| New junction evidence | |||||||||||
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(MQ=255) attaaccagtaagaacgccaggtttgccgctcggtcagcggaatatggcaattttcttcagaaagaatcggaatctgcggcgtaagtgcggtcagtttttccgttaaaaattggctgacgaataaatcCGCTTCGGTCACCGGTGTGTTGTCTTCTTTCATTCGAACTGTCACCGAACGTTGATAAAAGCAACGTAAATGCTCACCCGCCTGTTGGGCGATCTCTATTACATCCTGCAATAAATGGGTCGt > 1:886782‑M2/129‑251 (MQ=255) attaaccagtaagaacgccaggtttgccgctcggtcagcggaatatggcaattttcttcagaaagaatcggaatctgcggcgtaagtgcggtcagtttttccgttaaaaattggctgacgaataaatcCGCTTCGGTCACCGGTGTGTTGTCTTCTTTCATTCGAACTGTCACCGAACGTTGATAAAAGCAACGTAAATGCTCACCCGCCTGTTGGGCGATCTCTATTACATCCTGCAATAAATGGGTCGt > 1:782477‑M2/129‑251 (MQ=255) aaccagtaagaacgccaggtttgccgctcggtcagcggaatatggcaattttcttcagaaagaatcggaatctgcggcgtaagtgcggtcagtttttccgttaaaaattggctgacgaataaatcCGCTTCGGTCACCGGTGTGTTGTCTTCTTTCATTCGAACTGTCACCGaa > 1:17603‑M2/126‑174 (MQ=255) 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1:663557‑M2/102‑1 (MQ=255) gcggaatatggcaattttcttcagaaagaatcggaatctgcggcgtaagtgcggtcagtttttccgttaaaaattggctgacgaataaatcCGCTTCGGTCACCGGTGTGTTGTCTTCTTTCATTCGAACTGTCACCGAACGTTGATAAAAGCAACGTAAATGCTCACCCGCCTGTTGGGCGATCTCTATTACATCCTGCAATaa < 1:476240‑M2/114‑1 (MQ=255) gaatatggcaattttcttcagaaagaatcggaatctgcggcgtaagtgcggtcagtttttccgttaaaaattggctgacgaataaatcCGCTTCGGTCACCGGTGTGTTGTCTTCTTTCATTCGAACTGTCACCGAACGTTGATAAAAGCAACGTAAATGCTCACCCGCCTGTTGGGCGATCTCTATTACATCCTGCAATAAATGGGTCGTGAGGATTGGCATAGTTTTCCCTCCTATGTTc < 1:124332‑M2/154‑1 (MQ=255) gaatatggcaattttcttcagaaagaatcggaatctgcggcgtaagtgcggtcagtttttccgttaaaaattggctgacgaataaatcCGCTTCGGTCACCGGTGTGTTGTCTTCTTTCATTCGAACTGTCACCGAACGTTGATAAAAGCAACGTAAATGCTCACCCGCCTGTTGGGCGATCTCTATTACATCCTGCAATAAATGGGTCGTGAGGATTGGCATAGTTTTCCCTCCTATGTTCACAATCTTa > 1:395301‑M2/89‑251 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGCTTCGGTCACCGGTGTGTTGTCTTCTTTCATTCGAACTGTCACCGAACGTTGATAAAAGCAACGTAAATGCTCACCCGCCTGTTGGGCGATCTCTATTACATCCTGCAATAAATGGGTCGTGAGGATTGGCATAGTTTTCCCTCCTATGTTCACAATCTTAGTTCGCCGTTTATCTGGTTTGCGGTAACAACAAAGGCAAGACAAGAACTGAATACAACGCCATGCCGAAACTCAGTAAAAACG > 4/1‑246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |