| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 925,658 | T→C | I670T (ATC→ACC) | unknown → | Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 925,658 | 0 | T | C | 100.0% | 117.8 / NA | 44 | I670T (ATC→ACC) | unknown | Type III restriction‑modification system methylation subunit (EC 2.1.1.72) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (24/20); total (24/20) | |||||||||||
TTCCCCATCTTATGAAAAAGAAGAATATGAGCCAGAGAAGCCTTGGAATATCATTAATTTAAATTTTAATGTTGGCACTAATGAAAATGCTAGTGCAGAATTAGATCATATGTTTTATCAGAATTTTTCTGATAAGCGTTATCCCAAACCAGTTTCTTTAATGAAATATATTTTGAATTTTAATTTAAATGTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAATCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGAGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGAAGATACCTTGAACAATCTTGAATTACGCA > 1/925425‑925900 | ttCCCCATCTTATGAAAAAGAAGAATATGAGCCAGAGAAGCCTTGGAATATCATTAATTTAAATTTTAATGTTGGCACTAATGAAAATGCTAGTGCAGAATTAGATCATATGTTTTATCAGAATTTTTCTGATAAGCGTTATCCCAAACCAGTTTCTTTAATGAAATATATTTTGAATTTTAATTTAAATGTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTa < 1:122161/251‑1 (MQ=255)ttCCCCATCTTATGAAAAAGAAGAATATGAGCCAGAGAAGCCTTGGAATATCATTAATTTAAATTTTAATGTTGGCACTAATGAAAATGCTAGTGCAGAATTAGATCATATGTTTTATCAGAATTTTTCTGATAAGCGTTATCCCAAACCAGTTTCTTTAATGAAATATATTTTGAATTTTAATTTAAATGTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTa > 1:297098/1‑251 (MQ=255) cccATCTTATGAAAAAGAAGAATATGAGCCAGAGAAGCCTTGGAATATCATTAATTTAAATTTTAATGTTGGCACTAATGAAAATGCTAGTGCAGAATTAGATCATATGTTTTATCAGAATTTTTCTGATAAGCGTTATCCCAAACCAGTTTCTTTAATGAAATATATTTTGAATTTTAATTTAAATGTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAAcc < 1:204035/251‑1 (MQ=255) cccATCTTATGAAAAAGAAGAATATGAGCCAGAGAAGCCTTGGAATATCATTAATTTAAATTTTAATGTTGGCACTAATGAAAATGCTAGTGCAGAATTAGATCATATGTTTTATCAGAATTTTTCTGATAAGCGTTATCCCAAACCAGTTTCTTTAATGAAATATATTTTGAATTTTAATTTAAATGTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAAcc < 1:534752/251‑1 (MQ=255) aaaaaGAAGAATATGAGCCAGAGAAGCCTTGGAATATCATTAATTTAAATTTTAATGTTGGCACTAATGAAAATGCTAGTGCAGAATTAGATCATATGTTTTATCAGAATTTTTCTGATAAGCGTTATCCCAAACCAGTTTCTTTAATGAAATATATTTTGAATTTTAATTTAAATGTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAAc > 1:560416/1‑245 (MQ=255) aGCCAGAGAAGCCTTGGAATATCATTAATTTAAATTTTAATGTTGGCACTAATGAAAATGCTAGTGCAGAATTAGATCATATGTTTTATCAGAATTTTTCTGATAAGCGTTATCCCAAACCAGTTTCTTTAATGAAATATATTTTGAATTTTAATTTAAATGTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCg > 1:309718/1‑250 (MQ=255) ccTTGGAATATCATTAATTTAAATTTTAATGTTGGCACTAATGAAAATGCTAGTGCAGAATTAGATCATATGTTTTATCAGAATTTTTCTGATAAGCGTTATCCCAAACCAGTTTCTTTAATGAAATATATTTTGAATTTTAATTTAAATGTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATc < 1:847917/249‑1 (MQ=255) 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atTTTGAATTTTAATTTAAATGTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAAt > 1:141002/1‑234 (MQ=255) gTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTAttt < 1:261791/122‑1 (MQ=255) gTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAg > 1:516200/1‑251 (MQ=255) gTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGAGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAg > 1:229103/1‑251 (MQ=255) gTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCt < 1:603598/94‑1 (MQ=255) gTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTACAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGaa > 1:97241/1‑251 (MQ=255) gTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAg > 1:53319/1‑186 (MQ=255) gTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGaa > 1:65354/1‑251 (MQ=255) 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aTTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGaa > 1:632876/1‑221 (MQ=255) ttCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGAAGATAc > 1:498317/1‑250 (MQ=255) cTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGAAg > 1:793200/1‑244 (MQ=255) actTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGAAGATACCTTGAACAAt > 1:706546/1‑251 (MQ=255) actTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGAAGATACCTTGAACAAt > 1:723507/1‑251 (MQ=255) actTCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGAAGATACCTTGAACAAt > 1:817720/1‑251 (MQ=255) tCGCAGGTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTgg < 1:440410/81‑1 (MQ=255) gTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGAAGATACCTTGAACAATCTTGAAt < 1:380936/249‑1 (MQ=255) gTAGCGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGAAGATACCTTGAACAATCTTGAAt < 1:426130/249‑1 (MQ=255) cGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGt < 1:418323/183‑1 (MQ=255) cGGCACAACCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGGGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGAAGATACCTTGAACAATCTTGAATTACGCa > 1:899077/1‑251 (MQ=255) | TTCCCCATCTTATGAAAAAGAAGAATATGAGCCAGAGAAGCCTTGGAATATCATTAATTTAAATTTTAATGTTGGCACTAATGAAAATGCTAGTGCAGAATTAGATCATATGTTTTATCAGAATTTTTCTGATAAGCGTTATCCCAAACCAGTTTCTTTAATGAAATATATTTTGAATTTTAATTTAAATGTAGAAAGTCTTATTCTTGACTACTTCGCAGGTAGCGGCACAATCGCCCACGCTGTAATTAACCTCAACCTTGAAGATAACGGCAATCGCAAATATATCCTTGTGGAACAAGGGGAGTATTTCGATACGGTGTTAAAACCTCGCGTACAAAAAGTGATTTTTAGCGAAAAATGGAAAGAGGGGAAGCCAGAAGCGGGAGAAAATGGTTTGAATGGCGTATCGCAAATTGTGAAAGTGTTGAAGTTGGAAAGCTATGAAGATACCTTGAACAATCTTGAATTACGCA > 1/925425‑925900 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |