| New junction evidence | |||||||||||
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AAGCAACGAATGGAATTCGTCAATAATCAGCATTTTCACCTTGTACTCACGGAATAAGTGAATCGTCTGATAACGCAATTTAGCTACGCTATCCGTTGGTCGATATGGAACATAAAAACGCTCCAGTAACGAGATATAAAGCTCTTTTTCATTTGCACTCGGCGGTGCTTCTGCCAAAATAATGGGGCGTATACCGTCCGACTGGCTGTCCACGAAAGGTATGCCGTACAAATCATAAAAGTGTCGAATACACAACATTACAATTAAAACGCCAAAACGAAAGAACATCATCAAAATTGATCAAGTTGCCTATTATCGTTACGAAAATAGGGATTATTTTTTACCACAGGACATTTATAAGCATATAACCTAGAGTTTTTGACTTGAAAAATATCATTTTTGCGATCTGAATCACAAAATTACTTCCTAAACCTATATAGAGAGAAAATTACCGATAAGCTAATCTCTATTATTAGCACATAAATAG > 3/79374‑79860 | cccaacacaagaccaactaaaccagtatcttgtggaaaaatcaggtcaaacggcagctataacaggctttatcaatcatttaaaatcggagtaccaccgagagcttgaaatcgaccgtaaactgattcagcaaattagagctaaacagcttaaaaaacattgttctcagcgattaattgaactctataaacaagcttatttaactgaaaaagaacaaatggagctagtttccgttgtgttatatagtttac < 1:887351‑M2/1‑1 (MQ=255) 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1:391395‑M2/40‑227 (MQ=255) caaatggagctagtttccgttgtgttatatagtttaCACAACATTACAATTAAAACGCCAAAACGAAAGAACATCATCAAAATTGATCAAGTTGCCTATTATCGTTACGAAAATAGGGATTATTTTTTACCACAGGACATTta < 1:372479‑M2/107‑1 (MQ=255) ctagtttccgttgtgttatatagtttaCACAACATTACAATTAAAACGCCAAAACGAAAGAACATCATCAAAATTGATCAAGTTGCCTATTATCGTTACGAAAATAGGGATTATTTTTTACCACAGGACATTTATAAGCATATAACCTAGAGTTTTTGACTTGAAAAATATCATTTTTGCGATCTGAATCACAAAATTACTTCCTAAACCTATATAGAGAGAAAATTACCGATAAGCTAATCTCtattat < 1:169729‑M2/223‑1 (MQ=255) ccgttgtgttatatagtttaCACAACATTACAATTAAAACGCCAAAACGAAAGAACATCATCAAAATTGATCAAGTTGCCTATTATCGTTACGAAAATAGGGATTATTTTTTACCACAGGAc > 1:102285‑M2/21‑122 (MQ=255) ccgttgtgttatatagtttaCACAACATTACAATTAAAACGCCAAAACGAAAGAACATCATCAAAATTGATCAAGTTGCCTATTATCGTTACGAAAATAGGGATTATTTTTTACCACAGGACATTTATAAGCATATAACCTAGAGTTTTTGACTTGAAAAATATCATTTTTGCGATCTGAATCACAAAATTACTTCCTAAACCtatat < 1:632436‑M2/188‑1 (MQ=255) gtgttatatagtttaCACAACATTACAATTAAAACGCCAAAACGAAAGAACATCATCAAAATTGATCAAGTTGCCTATTATCGTTACGAAAATAGGGATTATTTTTTAcc > 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AAGCAACGAATGGAATTCGTCAATAATCAGCATTTTCACCTTGTACTCACGGAATAAGTGAATCGTCTGATAACGCAATTTAGCTACGCTATCCGTTGGTCGATATGGAACATAAAAACGCTCCAGTAACGAGATATAAAGCTCTTTTTCATTTGCACTCGGCGGTGCTTCTGCCAAAATAATGGGGCGTATACCGTCCGACTGGCTGTCCACGAAAGGTATGCCGTACAAATCATAAAAGTGTCGAATACACAACATTACAATTAAAACGCCAAAACGAAAGAACATCATCAAAATTGATCAAGTTGCCTATTATCGTTACGAAAATAGGGATTATTTTTTACCACAGGACATTTATAAGCATATAACCTAGAGTTTTTGACTTGAAAAATATCATTTTTGCGATCTGAATCACAAAATTACTTCCTAAACCTATATAGAGAGAAAATTACCGATAAGCTAATCTCTATTATTAGCACATAAATAG > 3/79374‑79860 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |