| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 933,504 | G→A | intergenic (‑207/+41) | unknown ← / ← unknown | Tyrosyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.1)/Sugar fermentation stimulation protein SfsA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 933,504 | 0 | G | A | 98.4% | 165.3 / ‑7.3 | 63 | intergenic (‑207/+41) | unknown/unknown | Tyrosyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.1)/Sugar fermentation stimulation protein SfsA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (26/36); minor base C (0/1); total (26/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTATTCATATCAGTCATGTTACTTCCTAATGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGATCTAAATGATAATTGTTCTCAAGTATGAAGTCAAGCGCCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATTAAAACCATCATGTAGCCCACAGAAGAAAATCA > 1/933281‑933744 | gTATTCATATCAGTCATGTTACTTCCTAATGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCaaataaa > 1:575121/1‑251 (MQ=255) ttCATATCAGTCATGTTACTTCCTAATGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTGGTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAACTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATgg < 1:190374/251‑1 (MQ=255) cATATCAGTCATGTTACTTCCTAATGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCg > 1:539890/1‑251 (MQ=255) tCCTAATGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCg > 1:718078/1‑249 (MQ=255) tCCTAATGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCg > 1:274875/1‑249 (MQ=255) aTGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATgg < 1:184211/226‑1 (MQ=255) aTGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGC‑AAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAAc < 1:858216/251‑1 (MQ=255) ttACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACtt < 1:879198/251‑1 (MQ=255) cAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAAcc < 1:12097/228‑1 (MQ=255) ggCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAAt > 1:621514/1‑251 (MQ=255) gCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATg > 1:569859/1‑183 (MQ=255) aCATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAg > 1:197214/1‑251 (MQ=255) ttATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTg > 1:113189/1‑250 (MQ=255) gagaTTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTgg > 1:543538/1‑251 (MQ=255) tttttttACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAAc < 1:896748/251‑1 (MQ=255) ttttttACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGc < 1:446309/222‑1 (MQ=255) ttttttACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCaaa > 1:42697/1‑249 (MQ=255) cggcAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTTAATAATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTATCCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCa < 1:549718/250‑1 (MQ=255) cggcAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCCCCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGAATCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCa < 1:48657/250‑1 (MQ=255) cggcAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCa < 1:375896/250‑1 (MQ=255) aaaTTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAACGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGc < 1:429910/251‑1 (MQ=255) aaTTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCt < 1:710562/251‑1 (MQ=255) aTTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAAc < 1:660777/175‑1 (MQ=255) ggggAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGt < 1:548910/250‑1 (MQ=255) ggCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCa > 1:673662/1‑251 (MQ=255) cTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATc < 1:259192/251‑1 (MQ=255) aTGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAAc < 1:740635/183‑1 (MQ=255) aTGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTgg > 1:680064/1‑250 (MQ=255) aTGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTgg > 1:520209/1‑250 (MQ=255) aTGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTgg > 1:417453/1‑250 (MQ=255) aTGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTgg > 1:316178/1‑250 (MQ=255) ttGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCAt < 1:666858/250‑1 (MQ=255) tGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAAtg < 1:125564/249‑1 (MQ=255) gATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCacac > 1:745302/1‑201 (MQ=255) aTTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTgg < 1:558320/149‑1 (MQ=255) tCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGc < 1:807274/251‑1 (MQ=255) cTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAg < 1:182580/205‑1 (MQ=255) cTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCg > 1:722331/1‑251 (MQ=255) gtCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACttt < 1:165195/104‑1 (MQ=255) gtCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTaa > 1:402960/2‑201 (MQ=255) gtCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCt < 1:411152/212‑1 (MQ=255) gtCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATc < 1:254528/218‑1 (MQ=255) gtCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATCaaaa > 1:865825/2‑250 (MQ=255) gtCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATCaaaa > 1:744554/2‑250 (MQ=255) gtCTAAATGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCC‑TGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGcc < 1:809221/188‑1 (MQ=255) aaaTGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAAtg > 1:872040/1‑219 (MQ=255) aaaTGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATCAAAACcat > 1:605822/1‑250 (MQ=255) aaTGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTa < 1:685618/110‑1 (MQ=255) aaTGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCt > 1:168262/1‑164 (MQ=255) tGATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATCAAAACCATCATg > 1:200161/1‑251 (MQ=255) gATAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAAc < 1:356965/86‑1 (MQ=255) aTAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATCAAAACCATCATGt < 1:519303/250‑1 (MQ=255) aTAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATCAAAACCATCATGt < 1:116262/250‑1 (MQ=255) aTAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATCAAAACCATCATGt < 1:619460/250‑1 (MQ=255) aTAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATCAAAACCATCATGt < 1:482238/250‑1 (MQ=255) aTAATTGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTGAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATCAAAACCATCATGt < 1:453041/250‑1 (MQ=255) ttGTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGc < 1:408702/155‑1 (MQ=255) gTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCcac < 1:465651/159‑1 (MQ=255) gTTCTCAAATATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTATTTCAGCGCCTGATGAAGt > 1:622817/1‑184 (MQ=255) caaatATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTg < 1:28979/95‑1 (MQ=255) caaatATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATCAAAACCATCATGTAGCCCACagaag < 1:640332/247‑1 (MQ=255) atATGAAGTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTtgtg < 1:675633/113‑1 (MQ=255) gTCAAGCACCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATCAAAACCATCATGTAGCCCACAGAAGAAAATCa > 1:405791/1‑248 (MQ=255) | GTATTCATATCAGTCATGTTACTTCCTAATGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGATCTAAATGATAATTGTTCTCAAGTATGAAGTCAAGCGCCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCGATTTGGAAATGATTAAAACCATCATGTAGCCCACAGAAGAAAATCA > 1/933281‑933744 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |