGCGATCAAAACCGATAATCGGCACGCTGGCGTTTTGGTAAAAATCTGTGTTCGGTGGCAGTGCTGAGGAAACCAACAATGCATCAACCTGACGTTGTAATAAATGTTTCACGCAATCTTGCTCATTTTC > 1/989163‑989655 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |