| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 15 | 1 = | 0 (0.000) | 61 (0.650) | 41/430 | 0.0 | 100% | coding (135/135 nt) | unknown | Zn‑ribbon‑containing, possibly RNA‑binding protein and truncated derivatives |
| ? | 9 | 1 = | 0 (0.000) | coding (1/171 nt) | unknown | Zn‑ribbon‑containing, possibly RNA‑binding protein and truncated derivatives | |||||
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 15/1‑136 | aacgctttttgaacgtcggttctaccgacggccccgaaagggtgaacaatcaagccagccttgattgtgaatacttttaggcaccgcggcgaaattcggggttgatgtaaaaggttaattgcgtgatttccggcaaatgttgctgaattaaacgtaataattcccgctgacgaaacaaaaaactttgccgcaccatggcattcgccacttcaatgcgcaaactgttttgttctatattggcaatgcgATAc > 1:323297‑M1/248‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) cttttaggcaccgcggcgaaattcggggttgatgtaaaaggttaattgcgtgatttccggcaaatgttgctgaattaaacgtaataattcccgctgacgaaacaaaaaactttgccgcaccatggcattcgccacttcaatgcgcaaactgttttgttctatattggcaatgcgATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTg > 1:745521‑M1/175‑219 (MQ=255) cttttaggcaccgcggcgaaattcggggttgatgtaaaaggttaattgcgtgatttccggcaaatgttgctgaattaaacgtaataattcccgctgacgaaacaaaaaactttgccgcaccatggcattcgccacttcaatgcgcaaactgttttgttctatattggcaatgcgATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCa < 1:608347‑M1/77‑1 (MQ=255) cttttaggcaccgcggcgaaattcggggttgatgtaaaaggttaattgcgtgatttccggcaaatgttgctgaattaaacgtaataattcccgctgacgaaacaaaaaactttgccgcaccatggcattcgccacttcaatgcgcaaactgttttgttctatattggcaatgcgATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCa < 1:696663‑M1/77‑1 (MQ=255) 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1:801188‑M1/1‑136 (MQ=255) aTACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAAtgcattgccttgttt > 1:499854‑M1/1‑136 (MQ=255) | ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ATACAAATCCTTGAACTCGGGCGGGAAAAATCCGTTAACCTGTTGGTTTAGTTCATTTAAGCGAATGCCTTTTTGCACGATTTTTGCCAACGGAGAATCCTGTAATAATGTTTGAATATTTACCGGTTTTTGATAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 15/1‑136 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |