| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 693781 = | 2 (0.020) | 15 (0.200) | 14/392 | 3.6 | 94.3% | coding (22/921 nt) | unknown | Glycosyl transferase, family 2 |
| ? | 1 | = 693776 | 0 (0.000) | coding (27/921 nt) | unknown | Glycosyl transferase, family 2 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
GGTATTATCTCCATCCACCAGAATATAAATGTCTGCATCAATATCTGCAAACATTCTGCGAACGACGGCACCTTTTCCTTGTTTAGGTTCATTGCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCAATTGATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTATATTCTGTGATCATGTTTCCATCTGTAATTATTTCTAATGGGCGTCCTAAATTTTGGAAATTTATCTCTTCATAACGAATTAGAGGTTTTATAAAAATAGTATTAACGCCTTTCTCTAACTCTTCTTGTGAAT > 1/693527‑693968 | ggTATTATCTCCATCCACCAGAATATAAATGTCTGCATCAATATCTGCAAACATTCTGCGAACGACGGCACCTTTTCCTTGTTTAGGTTCATTGCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCaa > 1:311433/1‑251 (MQ=255) tattatCTCCATCCACCAGAATATAAATGTCTGCATCAATATCTGCAAACATTCTGCGAACGACGGCACCTTTTCCTTGTTTAGGTTCATTGCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCAat < 1:725017/250‑1 (MQ=255) tGTCTGCATCAATATCTGCAAACATTCTGCGAACGACGGCACCTTTTCCTTGTTTAGGTTCATTGCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCAATTGATTGATTGATTGATtcattcataatt > 1:294694/1‑247 (MQ=255) gCATCAATATCTGCAAACATTCTGCGAACGACGGCACCTTTTCCTTGTTTAGGTTCATTGCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCAattgat > 1:515784/1‑222 (MQ=255) cATCAATATCTGCAAACATTCTGCGAACGACGGCACCTTTTCCTTGTTTAGGTTCATTGCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCAATTGATTGATTGATTGattcattc > 1:472238/1‑239 (MQ=255) aTTCTGCGAACGACGGCACCTTTTCCTTGTTTAGGTTCATTGCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCA‑‑‑‑ATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATAtt < 1:473543/251‑1 (MQ=255) ttCTGCGAACGACGGCACCTTTTCCTTGTTTAGGTTCATTGCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCAattgattgattgattgat > 1:324060/1‑215 (MQ=255) cGAACGACGGCACCTTTTCCTTGTTTAGGTTCATTGCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCA‑‑‑‑ATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTatat < 1:666454/250‑1 (MQ=255) cGAACGACGGCACCTTTTCCTTGTTTAGGTTCATTGCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCA‑‑‑‑ATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTatat < 1:154853/250‑1 (MQ=255) gCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCA‑‑‑‑ATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTATATTCTGTGATCATGTTTCCATCTGTAATTATTTCTAAt > 1:182360/1‑251 (MQ=255) atCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCAATTGATTGATTGATTGATtcattcataat > 1:416170/1‑171 (MQ=255) tttCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCA‑‑‑‑ATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTatat > 1:190195/1‑186 (MQ=255) ttatCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCA‑‑‑‑ATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTATATTCTGTGATCATGTTTCCATCTGTAATTATTTCTAATGGGCGTCCTAAATTTTGGAAATTTATCTCTTCATAACGAATTAGAGGTTTTATaa < 1:859374/251‑1 (MQ=255) gATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCAATTGATTGATTGATTGATtcattcataat < 1:889811/117‑4 (MQ=255) cTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCA‑‑‑‑ATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTATATTCTGTGATCATGTTTCCATCTGTAATTATTTCTAATGGGCGTCCTAAATTTTGGAAATTTATCTCTTCATAACGAATTAGAGGTTTTATAAAAATAGTATTAACGCCTTTCTCTAACTCTTCTTGTGAAt > 1:499549/1‑251 (MQ=255) agagaACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCA‑‑‑‑ATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTatat > 1:248383/1‑114 (MQ=255) gTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCA‑‑‑‑ATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTATATTCTGTGATCATg < 1:690948/118‑1 (MQ=255) aCTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCA‑‑‑‑ATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTATATTCTGTGATCATGttt > 1:365006/1‑110 (MQ=255) ggAATTAATATTGCA‑‑‑‑ATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTATATTCTGTGATCATGTTTCCATCTg > 1:395114/1‑95 (MQ=255) | GGTATTATCTCCATCCACCAGAATATAAATGTCTGCATCAATATCTGCAAACATTCTGCGAACGACGGCACCTTTTCCTTGTTTAGGTTCATTGCGTACAATACAATCTAGTTTACTTGCAATTTCAAAAGTTTTATCTGTCGAATTATTATCATAAACGTAGATTTTTGCCAAAGGCAAAGCGGATCTAAATGAGAGAACAGTATCGGATATACTATGTTCTTCATTATAACAAGGAATTAATATTGCAATTGATTGATTGATTGATTGATTCATTCATAATTTACTTAATTAAAAAATCCATATTTATATTCTGTGATCATGTTTCCATCTGTAATTATTTCTAATGGGCGTCCTAAATTTTGGAAATTTATCTCTTCATAACGAATTAGAGGTTTTATAAAAATAGTATTAACGCCTTTCTCTAACTCTTCTTGTGAAT > 1/693527‑693968 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |