| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 15 | = 136 | 0 (0.000) | 68 (0.750) +T |
39/428 | 0.0 | 100% | intergenic (‑1/–) | unknown/– | Zn‑ribbon‑containing, possibly RNA‑binding protein and truncated derivatives/– |
| ? | 4 | = 47298 | 0 (0.000) | intergenic (‑95/–) | unknown/– | hypothetical protein/– | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 15/1‑136 | ctgaattaaacgtaataattcccgctgacgaaacaaaaaactttgccgcaccatggcattcgccacttcaatgcgcaaactgttttgttctatattggcaatgcgATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGTACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGgtttttgataatgcattgcc > 1:34478‑M1/106‑241 (MQ=255) 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1:53979‑M1/234‑130 (MQ=255) ccGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAAtgcattgccttgttt < 1:172124‑M1/120‑16 (MQ=255) aaCCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAAtgcattgccttgttttccgccttttcgccctaatatttatgacattgtagcgaatttccgctacaataccgacaattttttgatattgagatccttatgataatttctcacaaaagcaaacatcatttttggtcgcaactgctgcttggca > 1:564306‑M1/1‑100 (MQ=255) aCCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAAtgcattgccttgttttccgccttttcgccctaatatttatgacattgtagcgaatttccg < 1:473966‑M1/159‑61 (MQ=255) tGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAAtgcattgccttgttttccgccttttcgccctaatatttatgacattgtagcgaatttccgctacaataccgacaattttttgatattgagatccttatgataatttctcacaaaagcaaacatcatttttggtcgcaactgctgcttggcatg > 1:240425‑M1/1‑96 (MQ=255) 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‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 15/1‑136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |