| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | 1 | 307,089 | (GGGCG)2→3 | coding (676/921 nt) | unknown ← | Oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB (TC 3.A.1.5.1) |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 307079 | 0 (0.000) | 107 (1.300) +GGGCG |
68/400 | 0.1 | 100% | coding (686/921 nt) | unknown | Oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB (TC 3.A.1.5.1) |
| ? | 1 | 307080 = | 0 (0.000) | coding (685/921 nt) | unknown | Oligopeptide ABC transporter, permease protein OppB (TC 3.A.1.5.1) | |||||
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CATGTTACTTCCTTAATAACGAATTTTCGGATCAATCACGGCGTATAAAATATCCACTACGGCGTTAAAAACGATAGTCAGTGTGCCGACCAAAATCGTGAGGCTCAATACAAGGGAATAATCGCGGTTAAGCGCGCCGTTAACGAAAAGTTTGCCCATGCCCGGTAAGCCGAATACGGTTTCGATCACCATGGAACCGGTAATAATGCCCACAAATGCCGGCCCTAAATAGGTAATCACCGGCAACAGGGCGGGGCGCAGCGCGTGCTTTAAGATAATGCGAGAGGTGGACAAGCCTTTTGCCTTGGCGGTACGAATAAAATTGGAGTGC‑AACACTTCAATCATAGAACCGCGCATAATCCGCGCAATGCCCGCCACATATCCGATGGTTAAGGATGCCACCGGCAACAGAATGTAACTCAAAGCCCCCTCATTCCAACCGCCTGCCGGCAGCCAGCCCAGAGTTATCGCAAACAACAGCACCAGTAA > 1/306832‑307320 | tacttccttaataacgaattttcggatcaatcacggcgtataaaatatccactacggcgttaaaaacgatagtcagtgtgccgaccaaaatcgtgaggctcaatacaagggaataatcgcggttaagcgcgccgttaacgaaaagtttgcccatgcccggtaagccgaatacggtttcgatcaccatggaaccggtaataatgcccacaaatgccggccctaaataggtaatcaccggcaacagggcgggg < 1:601062‑M2/3‑1 (MQ=255)tacttccttaataacgaattttcggatcaatcacggcgtataaaatatccactacggcgttaaaaacgatagtcagtgtgccgaccaaaatcgtgaggctcaatacaagggaataatcgcggttaagcgcgccgttaacgaaaagtttgcccatgcccggtaagccgaatacggtttcgatcaccatggaaccggtaataatgcccacaaatgccggccctaaataggtaatcaccggcaacagggcgggg < 1:866200‑M2/3‑1 (MQ=255) acttccttaataacgaattttcggatcaatcacggcgtataaaatatccactacggcgttaaaaacgatagtcagtgtgccgaccaaaatcgtgaggctcaatacaagggaataatcgcggttaagcgcgccgttaacgaaaagtttgcccatgcccggtaagccgaatacggtttcgatcaccatggaaccggtaataatgcccacaaatgccggccctaaataggtaatcaccggcaacagggcggggc < 1:288714‑M2/4‑1 (MQ=255) acttccttaataacgaattttcggatcaatcacggcgtataaaatatccactacggcgttaaaaacgatagtcagtgtgccgaccaaaatcgtgaggctcaatacaagggaataatcgcggttaagcgcgccgttaacgaaaagtttgcccatgcccggtaagccgaatacggtttcgatcaccatggaaccggtaataatgcccacaaatgccggccctaaataggtaatcaccggcaacagggcgggg > 1:350767‑M2/248‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |