| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 933,467 | A→G | intergenic (‑170/+78) | unknown ← / ← unknown | Tyrosyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.1)/Sugar fermentation stimulation protein SfsA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 933,467 | 0 | A | G | 100.0% | 163.0 / NA | 58 | intergenic (‑170/+78) | unknown/unknown | Tyrosyl‑tRNA synthetase (EC 6.1.1.1)/Sugar fermentation stimulation protein SfsA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (26/32); total (26/32) | |||||||||||
ATTAAATCCTGTTCGGAAAGAATTTCATCTACACCGCGCTTTAGTTCTGCGAGAACGGTATTCATATCAGTCATGTTACTTCCTAATGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGATCTAAATGATAATTGTTCTCAAGTATGAAGTCAAGCGCCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCG > 1/933224‑933698 | aTTAAATCCTGTTCGGAAAGAATTTCATCTACACCGCGCTTTAGTTCTGCGAGAACGGTATTCATATCAGTCATGTTACTTCCTAATGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGGTCTAAAt > 1:763663/1‑251 (MQ=255) 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ATTAAATCCTGTTCGGAAAGAATTTCATCTACACCGCGCTTTAGTTCTGCGAGAACGGTATTCATATCAGTCATGTTACTTCCTAATGTTATTCAATTACAGAAAGGCTACATTATAGAGATTATTCGACAAATTTGAATTTTTTTTACCCCGGGGCGGCAAATTTCAGGCAAAAAAAACGCCTCTTTTGTGGGGGAGGAGGCGCTAAATGTTGGAGTGATTATCTATTTTATTGTTTGAATGATCTAAATGATAATTGTTCTCAAGTATGAAGTCAAGCGCCTTAATGAAAATAATTATCAAATAAATGGCGATTCAAACTTAACCCGCTTTAAACGGTGCCACTTTAGTTAAATTAAGTGCGGTGGGAATGCCTTGTGTTTTTTCAAACTCAGCGGCATAAGCATAGGCTTCCACACCTTCTTTCAGCGCCTGATGAAGTAATTCGTCATATCTGGCATCAATGTGTTTGGCG > 1/933224‑933698 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |