| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 501184 | 501848 | 665 | 26 [25] | [25] 28 | [unknown]–[unknown] | [unknown],[unknown] |
GTAAAACTGATATTTTAAAATTCTACAATTTTATTAATTATTCAGCAAACCCACCTAAATTAAAACAATCAATTAATATAAGCTCTCCTAAAATAATTTGGTTTATTCCTGATTTTGGGATAGGTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTTTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTACTGCCTTAGGAAGTGTTTATTCTTTT > 1/501612‑502066 | gTAAAACTGATATTTTAAAATTCTACAATTTTATTAATTATTCAGCAAACCCACCTAAATTAAAACAATCAATTAATATAAGCTCTCCTAAAATAATTTGGTTTATTCCTGATTTTGGGATAGGTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATc < 1:444918/250‑1 (MQ=255) taattaTTCAGCAAACCCACCTAAATTAAAACAATCAATTAATATAAGCTCTCCTAAAATAATTTGGTTTATTCCTGATTTTGGGATAGGTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTAGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTa > 1:428894/1‑251 (MQ=255) cACCTAAATTAAAACAATCAATTAATATAAGCTCTCCTAAAATAATTTGGTTTATTCCTGATTTTGGGATAGGTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGAct > 1:146932/1‑249 (MQ=255) aTTCCTGATTTTGGGATAGGTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAAc < 1:764324/251‑1 (MQ=255) ggTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGtaaataa > 1:755922/1‑251 (MQ=255) gTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGtaaata > 1:157868/1‑249 (MQ=255) gTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGtaaat > 1:13734/1‑248 (MQ=255) cTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTtaataa > 1:377040/1‑237 (MQ=255) cTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGa < 1:803332/248‑1 (MQ=255) aTGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACtt < 1:517808/251‑1 (MQ=255) atatTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATAtttt < 1:118012/251‑1 (MQ=255) attcaGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGa > 1:237614/1‑235 (MQ=255) gATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAAc < 1:604464/232‑1 (MQ=255) gATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTACTGCCTTAgg > 1:21204/1‑251 (MQ=255) atatTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGt > 1:375223/1‑178 (MQ=255) ttACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGaa < 1:142108/202‑1 (MQ=255) aCTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACtt < 1:12680/209‑1 (MQ=255) aCTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTACTGc > 1:861251/1‑239 (MQ=255) cTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGActc < 1:141510/106‑1 (MQ=255) gTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGat > 1:644134/1‑132 (MQ=255) gTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGaa > 1:201816/1‑197 (MQ=255) gTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTACTGCCTTAGGAAGTGTTTa > 1:34799/1‑251 (MQ=255) gTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTACTGCCTTAGGAAGTGTTTATTCtttt > 1:229391/1‑251 (MQ=255) tCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGat < 1:304707/123‑1 (MQ=255) gATCAAAGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCatat < 1:20901/130‑1 (MQ=255) aaGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGAttt > 1:809914/1‑70 (MQ=255) aaGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGt < 1:123466/130‑1 (MQ=255) aaGACATACTATCGAAACATTTCTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTAc < 1:477416/193‑1 (MQ=255) | GTAAAACTGATATTTTAAAATTCTACAATTTTATTAATTATTCAGCAAACCCACCTAAATTAAAACAATCAATTAATATAAGCTCTCCTAAAATAATTTGGTTTATTCCTGATTTTGGGATAGGTTCTGGAGGGCACCTTAATATCTTTAGAATGATTTATAATTTAGAAAAATTAGATATTCATTCAGATATTACTGTATGTGGTTCTAGCCAGTGGGGAACAGAGGAAGTGATCAAAGACATACTATCGAAACATTTTTTTCCTTTGAATTCTAGAATTTTTATTCTAGAAGATGACTCTGATTTTGAACAATTAACAAGCTATGATATTGCTATGGCGACTTCTTGGCAAACAGCATATTATGTAAATAAATTTAATAATTGCTATAAGAAAGCATACTTTGTGCAAGATTACGAACCATATTTTACTGCCTTAGGAAGTGTTTATTCTTTT > 1/501612‑502066 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |