| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.37e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.27e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAGCCCGAGTGGTGGAATCGGTAGACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGCCTTTCGAGGCGTGCCAGTTCAAGTCTGGCCTCGGGCACCATTTAATAATACCTTTCTTATTAAATAGTTACCCTCCAAAGAAAAATGCACACGGGTCGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTGGTCGAAGGTTCGAATCCTTCACGACCCACCA‑‑AAAAGTTAAAGCTC‑CGGACCGGTTGCCCAAAGTCGATACTCCTTAACGTTAATCTTCTGTTAAGTGAGTAAAATATGTGCATTAACCACACTTCTAAAAAACCTTACATTATTACAATCGCCTGTACCAAAGGTGGTTCTGCCAAAAGCACTAATGCTGCTAATATCGGTGCATTTTGTGCAGACCATGGTTTAAGAACCTTACTGATTGATACAGATACACATTGATGACCATTATTAGATAAGCC > 1/1333242‑1333735 | gTCGCGAGTTCGAGCCTCGTTTCCCGCTCCAAGCCCGAGTGGTGGAATCGGTAGACACAAGGGATTTAAAATCCCTCGCCTTTCGAGGCGTGCCAGTTCAAGTCTGGCCTCGGGCACCATTTAATAATACCTTTCTTATTAAATAGTTACCCTCCGA‑‑AAAAATGCACACGGGTCGTTAGCTCAGTCGGTAGAGCAGCGGACTTTTAATCCGTTGGTCGAAGGTTCGAATCCTTCACGACCCACCa‑‑agaaaa > 1:119881/1‑246 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |