| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 153,447 | Δ39 bp | coding (368‑406/957 nt) | unknown ← | Type I restriction‑modification system, restriction subunit R (EC 3.1.21.3) |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 153447 | 153485 | 39 | 122 [0] | [0] 123 | unknown | Type I restriction‑modification system, restriction subunit R (EC 3.1.21.3) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 153446 | 0 (0.000) | 120 (1.460) | 73/420 | 0.0 | 100% | coding (407/957 nt) | unknown | Type I restriction‑modification system, restriction subunit R (EC 3.1.21.3) |
| ? | 1 | 153486 = | 0 (0.000) | coding (367/957 nt) | unknown | Type I restriction‑modification system, restriction subunit R (EC 3.1.21.3) | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GGCATCAAGAATTTCTGCCACGCTTAAATTGTGGTTGTGATATTGGTTTAAGGCTTCTTGCAAACGTTGCTCAAAATCTTTTTGGGCGGTGAGATTGCGAGCGGCTTTGGCTTTGATTTCCTGTTTTAAATAACGCTCCATCGCCAAAACCCACAAACTTTTGGTTTCGCTCTCTTTAATCGCCTGCAAGAAGTCGTCTGAAAGCAAATTAATCTGCGTTTGTTCTTTGCCGAGCAGTTCAAACAAATCAATTGTGCCTTCAGAAACAATGCTTTGATTGATTAGGGTTTTAAGCTGAATCAGGCGTTCTTTGCCACCTGTGCCGTTTTGTTCTCGTTTGGCAAGCACGGCGCGCACCGCATCATAAAAGGCGATTTCTTGGCTGTACGCTTCGGCTTCTTTTAACGCACCACACAAGGCATAACCTTTTTTCAGGCTTGCCACCGCTTTTAAAAAGGCTTTTCTGCGCGGCTCGGGATCATTTGAATTTTGCCATTGT > 1/153238‑153736 | ccctaaacgttcggaaaaatcgcgtcccatttgcaccaaggcatcaagaatttctgccacgcttaaattgtggttgtgatattggtttaaggcttcttgcaaacgttgctcaaaatctttttgggcggtgagattgcgagcggctttggctttgatttcctgttttaaataacgctccatcgccaaaacccacaaacttttggtttcgctctctttaatcgcctgcaagaagtcgtctgaaagcaaatCaa > 1:252394‑M2/249‑251 (MQ=255)ccctaaacgttcggaaaaatcgcgtcccatttgcaccaaggcatcaagaatttctgccacgcttaaattgtggttgtgatattggtttaaggcttcttgcaaacgttgctcaaaatctttttgggcggtgagattgcgagcggctttggctttgatttcctgttttaaataacgctccatcgccaaaacccacaaacttttggtttcgctctctttaatcgcctgcaagaagtcgtctgaaagcaaatCaa > 1:286644‑M2/249‑251 (MQ=255)ccctaaacgttcggaaaaatcgcgtcccatttgcaccaaggcatcaagaatttctgccacgcttaaattgtggttgtgatattggtttaaggcttcttgcaaacgttgctcaaaatctttttgggcggtgagattgcgagcggctttggctttgatttcctgttttaaataacgctccatcgccaaaacccacaaacttttggtttcgctctctttaatcgcctgcaagaagtcgtctgaaagcaaatCaa > 1:367521‑M2/249‑251 (MQ=255)ccctaaacgttcggaaaaatcgcgtcccatttgcaccaaggcatcaagaatttctgccacgcttaaattgtggttgtgatattggtttaaggcttcttgcaaacgttgctcaaaatctttttgggcggtgagattgcgagcggctttggctttgatttcctgttttaaataacgctccatcgccaaaacccacaaacttttggtttcgctctctttaatcgcctgcaagaagtcgtctgaaagcaaatCaa > 1:415044‑M2/249‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |