| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,198,858 | Δ45 bp | coding (685‑729/870 nt) | unknown ← | Formyltetrahydrofolate deformylase (EC 3.5.1.10) |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1198858 | 1198902 | 45 | 57 [0] | [0] 55 | unknown | Formyltetrahydrofolate deformylase (EC 3.5.1.10) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1198857 | 0 (0.000) | 55 (0.680) | 36/416 | 1.1 | 100% | coding (730/870 nt) | unknown | Formyltetrahydrofolate deformylase (EC 3.5.1.10) |
| ? | 1 | 1198903 = | 0 (0.000) | coding (684/870 nt) | unknown | Formyltetrahydrofolate deformylase (EC 3.5.1.10) | |||||
AAAAAACCCGTCTTCATACATACTGAAGATGGTTTGAAAGAATCACAACCAAAGTGCGGTCTATAAAACAATCGTTTTGTTCTTATACACAAAAATACGATCATGTAACGCAAGATCCAGTGCACGGCTTAATACTGTTTTTTCCACGTCTCGTCCGGCTTTCATCATGGCTTCCACACTATAGGTGTGATCAATATTAATCACATTCTGCATAATAATCGGACCTTGATCTAATTCGTTATTAATAAAATGCGCCGTCGCACCGATAATTTTTACACCGCGCTCATAAGCCTGCTGATAAGGTTTTGCGCCGATAAATGCAGGCAAAAACGAATGGTGAATGTTAATCACCCGATTAGGATAACGCGCTACAAATTTCGGATTTAAGACCCGCATATATTTTGCCAACACAATATAATCCGGTGCCAATTCGTCAATTTTTTCGGCTAACAAATAATCATGTTCTTCACGGGTTAAATT > 1/1198657‑1199136 | atattaaggctggcatttcgcttttcaagcccgaatatcataaataaaaaacccgtcttcatacatactgaagatggtttgaaagaatcacaaccaaagtgcggtctataaaacaatcgttttgttcttatacacaaaaatacgatcatgtaacgcaagatccagtgcacggcttaatactgttttttccacgtctcgtccggctttcatcatggcttccacactataggtgtgatcaatattaataa > 1:665664‑M2/247‑248 (MQ=255)atattaaggctggcatttcgcttttcaagcccgaatatcataaataaaaaacccgtcttcatacatactgaagatggtttgaaagaatcacaaccaaagtgcggtctataaaacaatcgttttgttcttatacacaaaaatacgatcatgtaacgcaagatccagtgcacggcttaatactgttttttccacgtctcgtccggctttcatcatggcttccacactataggtgtgatcaatattaatAAAAt > 1:538468‑M2/247‑251 (MQ=255)atattaaggctggcatttcgcttttcaagcccgaatatcataaataaaaaacccgtcttcatacatactgaagatggtttgaaagaatcacaaccaaagtgcggtctataaaacaatcgttttgttcttatacacaaaaatacgatcatgtaacgcaagatccagtgcacggcttaatactgttttttccacgtctcgtccggctttcatcatggcttccacactataggtgtgatcaatattaatAAAAt > 1:562114‑M2/247‑251 (MQ=255)atattaaggctggcatttcgcttttcaagcccgaatatcataaataaaaaacccgtcttcatacatactgaagatggtttgaaagaatcacaaccaaagtgcggtctataaaacaatcgttttgttcttatacacaaaaatacgataatgaaacgcaagatccagtgcacggcttaatactgttttttccacgtctcgtccggctttcatcatggcttccacactataggtgtgatcaatattaatAAAAt > 1:687356‑M2/247‑251 (MQ=255) 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1:641459‑M2/103‑1 (MQ=255) tgcggtctataaaacaatcgttttgttcttatacacaaaaatacgatcatgtaacgcaagatccagtgcacggcttaatactgttttttccacgtctcgtccggctttcatcatggcatccacactataggtgtgatcaatattaatAAAATGCGCCGTCGCACCGATAATTTTTACACCGCGCTCATAAGCCTGCTGATAAGGTTTTGCGCCGATAAATGCAGGCAAAAACGAATGGTGAATGTTAATc < 1:109792‑M2/103‑1 (MQ=255) ctataaaacaatcgttttgttcttatacacaaaaatacgatcatgtaacgcaagatccagtgcacggcttaatactgttttttccacgtctcgtccggctttcatcatggcttccacactataggtgtgatcaatattaatAAAATGCGCCGTCGCACCGATAATTTTTacac < 1:890246‑M2/32‑1 (MQ=255) aacaatcgttttgttcttatacacaaaaatacgatcatgtaacgcaagatccagtgcacggcttaatactgttttttccacgtctcgtccggctttcatcatggcttccacactataggtgtgatcaatattaatAAAATGCGCCGTCGCACCGATAATTTTTACACCGCGCTCATAAGCCTGCTGATAAGGTTTTGCGCCGATAAATGCAGGCAAAAACGAATGGTGAATGTTAATCACCCGATTAGGAt < 1:448732‑M2/116‑1 (MQ=255) 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1:685573‑M2/24‑251 (MQ=255) tgtgatcaatattaatAAAATGCGCCGTCGCACCGATAATTTTTACACCGCGCTCATAAGCCTGCTGATAAGGTTTTGCGCCGATAAATGCAGGCAAAAACGAATGGTGAATGTTAATCACCCGATTAGGATAACGCGCTACAAATTTCGGATTTAAGACCCGCATATATTTTGCCAACACAATATAATCCGGTGCCAATTCGTCAATTTTTTCGGCTAACAAATAATCATGTTCTTCACGGGTTAAAtt < 1:608446‑M2/234‑1 (MQ=255) gatcaatattaatAAAATGCGCCGTCGCACCGATAATTTTTACACCGCGCTCATAAGcc > 1:774869‑M2/14‑59 (MQ=255) gatcaatattaatAAAATGCGCCGTCGCACCGATAATTTTTACACCGCGCTCATAAGCCTGCTGATAAGGTTTTGCGCCGATAAATGCAGGCAAAAACGAATGGTGAATGTTAATCACCCGATTAGGAt < 1:132991‑M2/116‑1 (MQ=255) | 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |