| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | 1 | 28 = | NA (NA) | 119 (1.420) +G |
66/428 | 0.1 | 100% | intergenic (–/‑114) | –/unknown | –/Transposase, IS200 family |
| ? | 1 | 1657571 = | 0 (0.000) | intergenic (‑113/+128) | unknown/unknown | Transposase, IS200 family/CTP synthase (EC 6.3.4.2) | |||||
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CCTTAATATGCTACCTATATCCGTTCTAAGCCTTCCGTAAATGGCTTTTCTTCTATATTTCGGGGTGAAGACGATGTGATACTTACAGTTCCATTTGGTATGTGATAGACTTGAATCGTCATTGGCTTTACTTACCATTGACTTATCCTCCTATATCTTGAATTTGGGTTGTCAGCCTTATTCTTATATAGTGAGGATTTTTTATGTTGACCGCTTAAGCTCTTTGATTCCATATGCATAGCGTACGGTTTTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAACAAAAACCCGAGCCAGTCTCGGGTTTTTATTGGCATGATTCGCTAAATGGAAAAATACCCTCTATAATGACCGCACTTTTGTTTCGTTTTCAGCATCCGTTAGTCGGATCTTTTCTGATTGTCTTTTGCCGCTTTTACAAAGCCTTCAAATAACGGGTGGCCGTCGCGCGGGGTGGAGGTAAACTCCGGATGGAATTGGCAGGCGACAAACCAAGGG > 1/1657321‑1657816 | taatatgctacctatatccgttctaagccttccgtaaatggcttttcttctatatttcggggtgaagacgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtgaggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttttgt > 1:100336‑M2/251‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) ccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtgaggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatatgcatagcgtacggttttgTTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAAc > 1:285132‑M2/120‑149 (MQ=255) gacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtgaggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatatgcatagcgtacggttttgTTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAACAAAAACCCGAGCCAGTCTCGGGTTTTTATTGGCATGATTCGCTAAATGGAAAAATACCCTCta < 1:646567‑M2/93‑1 (MQ=255) gacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtgaggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatatgcatagcgtacggttttgTTTATAGCTAGACGTTGTCTAGCTATAAACAAAAACCCGAGCCAGTCTCGGGTTTTTATTGGCATGATTCGCTAAATGGAAAAATACCCTCTATAATGACCGCACTTTTGTTTCGTTTTCAGCATCCGTTAGTCGGa > 1:898334‑M2/115‑251 (MQ=255) cttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtgaggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttttgttt < 1:168468‑M2/3‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |