| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | 1 | 630,474 | 0 | T | G | 49.2% | 56.4 / 24.9 | 66 | L54V (TTG→GTG) | unknown | N‑acetylmannosamine‑6‑phosphate 2‑epimerase (EC 5.1.3.9) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (5/28); new base G (32/0); total (38/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.39e-13 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
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tGTCGCTGCTATGGCGCAGGCTTCCGTTATCGGC‑GGGGCGGCGGGGTTGCGC‑ATTGAAGGTGTGGAC‑AATTTAAAAGCCGTG‑C‑GCCCGACCGTAAATGTGCCGATCATCGGTATCGTCAAACGGGATC‑TTCCCGACAGCCCGGTACGTATCACCCCGTTTTTACA‑GGACATTGAAGACTTGGCGCACGCCGGAGCGGACATTATCGCCGTGGATGGCACTCGTCGCCCGCGCCCGGTAGAGATTGAAAGTg < 1:214982/251‑1 (MQ=255) ctgctATGGCGCAGGCTTCCGTTATCGGC‑GGGGCGGCGGGGTTGCGC‑ATTGAAGGTGTGGAC‑AATTTAAAAGCCGTG‑C‑GCCCGACCGTAAATGTGCCGATCATCGGTATCGTCAAACGGGATC‑TTCCCGACAGCCCGGTACGTAt < 1:826715/145‑1 (MQ=255) ctgctATGGCGCAGGCTTCCGTTATCGGC‑GGGGCGGCGGGGTTGCGC‑ATTGAAGGTGGGGGC‑AAATTAAAAACCCTG‑C‑GCCCCACCGGAAATGTGCCGATCATCGGTATCGTCAAACGGGGTC‑TTCCCCACCGCCCCGGACGGATCACCCCCGTTTTACA‑GGACATTGAAGACTTGGCGCACGCCCGAGCGGGCATTATCGCCCTGGGTGGCCCTCCTCGCCCCCCCCCCGGAGAGATTggaaaggcgggt > 1:724703/1‑240 (MQ=255) 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GAATGTCTCCATTGACTAGAATGACTGCCAAATGCAGCCGCAAAAAAGAGGAGTTTCTATGTCACAGCTATCTCAAAAATTATCTCATCAAGCCGTTTTCGCCCAACTTCAGAACGGATTAATTGCCTCTTGTCAGCCGGTGGATGATGGTCCGATGGATAAACCGGAAATTGTCGCTGCTATGGCGCAGGCTTCCGTTATCGGC‑GGGGCGGCGGGGTTGCGC‑ATTGAAGGTGTGGAC‑AATTTAAAAGCCGTG‑C‑GCCCGACCGTAAATGTGCCGATCATCGGTATCGTCAAACGGGATC‑TTCCCGACAGCCCGGTACGTATCACCCCGTTTTTACA‑GGACATTGAAGACTTGGCGCACGCCGGAGCGGACATTATCGCCGTGGATGGCACTCGTCGCCCGCGCCCGGTAGAGATTGAAAGTGCGGTTAAAAAAATTCATG > 1/630257‑630696 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |