| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 916,497 | T→G | I16L (ATT→CTT) | unknown ← | mRNA interferase YafQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 916,497 | 0 | T | G | 100.0% | 149.2 / NA | 56 | I16L (ATT→CTT) | unknown | mRNA interferase YafQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (31/25); total (31/25) | |||||||||||
CTCTAATATGTAATGGATATGAATTTTATTTAAACACTTCCGAGTGAGAATTTAGCCTTGCAAAATAGAGGGTGTCTGCTTCTATTTTGTAAATTAAAATGAGATCATTTTTGATGTGGCAATCTCGAAATCCCTGCCAATTTCCTTGCAAAGCATGATCTTTATATCGTTCGGGTAGGGATTTTTGATTGAACAGGCAATATAAAACCTCTGCATATTCCGGACCGGATTGAATTTCGACCGGAATTTTTTTTAAGTCCCGTTTATATTCTTTTGATAAAACGTAATCCATGAAAATCCTTTTTATTTGCTTAAATCACGAATTTTTTGTTGAAATTCATCAAAGGAATCTACGCTAAATCTTTCCCCTTTTCCGCTCATTAATTCATTGATTGCATTAGCTGTTTTTGTATTCGGCTGATAATCCAAACTGAGCGGAATTGTGTTGGTTTTGGCAATTTGGGTCAAAAACATATTTAACACCTGAGCGGG > 1/916251‑916742 | ctctAATATGTAATGGATATGAATTTTATTTAAACACTTCCGAGTGAGAATTTAGCCTTGCAAAATAGAGGGTGTCTGCTTCTATTTTGTAAATTAAAATGAGATCATTTTTGATGTGGCAATCTCGAAATCCCTGCCAATTTCCTTGCAAAGCATGATCTTTATATCGTTCGGGTAGGGATTTTTGATTGAACAGGCAATATAAAACCTCTGCATATTCCGGACCGGATTGAATTTCGACCGGAAgtttt > 1:534543/1‑251 (MQ=255) 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tGAATTTCGACCGGAAGTTTTTTTAAGTCCCGTTTATATTCTTTTGATAAAACGTAATCCATGAAAATCCTTTTTATTTGCTTAAATCACGAATTTTTTGTTGAAATTCATCAAAGGAATCTACGCTAAATCTTTCCCCTTTTCCGCTCATTAATTCATTGATTGCATTAGCTGTTTTTGTATTCGGCTGATAATCCAAACTGAGCGGAATTGTGTTGGTTTTGGCAATTTGGGTCAAAAACATATTTAac < 1:854412/251‑1 (MQ=255) aaTTTCGACCGGAAGTTTTTTTAAGTCCCGTTTATATTCTTTTGATAAAACGTAATCCATGAAAATCCTTTTTATTTGCTTAAATCACGAATTTTTTGTTGAAATTCATCAAAGGAATCTACGCTAAATCTTTCCCCTTTTCCGCTCATTAATTCATTGATTGCATTAGCTGTTTTTGTATTCGGCTGATAATCCAAACTGAGCGGAATTGTGTTGGTTTTGGCAATTTGGGTCAAAAACATATTTAacac < 1:223877/251‑1 (MQ=255) aTTTCGACCGGAAGTTTTTTTAAGTCCCGTTTATATTCTTTTGATAAAACGTAATCCATGAAAATCCTTTTTATTTGCTTAAATCACGAATTTTTTGTTGAAATTCATCAAAGGAATCTACGCTAAATCTTTCCCCTTTTCCGCTCATTAATTCATTGATTGCATTAGCTGTTTTTGTATTCGGCTGATAATCCAAACTGAGCGGAATTGTGTTGGTTTTGGCAATTTGGGTCAAAAACATATTTAACAcc < 1:623164/251‑1 (MQ=255) tCGACCGGAAGTTTTTTTAAGTCCCGTTTATATTCTTTTGATAAAACGTAATCCATGAAAATCCTTTTTATTTGCTTAAATCACGAATTTTTTGTTGAAATTCATCAAAGGAATCTACGCTAAATCTTTCCCCTTTTCCGCTCATTAATTCATTGATTGCATTAGCTGTTTTTGTATTCGGCTGATAATCCAAACTGAGCGGAATTGTGTTGG‑TTTGGCAATTTGGGTCAAAAACATATTTAACACCTGAg < 1:342427/251‑1 (MQ=255) cGGAAGTTTTTTTAAGTCCCGTTTATATTCTTTTGATAAAACGTAATCCATGAAAATCCTTTTTATTTGCTTAAATCACGAATTTTTTGTTGAAATTCATCAAAGGAATCTACGCTAAATCTTTCCCCTTTTCCGCTCATTAATTCATTGATTGCATTAGCTGTTTTTGTATTCGGCTGATAATCCAAACTGAGCGGAATTGTGTTGGTTTTGGCAATTTGGGTCAAAAACATATTTAACACCTGAGCggg < 1:106818/251‑1 (MQ=255) | CTCTAATATGTAATGGATATGAATTTTATTTAAACACTTCCGAGTGAGAATTTAGCCTTGCAAAATAGAGGGTGTCTGCTTCTATTTTGTAAATTAAAATGAGATCATTTTTGATGTGGCAATCTCGAAATCCCTGCCAATTTCCTTGCAAAGCATGATCTTTATATCGTTCGGGTAGGGATTTTTGATTGAACAGGCAATATAAAACCTCTGCATATTCCGGACCGGATTGAATTTCGACCGGAATTTTTTTTAAGTCCCGTTTATATTCTTTTGATAAAACGTAATCCATGAAAATCCTTTTTATTTGCTTAAATCACGAATTTTTTGTTGAAATTCATCAAAGGAATCTACGCTAAATCTTTCCCCTTTTCCGCTCATTAATTCATTGATTGCATTAGCTGTTTTTGTATTCGGCTGATAATCCAAACTGAGCGGAATTGTGTTGGTTTTGGCAATTTGGGTCAAAAACATATTTAACACCTGAGCGGG > 1/916251‑916742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |