| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 966,446 | G→T | A127E (GCG→GAG) | unknown ← | Maltodextrin phosphorylase (EC 2.4.1.1) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 966,446 | 0 | G | T | 87.7% | 122.6 / ‑5.3 | 57 | A127E (GCG→GAG) | unknown | Maltodextrin phosphorylase (EC 2.4.1.1) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (34/16); minor base C (0/7); total (34/23) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.27e-04 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAAATCAAAGGCTTTGCCTTGAATGATGAGTTTCGGCTCCCAAGCGTATTTGTCGCCTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCGCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATTAAAAATTCCATGGAAAGATAATTCACATGGCGACCGCTTTTTTTCGCTGCAGGTTTGCCATAAGCC > 1/966205‑966688 | cAAATCAAAGGCTTTGCCTTGAATGATGAGTTTCGGCTCCCAAGCGTATTTGTCGCCTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATgg < 1:152555/251‑1 (MQ=255)cAAATCAAAGGCTTTGCCTTGAATGATGAGTTTCGGCTCCCAAGCGTATTTGTCGCCTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATgg < 1:839858/251‑1 (MQ=255) aaTCAAAGGCTTTGCCTTGAATGATGAGTTTCGGCTCCCAAGCGTATTTGTCGCCTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGaa < 1:105940/251‑1 (MQ=255) aTCAAAGGCTTTGCCTTGAATGATGAGTTTCGGCTCCCAAGCGTATTTGTCGCCTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAAt > 1:114081/1‑251 (MQ=255) tCAAAGGCTTTGCCTTGAATGATGAGTTTCGGCTCCCAAGCGTATTTGTCGCCTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATgg < 1:354804/247‑1 (MQ=255) tttGCCTTGAATGATGAGTTTCGGCTCCCAAGCGTTTTTGTCGCCTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGc < 1:542106/251‑1 (MQ=255) gCCTTGAATGATGAGTTTCGGCTCCCAAGCGTATTTGTCGCCTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCAcg > 1:216181/1‑251 (MQ=255) 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gCGTATTTGTCGCCTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATgg > 1:828906/1‑208 (MQ=255) gCGTATTTGTCGCCTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTAc > 1:242196/1‑250 (MQ=255) ccTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGAt > 1:112499/1‑250 (MQ=255) 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ccgtttttttGCGTTTTGGAGGGTTTATACCGGTGCCA‑GGGTTGGTTTTGGCGCGCCCACAGATCAGTTTTTTTTTTTTGCATCCCGTTTTAAAAAG‑TTTTTTAAAAAAACCCTTATTGGTAATGCAGGCGGTGGCGGGGGG‑TGTTTTGTCCGACCTCCGCCATGGAACCAAAAAAGCCCGCCCCAAAACGCCCAAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTc < 1:881860/245‑1 (MQ=255) tttttGCGTTTTGGACGGTTTATAACGGTGCCGTGGGTAGCTGTT‑GCGCGCCCACAGATCAGTTTTTTTTTTTTGCATCCCGTCTTAAAAAGATTGTTTAAAAAAC‑CCGTATTGGTAATGAAAGCCGTAGCGGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGAAATCAAAAAAGCCCGCCGCAAAACGACCAAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACAt < 1:719362/250‑1 (MQ=255) ttGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTg > 1:391241/1‑250 (MQ=255) ttGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTg > 1:649724/1‑250 (MQ=255) tgggagggtttATAAGGGTGCCAGGGGTAGTTGTT‑GCGCGCCCACAGATCAGTTTTTTTTTTTTGCATACCGTTTAAAAAAGTTTGTTAAAAAAAC‑CCGTATTGGAAATGCAAGCCGTGGCGGGTGG‑CTTTTTGCCCGAGCTCCGCCATGGAACCAAAAAAGCCCGCCGCAAAACGACCAAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTc < 1:750149/227‑1 (MQ=255) ggTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGCCCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAg > 1:445689/1‑251 (MQ=255) ggTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAAccgccg > 1:107964/1‑182 (MQ=255) ggTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAg > 1:705198/1‑251 (MQ=255) ggTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAg > 1:897954/1‑251 (MQ=255) ggTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAg > 1:496552/1‑251 (MQ=255) aTGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGACCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGtcgtcg > 1:669402/1‑251 (MQ=255) gggTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATgg > 1:85862/1‑127 (MQ=255) gggTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCgta > 1:443384/1‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) aaaataggttttttttttttgattcccGTCTTAAAAAGATT‑TTTAAAAAAACCCGTATGGGTAATGCAAGCCGGAGCGGGTGG‑CTTTTGGCCCGACCCCCCCCAGGGAACCCAAAAAGCCCCCCCCCAAAC‑CCCAAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAatt < 1:358468/226‑1 (MQ=255) gATCAGCTTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTAAAAAGATT‑TTTAAAAAAACCCGTTTTGGAAATGCAGGCCGTAGCCGGGGG‑CGTTTTGCCCGAGCCCCGCCATGGAACCCAAAAAGCCCGCCCCAAAACGCCCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCgtagta < 1:752034/232‑1 (MQ=255) ttttttttttttGCATACCGTCTAAAAAATTTTTTTAAAATAAA‑CCTTTTTGGTAATGAAAGCCGTGGCGGGGGG‑GTTTTTGCCCGGGCTCCGCCAGGGAATCAAAAAAGCACGCCCCAAAACGACCAAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTg < 1:863612/246‑1 (MQ=255) ttGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGa > 1:157450/1‑250 (MQ=255) tGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGAc > 1:273611/1‑250 (MQ=255) cATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGa > 1:241272/1‑251 (MQ=255) 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1:342964/1‑250 (MQ=255) gATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATTAAAAATTCCATGGa > 1:456889/1‑251 (MQ=255) tGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACTTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATTAAAAATTCCATGGAAAg > 1:631167/1‑251 (MQ=255) aacccGTTTTGGAAATGAACGCCGTCGCCGGTGG‑CTTTTTGCCCGAGCCCCGCCATGAAACCAAAAAAGCACCCCGCCAACCGCCCAAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATTAAAAATTCCATGGAAAGATAATTcac < 1:380047/248‑1 (MQ=255) ccGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATTaaaaa > 1:390343/1‑227 (MQ=255) ccGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATTAAAAATTCCATGGAAAGATAATTCACATg > 1:881078/1‑251 (MQ=255) ccGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATTAAAAATTCCATGGAAAGATAATTCACATg > 1:53832/1‑251 (MQ=255) ccGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATCAAAAATTCCATAGAAAGATAATTCACATg > 1:342647/1‑251 (MQ=255) gTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAg > 1:491821/1‑64 (MQ=255) gTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATg > 1:371498/1‑169 (MQ=255) tGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAAcc > 1:227488/1‑83 (MQ=255) ggCCGTAGCCGGTGG‑CTTTTTGCCCGAGCTCCGCCATGGAACCCAAAAAGCACGCCGCAAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGAc < 1:217919/200‑1 (MQ=255) aGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCTCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATTAAAAATTCCATGGAAAGATAATTCACATGGCGAc > 1:395096/1‑240 (MQ=255) cgggggggtttttGTCCGACCCCCGCCATGAAACCAAAAAACCCCGCCCCAAAACGCCCAAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATTAAAAATTCCATGGAAAGATAATTCACATGGCGACCGCTTTTTTTCGCTGCAgg < 1:730996/242‑1 (MQ=255) tCCGAGCCCCGCCAGGAAATCAAAAAACCCCGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATTAAAAATTCCATGGAAAGATAATTCACATGGCGACCGCTTTTTTTCGCTGCAGGTTTGCCATAAGcc < 1:895895/250‑1 (MQ=255) | CAAATCAAAGGCTTTGCCTTGAATGATGAGTTTCGGCTCCCAAGCGTATTTGTCGCCTTTAATCGGCGTGATTTTACCGCCGAAGCCGATATTTTGCGTTTTGGACGGGTTATAACGGTGCCATGGGTAGCTGTT‑GCGCGACCACAGATCAGCGTTTTCTTTTTGCATACCGTCTTCAAAAGATTGTTTAAATAAA‑CCGTATTGGTAATGCAAGCCGTAGCCGGTGG‑CGTTTTGTCCGAGCGCCGCCATGGAATCCAAAAAGCACGCCGCCAAACGACCTAAACCGCCGTTACCTAATGCGGGATCCCGCTCCTGTTCCAACACATCTACCAGTTCCACATCGTATTTTGCCAAATAGGCTTTAATGTCGTCGTAGTAACCGAGATTCATCAAATTATTGCCGGTGATTCGACCGATTAAAAATTCCATGGAAAGATAATTCACATGGCGACCGCTTTTTTTCGCTGCAGGTTTGCCATAAGCC > 1/966205‑966688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |