| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1067549 = | NA (NA) | 53 (0.550) | 31/430 | 1.5 | 100% | intergenic (+24/‑224) | unknown/unknown | Exodeoxyribonuclease I (EC 3.1.11.1)/hypothetical protein |
| ? | 2 | 102 = | 0 (0.000) | intergenic (‑20/+52) | unknown/unknown | hypothetical protein/Excinuclease ABC subunit A | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTCGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAGCCCTCCATTTTGGCAACCTGTTCCGGTGTGCCGGTCGCGATAATTTGTCCGCCGCCGCTGCCGCCTTCAGGGCCGAGATCTACAATCCAGTCGGCGGTTTTAATCACGTCTAAATTATGCTCAATGACCACGATGGTGTTGCCTTGATC > 2/1‑348 | ctttttcatctttggcttcactattttagggcgttgagggtttatataaggggatttttacgccattaagccctctttcacgaaaggcttttccaataaatgacttgagaacgagaaatctgatgaagtttcgccacctcacggataccaaaatcctgctcggtgacctgtttgatagtttttaaacgaaattggtaagagtaagacataatctgcacctcaaattaggtgtccGTGTCCAGGTTTTgggg < 1:744744‑M2/17‑1 (MQ=255) 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cacctcaaattaggtgtccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAGCCCTCCATTTTGGCAACCTGTTCCGGTGTGCCGGTCGCGATAATTTGTCCGCCGCCGCTGCCGCCTTCAGGGCCGAGATCTACAATCCAGTCGGCGGTTTTAATCACGTCTAAATTATGCTCAATGACCACGAt < 1:576972‑M2/232‑1 (MQ=255) cctcaaattaggtgtccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAGCCCTCCATTTTGGCAACCTGTTCCGGTGTGCCGGTCGCGATAATTTGTCCGCCGCCGCTGCCGCCTTCAGGGCCGAGATCTACAATcc < 1:420304‑M2/186‑1 (MQ=255) caaattaggtgtccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAGCCCTCCATTTTGGCAACCTGTTCCGGTGTGCCGGTCGCGATAATTTGTCCGCCGCCGCTGCCGCCTTCAGGGCCGAGATCTACAATCCAGTCGGCGGTTTTAATCACGTCTAAATTATGCTCAATGACCACGATGgtgt < 1:656721‑M2/237‑1 (MQ=255) aattaggtgtccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAg > 1:854073‑M2/13‑110 (MQ=255) 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ttaggtgtccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAGCCCTCCATTTTGGCAACCTGTTCCGGTGTGCCGGTCGCGATAATTTGTCCGCCGCCGCTGCCGCCTTCAGGGCCGAGATCTACAATCCAGTCGGCGGTTTTAATCACGTCTAAATTATGCTCAATGACCACGATGgtgt < 1:840416‑M2/237‑1 (MQ=255) tgtccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAGCCCTCCATTTTGGCAACCTGTTCCGGTGTGCCGGTCGCGATAATTTGTCCGCCGCCGCTGCCGCCTTCAGGGCCGAGATCTACAATCCAGTCGGCGGTTTTAATCACGTCTAAATTATGCTCAATGACCACGATGGTGTTGCCTTGAt < 1:477500‑M2/246‑1 (MQ=255) tgtccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAGCCCTCCATTTTGGCAACCTGTTCCGGTGTGCCGGTCGCGATAATTTGTCCGCCGCCGCTGCCGCCTTCAGGGCCGAGATCTACAATCCAGTCGGCGGTTTTAATCACGTCTAAATTATGCTCAATGACCACGATGGTGTTGCCTTGAt < 1:371620‑M2/246‑1 (MQ=255) 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tccGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGATCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAGCCCTCCATTTTGGCAACCTGTTCCGGTGTGCCGGTCGCGATAATTTGTCCGCCGCCGCTGCCGCCTTCAGGGCCGAGATCTACAATCCAGTCGGCGGTTTTAATCACGTCTAAATTATGCTCAATGACCACGATGGTGTTGCCTTGATc < 1:765984‑M2/247‑1 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GTTTCGCCACCTCACGGATACCAAAATCCTGCTCGGTGACCTGTTTGATAGTTTTTAAACGAAATTGATAAGAGTAAGACATAATCTGCACCTCAAATTAGGTGTCCAGGTTTTGGGGTGCAGAGCAAAGTGCGGTCGGAAAATGCAGCGTTTTTAGCCTTTTGCCAAAATCTCTTTGAGGAAGCGGGCGGTGTGCGAGCCCTCCATTTTGGCAACCTGTTCCGGTGTGCCGGTCGCGATAATTTGTCCGCCGCCGCTGCCGCCTTCAGGGCCGAGATCTACAATCCAGTCGGCGGTTTTAATCACGTCTAAATTATGCTCAATGACCACGATGGTGTTGCCTTGATC > 2/1‑348 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |