| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 930,652 | C→A | A162E (GCA→GAA) | unknown → | tRNA pseudouridine(55) synthase (EC 5.4.99.25) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 930,652 | 0 | C | A | 100.0% | 235.0 / NA | 86 | A162E (GCA→GAA) | unknown | tRNA pseudouridine(55) synthase (EC 5.4.99.25) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (38/48); total (38/48) | |||||||||||
CAAAGTTGGGCGAGCGCACCGATACCTCCGATGCGGAAGGGCAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGCATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTGTTACCGATGGATACCGCCGTAGCGAA > 1/930406‑930898 | cAAAGGTGGGGGGGCGCAACGATTCCTCCGATGCGGAAGGGGAGGTGGTGGAAACCCGGCCGATTTACGTAAAAACCCCTGAAATTTTGGCCCCCCTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTTGAAGTTCCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCCAGCCCCTTTATGAATATGCCCGGGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATAc < 1:829730/251‑1 (MQ=255) cgcACCGATACCTCCGATGCGGAAGGGCAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTAt < 1:516349/249‑1 (MQ=255) cACCGATACCTCCGATGCGGAAGGGCAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATAc > 1:792002/1‑235 (MQ=255) aCCGATACCTCCGATGCGGAAGGGCAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAAc < 1:411133/251‑1 (MQ=255) ccGATACCTCCGATGCGGAAGGGCAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAAcc < 1:679765/251‑1 (MQ=255) aTACCTCCGATGCGGAAGGGCAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCt > 1:714696/1‑250 (MQ=255) ccTCCGATGCGGAAGGGCAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATAc < 1:874159/227‑1 (MQ=255) cTCCGATGCGGAAGGGCAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTCCGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAg > 1:451399/1‑251 (MQ=255) aTGCGGAAGGGCAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCAc < 1:609619/251‑1 (MQ=255) ggCAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCaaa > 1:651519/1‑251 (MQ=255) cAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTCACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGTCCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAg < 1:418072/250‑1 (MQ=255) tggAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTAc < 1:753568/251‑1 (MQ=255) cgATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAgg < 1:522969/232‑1 (MQ=255) cacCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAgg > 1:687567/1‑250 (MQ=255) cccTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAATGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTTTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCg < 1:423345/250‑1 (MQ=255) acCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCg < 1:416998/251‑1 (MQ=255) aTTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACt < 1:712532/199‑1 (MQ=255) tgtccACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAGCGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAgg < 1:854471/202‑1 (MQ=255) tGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGc < 1:516647/251‑1 (MQ=255) cacTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAAcc > 1:186621/1‑176 (MQ=255) cacTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTc < 1:147183/193‑1 (MQ=255) cacTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAg < 1:42640/198‑1 (MQ=255) cacTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGc > 1:562478/1‑245 (MQ=255) cTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATAc > 1:198402/1‑156 (MQ=255) tttCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCa > 1:683075/1‑250 (MQ=255) atatTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGt < 1:473036/251‑1 (MQ=255) atTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTtggtgg < 1:12616/199‑1 (MQ=255) gCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAAcc < 1:29783/148‑1 (MQ=255) aGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCGCTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCg > 1:449526/1‑203 (MQ=255) gTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATAc > 1:868660/1‑126 (MQ=255) gTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTtgg < 1:58220/187‑1 (MQ=255) ccGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTCCAt > 1:446196/1‑173 (MQ=255) cGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCg < 1:422575/251‑1 (MQ=255) gACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAgg > 1:324731/1‑162 (MQ=255) aCCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTtggtgg < 1:694601/184‑1 (MQ=255) tGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAg > 1:660371/1‑156 (MQ=255) gTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATAc < 1:418147/115‑1 (MQ=255) gTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCg > 1:206433/1‑191 (MQ=255) gCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCAc > 1:706297/1‑144 (MQ=255) cGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTAc < 1:806064/150‑1 (MQ=255) cGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGtt > 1:628000/1‑251 (MQ=255) cccTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGgacgac < 1:418130/251‑1 (MQ=255) ccTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGgacga > 1:272766/1‑249 (MQ=255) cTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACtt > 1:360747/1‑251 (MQ=255) tttATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAAc < 1:697165/100‑1 (MQ=255) tttATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAgg < 1:378983/124‑1 (MQ=255) tttATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGt < 1:183153/197‑1 (MQ=255) gAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACAt > 1:501021/1‑128 (MQ=255) gAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGt < 1:134763/192‑1 (MQ=255) gAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAg > 1:9331/1‑250 (MQ=255) gAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAg > 1:204255/1‑250 (MQ=255) cccGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGAc > 1:769228/1‑211 (MQ=255) gTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGt > 1:596662/1‑182 (MQ=255) tGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGaac < 1:753738/251‑1 (MQ=255) gTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGc < 1:716564/241‑1 (MQ=255) gTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAAcaacaa > 1:773787/1‑251 (MQ=255) cGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTg > 1:849039/1‑214 (MQ=255) gTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAg > 1:641952/1‑94 (MQ=255) ggAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGga < 1:40778/213‑1 (MQ=255) ggAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGc > 1:58356/1‑231 (MQ=255) ggAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGc < 1:420915/249‑1 (MQ=255) gAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCgg < 1:115100/250‑1 (MQ=255) gAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCgg < 1:815037/250‑1 (MQ=255) aaGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGAt < 1:453130/251‑1 (MQ=255) aaGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGAt < 1:261823/251‑1 (MQ=255) gcgcgcCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGcc > 1:18981/1‑216 (MQ=255) gcgcgcCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATg > 1:879751/1‑250 (MQ=255) cgcgcCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGc < 1:84974/250‑1 (MQ=255) cgcgcCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGc < 1:761739/250‑1 (MQ=255) cgcCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCAc < 1:1204/250‑1 (MQ=255) ccccATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCgg > 1:750049/1‑218 (MQ=255) ccATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCCCTTACATTCGGACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTg < 1:844409/251‑1 (MQ=255) ccATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTAc < 1:570755/91‑1 (MQ=255) ccATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTg > 1:420734/1‑251 (MQ=255) tACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTGTTAc < 1:337984/251‑1 (MQ=255) gaattgaaCTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGACGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGTAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACCTTTGTTACCGATGGATa > 1:384818/1‑250 (MQ=255) ttgaaCTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTGTTACCGATGGATAccgc < 1:683438/251‑1 (MQ=255) tgaaCTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTGTTACCGATGGATAccgcc < 1:480075/251‑1 (MQ=255) cTTTATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTGTTACCGATGGATACCGCCGTAg < 1:861811/251‑1 (MQ=255) ttATTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACtt < 1:210956/224‑1 (MQ=255) aTTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGGCGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTGTTACCGATGGATACCGCCGTAGCGaa > 1:450899/1‑251 (MQ=255) aTTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGAt > 1:625601/1‑201 (MQ=255) aTTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCgg < 1:830835/208‑1 (MQ=255) aTTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTGTTACCGATGGATACCGCCGTAGCGaa > 1:873007/1‑251 (MQ=255) aTTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTGTTACCGATGGATACCGCCGTAGCGaa > 1:503872/1‑251 (MQ=255) aTTGAATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCACACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTGTTACCGATGGATACCGCCGTAGCGaa > 1:594/1‑251 (MQ=255) | CAAAGTTGGGCGAGCGCACCGATACCTCCGATGCGGAAGGGCAGGTGGTGGAAACCCGCCCGATTAACGTAAAAACACCTGAAATTTTGACCACACTTGAGGCTTTTCGTGGCGATATTTTGCAAGTACCGACCATGTTTTCCGCCTTGAAGCATAACGGCAAGCCCCTTTATGAATATGCCCGTGCCGGTATTACGGTGGAACGGGAAGCGCGCCCCATTACGATCTTTGAATTGAACTTTATTGCATACCACGCGCCGTATTTAACCCTCGAAGTGCACTGTTCCAAAGGCACTTACATTCGTACCTTGGTGGATGATTTAGGCGAAGTCCTTGGCTGTGGCGCGCACGTCACCATGCTACGTCGCACGGCAGTGGCGGATTACCCGACGGAAAAAATGATGAGTTGGGACGACTTACAAGCCTTGGCGGAACAACAAGATTTAGCGGTGTTGGATGCACTTTTGTTACCGATGGATACCGCCGTAGCGAA > 1/930406‑930898 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |