| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 952,131 | +AGGCGC | coding (1418/2295 nt) | unknown ← | DNA internalization‑related competence protein ComEC/Rec2 |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 952131 | 0 (0.000) | 85 (1.040) +AGGCGC |
53/418 | 0.3 | 100% | coding (1418/2295 nt) | unknown | DNA internalization‑related competence protein ComEC/Rec2 |
| ? | 1 | 952132 = | 0 (0.000) | coding (1417/2295 nt) | unknown | DNA internalization‑related competence protein ComEC/Rec2 | |||||
CTTGCCGTTGTAAATAAGGCAGAATTTCCAATTGTGCCATACTGCCGCCCTTCCAACTCGGGCCGGTATCGTAAAGCACGCCTTTGCCGTCTTTCACGATTAAAGTTGCCAACCCTTGCCCCACGTCCAAGGTTTCCAATTGCCAGTTCGGACGTGAAATAGACTGAGAAATTAACGTCAGGCAACACAGGGCAATCAGCCCACCGCCCACGCAATAAGCGCTTTTTCGTAACGGTAAACTTAGTTCCGGATTAAAATGAAATCCTTTAAAGCGGTGCTGCCTTGACAATGCTAAAGTGGATGTTATCGGTTTGGGCGGTTTATAAATAACATAGAGCGCCACTAAAAAAAGAAAGGTTAAACATAGGGTTATCCATAAACTGTGCGGAATGGAAATTGCCAACCAGTCATCCTGCCAGGGCGTCAAAAGTGCGGTGATTTTTTCCGCCAAATCGTTGGCGAGCTGCCACGAATGCCACGCACCTTGGGTG > 1/951889‑952379 | gttgtaaataaggcagaatttccaattgtgccatactgccgcccttccaactcgggccggtatcgtaaagcacgcctttgccgtctttcacgattaaagttgccaacccttgccccacgtccaaggtttccaattgccagttcggacgtgaaatagactgagaaattaacgtcaggcaacacagggcaatcagcccaccgcccacgcaataagcgctttttcgtaacggtaaacttaaggcgcGTTCCGGa > 1:12494‑M2/244‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |