| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 559,055 | +GTCTGCAC | coding (365/390 nt) | unknown ← | Methylglyoxal synthase (EC 4.2.3.3) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 559055 | 0 (0.000) | 93 (1.150) +GTCTGCAC |
61/414 | 0.2 | 100% | coding (365/390 nt) | unknown | Methylglyoxal synthase (EC 4.2.3.3) |
| ? | 1 | 559056 = | 0 (0.000) | coding (364/390 nt) | unknown | Methylglyoxal synthase (EC 4.2.3.3) | |||||
TTTTGGTGATTTCCCAACAGCTGCGGGTGTATGGCAAGGTGACGATCAAAACGGCGCTCATCACGGTGGCCAAAAGCCATGCCAAGGTGACGGCGAAGCCACCCAGGACAAAATTCAGAATATTTAAAACGAGTGCAAGTGTTGCGTTATTTCCGTTCATTATTTCAGTCGCTCGGTTAAATAGCCTTGGTAATCTGGAATGCGAATGTCGGCAGTTTCATTAAATAACGGAGAAGTGACTAAAAATGGCGATATTCATGGCTACCGGAATATTCCACACCGTTGCGATACGCATTAAGGCTTTGACGTCCGGATCATGGGGCACGGCATTCATCGGATCCCAAAAGAAAATCATTAAATCAATTTTGTTTTCGGCGATCAATCCGCCTAGTTGCTGATCGCCGCCCATCGGACCGCTCAATAGGTTGTTTACCGTTAAGCCCGTTTCCCGATGAATCAGATTGCCGGTCGTACCCGTGCCGTACAGGGTG > 1/558810‑559300 | atttcccaacagctgcgggtgtatggcaaggtgacgatcaaaacggcgctcatcacggtggccaaaagccatgccaaggtgacggcgaagccacccaggacaaaattcagaatatttaaaacgagtgcaagtgttgcgttatttccgttcattatttcagtcgctcggttaaatagccttggtaatctggaatgcgaatgtcggcagtttcattaaataacggagaagtgactaaaaagtctgcacTGGCg < 1:102221‑M2/5‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |