| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1202165 = | NA (NA) | 130 (1.300) | 81/430 | 0.0 | 100% | intergenic (+156/+439) | unknown/unknown | Na+/H+ antiporter/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| ? | 6 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑69) | –/unknown | –/Peptide deformylase (EC 3.5.1.88) | |||||
TAGTTGGTTTCACTTATTCCGGTTTACTTGGATTCATCACCACGGGTATTGTCCTCGCCTTGTTGGTGCTTATCTTTAAGAAACGTTAAATCGTGATCCAGCACACAAAATTCAAAAACCAATCCGCACGTAAAACGTGCGGTTTTTAGGCTACTCTATAAGGACCTAGTACTTCACATGCCCTTCAAAGGGCATATGAAAACCAATAGCGTACGGTTTTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGTTCGGTATGGTTTCAGGTGGTACCACCGCACTATCGCCGCCAATATTCTTTGATGACTATCCTCTCTCCTTTCCGCGCTTTCGCTTTCTTATTCCGCTCTTCGCTTCTCTCGTTCTTTCCCTT > 1/1201921‑1202401 | ttccgtaaatggcttttcttctatatttcggggtgaagacgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACaaaa < 1:423367‑M1/32‑1 (MQ=255) cttctatatttcggggtgaagacgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTca < 1:697884‑M1/48‑1 (MQ=255) ctatatttcggggtgaagacgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATc > 1:431610‑M1/200‑251 (MQ=255) ctatatttcggggtgaagacgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATc > 1:383538‑M1/200‑251 (MQ=255) tatttcggggtgaagacgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAgg > 1:750447‑M1/197‑251 (MQ=255) agacgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAgg < 1:605527‑M1/68‑1 (MQ=255) acgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcttatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGc > 1:447879‑M1/182‑250 (MQ=255) acgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGc > 1:707975‑M1/182‑250 (MQ=255) cgatgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATc > 1:839331‑M1/181‑232 (MQ=255) atgtgatacttacagttccatttggtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATc > 1:864807‑M1/179‑230 (MQ=255) catttggtatgtgatagacttgaatcgtcagtggctttacttaccattgacttatccgcctgtatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGGCAACGTCTGGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCCCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGGCCTACTCTcaca > 1:300667‑M1/161‑251 (MQ=255) gtatgtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGa < 1:320201‑M1/97‑1 (MQ=255) gtgatagacttgaatcgtcattggctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGAcc > 1:255498‑M1/151‑231 (MQ=255) 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gctttacttaccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTActc > 1:385083‑M1/128‑213 (MQ=255) taccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCAc > 1:586531‑M1/120‑251 (MQ=255) ccattgacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCacac < 1:408285‑M1/107‑1 (MQ=255) gacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACgg < 1:228500‑M1/124‑1 (MQ=255) gacttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAg < 1:595064‑M1/139‑1 (MQ=255) cttatcctcctatatcttgaatttgggttgtcagccttattcttatatagtggggattttttatgttgaccgcttaagctctttgattccatacgcatagcgtacggttgTTATAGCTAGACAACGTCTAGCTATAACAAAAAGCCCCGATGCTCTCACATCAGGGCTCCCTATCAGGCTTGGCGGTGACCTACTCTCACATGGGGATGCCCCACACTACCATCGGCATTACGGCCTTTCACTTCTGAGtt < 1:530600‑M1/141‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |