| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 2 | 47,976 | (AAAAT)1→2 | coding (97/156 nt) | unknown ← | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | 2 | = 47968 | 0 (0.000) | 100 (0.940) +AATAA |
69/404 | 0.1 | 100% | coding (105/156 nt) | unknown | hypothetical protein |
| ? | 2 | 47969 = | 0 (0.000) | coding (104/156 nt) | unknown | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
ATTGCCGATATTGAAAAACTGATGGCGGACACGTGCGCTTAATTGAACCAAAATTCAAGTTTTCAGCCCGAATGCGTATTGGTGTTTTTACCTTTAGAACAGGAAATTTCACAATATTAACATATCCGGCTTTGGTTTCGGTGAATATCGTTATTTGCGTTATTACGAAGGCAAAGTGGGAGTGGCTAAAATGTTGTTACTGATGCAGGTATTCAGTGGCGATCATCGGGCTTGGCTTGTCGGCAACGAATAAAATGGGGCTGCGAAAAGAGCAACTGATTAAACAGGTGTTAGGGCTGTAGAAATGACGCCTTAAAAAACACTCGGAAAAACAACCGCACTTTTTCCGCATTCATTGCAAAAAATCCTCTTCTCACCGAACCTGAACATGGATTTCAGCTTGCTTTTTATGCGAAAAAGAGTAAAATCCACAGGCTTTTTGTCTATATATACAGAGAAAAAAGTAAGTTTAACTCTCATTTAACTTTCGATATTTGA > 2/47721‑48218 | ccgatattgaaaaactgatggcggacacgtgcgcttaattgaaccaaaattcaagttttcagcccgaatgcgtattggtgtttttacctttagaacaggaaatttcacaatattaacaatccggctttggtttcggtgaatatcgttatttgcgttattacgaaggcaaagtgggagtggctaaaatgttgttactgatgcaggtattcagtggcgatcatcgggcttggcttgtcggcaacgaataaaat < 1:316979‑M2/3‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |