| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1339584 | 1341033 | 1450 | 27 [25] | [0] 90 | unknown–[unknown] | unknown,unknown,[unknown] |
AACTCTTTCTTGAAGATGAGTTTGCCCATTTTTTGATTTAGCTTGATTTAACATATTTTCTCCAACGCGCGCGGATTGTAATAATGATCTATCTTGGAATCATACAACAAAATTGCCAAAAGGTAAAAGGCCCAAGGGAGCCCTATCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTCCCAAGGGAAAGGTCTTACCTAAAAAGGTCAAAAGGCCTTTTCAAAAGGCTGGAACTACACTCACTATATTTGTTCGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATGTCCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAACAGTTCCCCTTACTAAAACATGAAGCAACTATAATGTTTTCTATTTTTCATAAAATGCTAAGTAAAAAAAGTAATACCGAATCCCTTGGTATTTCTACCCAGCCAACACTGTCGGTGATTGATAATGATGGTTGGATCAGCCCATTATCTGCGGTGGAATTATTAAAAAGTGAATTACGCCAAAAATACTTAAATCTA > 1/1339321‑1339832 | taCTCTTTCTTGAAAGTGAGTTTGCTCATTTTTTAATTTAGCTTGATTTAACATATTTTCTCCAA‑‑‑‑CACGGAT‑‑‑‑CTA‑‑CA‑‑TACCTTGAAATCATACAACAAAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATg < 1:353378/250‑1 (MQ=255) ctccaacacggatctacatacctTGAAATCATACAACAAAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTc > 1:397000/22‑231 (MQ=255) ctccaacacggatctacatacctTGAAATCATACAACAAAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTaaat > 1:690409/22‑243 (MQ=255) gatctacatacctTGAAATCATACAACAAAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATg < 1:792599/171‑1 (MQ=255) gatctacatacctTGAAATCATACAACAAAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTaaat < 1:604511/223‑2 (MQ=255) gatctacatacctTGAAATCATACAACAAAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTaag < 1:626096/239‑2 (MQ=255) tacatacctTGAAATCATACAACAAAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTaagatatg > 1:541017/8‑245 (MQ=255) acatacctTGAAATCATACAACAAAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTaaataac < 1:197498/226‑5 (MQ=255) atacctTGAAATCATACAACAAAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAg < 1:190343/247‑1 (MQ=255) ctTGAAATCATACAACAAAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAAc < 1:360243/251‑1 (MQ=255) aaTCATACAACAAAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAACtatgt < 1:210347/251‑3 (MQ=255) caacaaAACCGCAAAAAGGTAAAAGGAACAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAACtatgttttccat < 1:234863/251‑10 (MQ=255) aggaacAAGGGAGCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAACT‑‑‑ATGTTTTCCATTTTTCATAAAATCCTAAGTaaaa > 1:416088/6‑251 (MQ=255) gCCCTAGCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTaaataacaccccttacta < 1:63624/190‑16 (MQ=255) ctagcGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTaag < 1:572970/185‑2 (MQ=255) agcGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAACT‑‑‑ATGTTTTCCATTTTTCATAAAATCCTAAGTAAAAAATCTAATAc < 1:98711/242‑1 (MQ=255) gCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACCCCCCTTACTAAGATATGAAGCAACT‑‑‑ATGTTTTCCATTTTTCATAAAATCCTAAGTAAAAAATCTAATACCGAATCCTTTga > 1:442552/1‑250 (MQ=255) gggTAAAATTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAACT‑‑‑ATGTTTTCCATTTTTCATAAAATCCTAAGTAAAAAATCTAATACCGAATCCTTTGATAtta > 1:131650/1‑250 (MQ=255) aaTTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGc < 1:737542/145‑1 (MQ=255) aaTTTAAGGATAACCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAACT‑‑‑ATGTTTTCCATTTTTCATAAAATCCTAAGTAAAAAATCTAATACCGAATCCTTTGATATTACTatcc < 1:839919/251‑4 (MQ=255) aaCCTTTCCAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCAc > 1:65838/1‑123 (MQ=255) tccAAGGGAAAGGTCTTACCTGAAAAGGCCAAAAGGCTTTTTCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAACT‑‑‑ATGTTTTCCATTTTTCATAAAATCCTAAGTAAAAAATCTAATACCGAATCCTTTGATATTACTATCCAACCGACACtaccaatg < 1:787157/250‑8 (MQ=255) tttCAAAAGGCAGGAACAACCCGCACCATATTTATCTGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTc > 1:774784/1‑86 (MQ=255) caccatatttatctgTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAACT‑‑‑ATGTTTTCCATTTTTCATAAAATCCTAAGTAAAAAATCTAATACCGAATCCTTTGATATTACTATCCAACCGACACTACCAATGATTGATAATGATGGTTGGATAAGcc > 1:250942/15‑214 (MQ=255) gTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAACT‑‑‑ATGTTTTCCATTTTTCATAAAATCCTAAGTAAAAAATCTAATACCGAATCCTTTGATATTACTATCCAACCGACACTACCAATGATTGATAatgatg < 1:78501/188‑1 (MQ=255) tttttAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAACT‑‑‑ATGTTTTCCATTTTTCATAAAATCCTAAGTAAAAAATCTAATACCGAATCCTTTGATATTACTATCCAACCGACACTACCAATGATTGATAATGATGGTTGGATAAGCCCATTGCCCGCAGTAGAACTACTAAAAAGTGAATTACGTCAAAAATatctgaa > 1:123167/1‑245 (MQ=255) aaTGATCACTTATTTGTTGTTTTGATATTCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAATAACACCCCTTACTAAGATATGAAGCAACT‑‑‑ATGTTTTCCATTTTTCATAAAATCCTAAGTAAAAAATCTAATACCGAATCCTTTGATATTACTATCCAACCGACACTACCAATGATTGATAATGATGGTTGGATAAGCCCATTGCCCGCAGTAGAACTACTAAAAAGTGAATTACGTCAAAAATatctgaatgta > 1:331442/1‑240 (MQ=255) | AACTCTTTCTTGAAGATGAGTTTGCCCATTTTTTGATTTAGCTTGATTTAACATATTTTCTCCAACGCGCGCGGATTGTAATAATGATCTATCTTGGAATCATACAACAAAATTGCCAAAAGGTAAAAGGCCCAAGGGAGCCCTATCGGGCTAAGGGTAAAATTTAAGGATAACCTTCCCAAGGGAAAGGTCTTACCTAAAAAGGTCAAAAGGCCTTTTCAAAAGGCTGGAACTACACTCACTATATTTGTTCGTTTTTAATGATCACTTATTTGTTGTTTTGATGTCCATCACTTGTATTCTGCAACATTAAACAGTTCCCCTTACTAAAACATGAAGCAACTATAATGTTTTCTATTTTTCATAAAATGCTAAGTAAAAAAAGTAATACCGAATCCCTTGGTATTTCTACCCAGCCAACACTGTCGGTGATTGATAATGATGGTTGGATCAGCCCATTATCTGCGGTGGAATTATTAAAAAGTGAATTACGCCAAAAATACTTAAATCTA > 1/1339321‑1339832 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |