| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 640,294 | +GTTAAT | coding (877/3093 nt) | unknown ← | Uncharacterized protein YdiJ |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 640289 | 0 (0.000) | 73 (0.890) +TTAATG |
53/408 | 0.3 | 100% | coding (882/3093 nt) | unknown | Uncharacterized protein YdiJ |
| ? | 1 | 640290 = | 0 (0.000) | coding (881/3093 nt) | unknown | Uncharacterized protein YdiJ | |||||
TTGATCTAATGTCGCACATAATTGAGACACTTGATTTTCAATGAGCGCCTGGTTATTGCCGGCATATTCCACTATATTTAAGCCGAGAATCGGATTTTGCTCTTCTTCTGTTAAGAGTGCTTTCACCGAGTGCCAAATAATGTCCTGCTTCGCCAGATTCAACACCTTGGAATCCACGGTTTCCACGGAAAGGGCATTGGCTTTCACCATAAACGGCGCATTACGCAACGCCGCGTCAAAGGAACTGTATTTAATTAAGGTACGATATTGCGGAATCGGCGTTAAATCCAGCACTGCTTCACAAATAAAGGCGAGGGAACCTTCCGAGCCGGTGAGAATGCGGGTTAAATTGAATTCGCTTAAATCATCGTTAAAAACATTCTTCAAATCATAACCGGTGAGAAAACGGTTCAATTGCGGTAAATCATTAATGATTTGTTCACGGTTTTCTTTGCAACGTTGGAAAATTTCCTGATGGATTTTTTTCCCGT > 1/640040‑640530 | taatgtcgcacataattgagacacttgattttcaatgagcgcctggttattgccggcatattccactatatttaagccgagaatcggattttgctcttcttctgttaagagtgctttcaccgagtgccaaataatgtcctgcttcgccagattcaacaccttggaatccacggtttccacggaaagggcattggctttcaccataaacggcgcattacgcaacgccgcgtcaaaggaactgtatttaatgt < 1:645926‑M2/1‑1 (MQ=255) gtcgcacataattgagacacttgattttcaatgagcgcctggttattgccggcatattccactatatttaagccgagaatcggattttgctcttcttctgttaagagtgctttcaccgagtgccaaataatgtcctgcttcgccagattcaacaccttggaatccacggtttccacggaaagggcattggctttcaccataaacggcgcattacgcaacgccgcgtcaaaggaactgtatttaatgt > 1:746903‑M2/247‑247 (MQ=255) acataattgagacacttgattttcaatgagcgcctggttattgccggcatattccactatatttaagccgagaatcggattttgctcttcttctgttaagagtgctttcaccgagtgccaaataatgtcctgcttcgccagattcaacaccttggaatccacggtttccacggaaagggcattggctttcaccataaacggcgcattacgcaacgccgcgtcaaaggaactgtatttaatgTTAATTAAgg > 1:581422‑M2/242‑251 (MQ=255) taattgagacacttgattttcaatgagcgcctggttattgccggcatattccactatatttaagccgagaatcggattttgctcttcttctgttaagagtgctttcaccgagtgccaaataatgtcctgcttcgccagattcaacaccttggaatccacggtttccacggaaagggcattggctttcaccataaacggcgcattacgcaacgccgcgtcaaaggaactgtatttaatgTTAATTAAGGTa > 1:77425‑M2/239‑250 (MQ=255) 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1:609582‑M2/116‑1 (MQ=255) ttacgcaacgccgcgtcaaaggaactgtatttaatgTTAATTAAGGTACGATATTGCGGAATCGGCGTTAAATCCAGCACTGCTTCACAAATAAAGGCGAGGGAACCTTCCGAGCCGGTGAGAATGCGGGTTAAATTGAATTCGCTTAAATCATCGTTAAAAACATTCTTCAAATCATAACCGGTGAGAAAACGGTTCAATTGCGGTAAATCATTAATGATTTGTTCACGGTTTTCTTTGCAACGTTGGaa > 1:686927‑M2/37‑251 (MQ=255) ttacgcaacgccgcgtcaaaggaactgtatttaatgTTAATTAAGGTACGATATTGCGGAATCGGCGTTAAATCCAGCACTGCTTCACAAATAAAGGCGAGGGAACCTTCCGAGCCGGTGAGAATGCGGGTTAAATTGAATTCGCTTAAATCATCGTTAAAAACATTCTTCAAATCATAACCGGTGAGAAAACGGTTCAATTGCGGTAAATCATTAATGATTTGTTCACGGTTTTCTTTGCAACGTTGGaa > 1:847613‑M2/37‑251 (MQ=255) acgcaacgccgcgtcaaaggaactgtatttaatgTTAATTAAGGTACGATATTGCGGAATCGGCGTTAAATCCAGCACTGCTTCACAAATAAAGGCGAGGGAACCTTCCGAGCCGGTGAGAATGCGGGTTAAATTGAATTCGCTTAAATCATCGTTAAAAACATTCTTCAAATCATAACCGGTGAGAAAACGGTTCAATTGCGGTAAATCATTAATGATTTGTTCACGGTTTTCTTTGCAACGTTGGaaaa > 1:134030‑M2/35‑251 (MQ=255) 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TTGATCTAATGTCGCACATAATTGAGACACTTGATTTTCAATGAGCGCCTGGTTATTGCCGGCATATTCCACTATATTTAAGCCGAGAATCGGATTTTGCTCTTCTTCTGTTAAGAGTGCTTTCACCGAGTGCCAAATAATGTCCTGCTTCGCCAGATTCAACACCTTGGAATCCACGGTTTCCACGGAAAGGGCATTGGCTTTCACCATAAACGGCGCATTACGCAACGCCGCGTCAAAGGAACTGTATTTAATTAAGGTACGATATTGCGGAATCGGCGTTAAATCCAGCACTGCTTCACAAATAAAGGCGAGGGAACCTTCCGAGCCGGTGAGAATGCGGGTTAAATTGAATTCGCTTAAATCATCGTTAAAAACATTCTTCAAATCATAACCGGTGAGAAAACGGTTCAATTGCGGTAAATCATTAATGATTTGTTCACGGTTTTCTTTGCAACGTTGGAAAATTTCCTGATGGATTTTTTTCCCGT > 1/640040‑640530 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |