| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 948,211 | G→A | P18L (CCG→CTG) | unknown ← | 3‑deoxy‑manno‑octulosonate cytidylyltransferase (EC 2.7.7.38) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 948,211 | 0 | G | A | 96.3% | 137.7 / NA | 56 | P18L (CCG→CTG) | unknown | 3‑deoxy‑manno‑octulosonate cytidylyltransferase (EC 2.7.7.38) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base A (17/35); total (21/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.19e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ACGATAATTTCATCGTCGGGCAGCACCAGTTTTTCCACCACTTCCGCCAGGCGTTCCGTGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCGGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTCCAAACGTCCGTGACAGCTTGGGCATGCCATGATTTCTAATAATTTTCCATTCATTACGCTGCTCTCG > 1/947977‑948457 | aCGATAATTTCATCGTCGGGCAGCACCAGTTTTTCCACCACTTCCGCCAGGCGTTCCGTGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAgg < 1:276103/250‑1 (MQ=255)aCGATAATTTCATCGTCGGGCAGCACCAGTTTTTCCACCACTTCCGCCAGGCGTTCCGTGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGc < 1:82033/251‑1 (MQ=255) tcgtcgGGCAGCACCAGTTTTTCCACCACTTCCGCCAGGCGTTCCGTGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAAATCGTTATCGGGGGGGATAATGACGCGGGCGGCACCGGGTTGTTTGGCTTGTTTTAAAAAGTGTTGAATCAACGGCTTGGCGGCAATATC‑GGGTAA‑GGGGTGGCCCCGTAAAGGGCG‑GGAGGCGGAAcggggggg > 1:245738/1‑251 (MQ=255) caCCAGTTTTTCCACCACTTCCGCCAGGCGTTCCGTGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑c < 1:541812/249‑1 (MQ=255) ttttCCACCACTTCCGCCAGGCGTTCCGTGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATtg < 1:241221/251‑1 (MQ=255) tCCACCACTTCCGCCAGGCGTTCCGTGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTgtgt < 1:270342/251‑1 (MQ=255) cacTTCCGCCAGGCGTTCCGTGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCatat < 1:183609/251‑1 (MQ=255) ccGCCAGGCGTTCCGTGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATattaatt < 1:197226/251‑1 (MQ=255) gTGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCCATTCGTTTTCGGGGGCGGTAATGACGCGGGCGGCACCGGGTTGTTTTGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCCATATC‑GGCTAAGGGGTTTGCCCGG‑AAACGGCTGGGGGGGGAAAGGGGGGGGAAGGA‑CA‑CGGGGGATTGTGGCATATTTATTATTCTGTTCTTGAt > 1:293855/1‑251 (MQ=255) tGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGAt < 1:566682/250‑1 (MQ=255) aaTTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACgg < 1:78674/251‑1 (MQ=255) gTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTgtgt < 1:851137/213‑1 (MQ=255) gTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTgcgc < 1:314531/250‑1 (MQ=255) gTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTTTATGTGGCGATAATGACGCTGGCGGCACCCGGTTGTTTTGCTTGTTTATAAAAGTGTTGAATCATCCGCTTCCCCGCCATATCGGGTTAG‑GGGTTTTCCCGTTAA‑CGGCT‑GGCGGCGTCACGGGCGGGAATGATTACCGGGGAATT‑TGTCATATTTATTTTTCTGTTTTTTATTTTACGGCTGCGCCTGTTc > 1:806394/1‑246 (MQ=255) gctcacTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCGCCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATattaatt < 1:882109/205‑1 (MQ=255) gCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATcc < 1:630611/212‑1 (MQ=255) cTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGGGGGGGTAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTTGCTTGTTTAAAAAAGTGTTGAATTATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGGTTGCCCCGTAAACGGCT‑GGGGGGGGAAAGGGCGGGGATGATCA‑CGGGGAATTGTGTTATATTTATTATTCCGTTCTTTGTTTAAAGGCTGCGccccgtctctttttaaaatct > 1:317945/1‑231 (MQ=255) ttCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTTGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTc < 1:444454/221‑1 (MQ=255) ttCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGc < 1:174577/241‑1 (MQ=255) ccaccaATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAAt < 1:818281/158‑1 (MQ=255) caccaATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGcc < 1:129590/200‑1 (MQ=255) caATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACggg > 1:504468/1‑217 (MQ=255) cGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACg < 1:60621/251‑1 (MQ=255) cGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACg < 1:761323/251‑1 (MQ=255) aTAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATtg < 1:102378/137‑1 (MQ=255) aTAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAAt > 1:585816/1‑213 (MQ=255) aTAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGtt > 1:638867/1‑251 (MQ=255) 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cACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCG‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCAGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGt < 1:590503/250‑1 (MQ=255) aCCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTAt > 1:262111/1‑251 (MQ=255) gATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTcc < 1:511271/250‑1 (MQ=255) aTTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTCCaa < 1:47215/251‑1 (MQ=255) tGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAAt < 1:747688/189‑1 (MQ=255) tGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTCCaaa > 1:714062/1‑250 (MQ=255) gTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCg < 1:388688/73‑1 (MQ=255) tGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTCCAAACGTcc < 1:701453/251‑1 (MQ=255) tGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTCCAAACGTCCGTGAc < 1:714175/251‑1 (MQ=255) aaCGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTCCAAACGTCCGTGACAGCTTggg < 1:391171/251‑1 (MQ=255) 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ggCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTCCAAACGTCCGTGACAGCTTGGGCATGCCATGATTTCTAATAATTTTCcattcatt > 1:869895/1‑251 (MQ=255) gCTAA‑GGGTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTCCAAACGTCCGTGACAGCTTGGGCATGCCATGATTTCTAATAATTTTCCATTCATTa > 1:188706/1‑251 (MQ=255) gggTTTGCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTCCAAACGTc < 1:651399/198‑1 (MQ=255) gCCCAGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTCCAAACGTCCGTGACAGCTTGGGCATGCCATGATTTCTAATAATTTTCCATTCATTACGCTGCTCTCg > 1:487792/1‑251 (MQ=255) | ACGATAATTTCATCGTCGGGCAGCACCAGTTTTTCCACCACTTCCGCCAGGCGTTCCGTGCCGGAATTGTGGTTTTTGGCAGTCATGCACACTTCCGCCCCGAAATTTCTTGCGGCGGTTGCCACCAATTCGTTATCGGTGGCGATAATGACGCGGTCGGCACCGGATTGTTTGGCTTGTTCAAAAACGTGTTGAATCATCGGCTTGCCGGCAATATC‑GGCTAA‑GGGTTTGCCCGGTAAGCGGCT‑GGAGGCGTAACGGGCGGGAATGATCA‑CGGTGAATTGTGTCATATTAATTATCCTGTTCTTGATTTAACGGCTGCGCCTGTTCCGCCGGTAATACGGGAATGCCGTTCTTAATCGGGTAAGCGATTTTTTCAAAACGACAGATTAAACGTTGATGTTGTTCATCGTATTCCAAACGTCCGTGACAGCTTGGGCATGCCATGATTTCTAATAATTTTCCATTCATTACGCTGCTCTCG > 1/947977‑948457 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |