| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 1069653 = | 0 (0.000) | 51 (0.610) | 30/426 | 1.6 | 56.7% | coding (585/618 nt) | unknown | RstA1 |
| ? | 1 | = 1070011 | 78 (0.940) | coding (198/291 nt) | unknown | Type II secretory pathway, component PulD | |||||
GGTCGTCTTCGTAAAATTGGCATTGATATAGCCCGCAAGTGTGATTTATCAAAATTTAGCCCTGTTAAGGTGGTTTCAACCCGTGAAATTACAGTATCGAATTTAATTGTTCCGGATTGGTATAAATTACCGAATTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAAT > 1/1069519‑1069897 | gaccgtatacaggtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCt < 1:349201‑M1/87‑1 (MQ=255) accgtatacaggtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGt < 1:589188‑M1/118‑1 (MQ=255) accgtatacaggtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGt < 1:478152‑M1/118‑1 (MQ=255) gtatacaggtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttggtcggacttaccgaaaacaagataactgaaagcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCa < 1:338616‑M1/121‑1 (MQ=255) gtatacaggtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATg < 1:312702‑M1/72‑1 (MQ=255) gtatacaggtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTa > 1:679541‑M1/131‑223 (MQ=255) gtatacaggtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCa < 1:25712‑M1/121‑1 (MQ=255) ggtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGt > 1:624054‑M1/124‑214 (MQ=255) ggtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCAtt < 1:759716‑M1/128‑1 (MQ=255) gtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCt > 1:658527‑M1/123‑199 (MQ=255) gtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATg < 1:770623‑M1/99‑1 (MQ=255) gtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTcc > 1:231450‑M1/123‑247 (MQ=255) gtgttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTcc > 1:360560‑M1/123‑247 (MQ=255) ttaatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAAt > 1:184977‑M1/120‑251 (MQ=255) aatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATAc > 1:463166‑M1/118‑251 (MQ=255) aatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATAc > 1:641971‑M1/118‑251 (MQ=255) aatcaatctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATAc > 1:91773‑M1/118‑251 (MQ=255) atctccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGa > 1:701086‑M1/113‑212 (MQ=255) tccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAg > 1:604607‑M1/110‑251 (MQ=255) tccgacacttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAg > 1:567686‑M1/110‑251 (MQ=255) cttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAg < 1:562704‑M1/142‑1 (MQ=255) cttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTa < 1:901560‑M1/149‑1 (MQ=255) ttataaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTaa > 1:111505‑M1/102‑251 (MQ=255) taaaacgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAAttt > 1:11707‑M1/99‑251 (MQ=255) acgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCgg < 1:276949‑M1/145‑1 (MQ=255) cgcgacattgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGAc > 1:257324‑M1/94‑251 (MQ=255) ttgtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGc > 1:820997‑M1/87‑251 (MQ=255) gtcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCTGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCcg < 1:519034‑M1/167‑1 (MQ=255) tcacagatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCcga < 1:723115‑M1/168‑1 (MQ=255) agatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATg < 1:466744‑M1/72‑1 (MQ=255) gatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCt < 1:42576‑M1/77‑1 (MQ=255) gatgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTcc > 1:92867‑M1/79‑203 (MQ=255) atgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATAc > 1:787441‑M1/78‑211 (MQ=255) atgtaagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTa < 1:680278‑M1/174‑1 (MQ=255) aagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGc > 1:853130‑M1/74‑251 (MQ=255) aagtgtaaaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGc > 1:447482‑M1/74‑251 (MQ=255) aaaaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGataat > 1:652310‑M1/67‑251 (MQ=255) aaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAatat > 1:716587‑M1/65‑251 (MQ=255) aaatggcgatgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAatat > 1:753040‑M1/65‑251 (MQ=255) tgtgatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATaaa > 1:542047‑M1/56‑251 (MQ=255) gatagttttgggtggactggccgaaaacaagataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAGTTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAAt < 1:623800‑M1/199‑1 (MQ=255) agataactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTTCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAatat > 1:428899‑M1/24‑210 (MQ=255) aactgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGa < 1:405378‑M1/232‑1 (MQ=255) actgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGAt < 1:301654‑M1/233‑1 (MQ=255) tgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATAc > 1:506595‑M1/17‑251 (MQ=255) tgaaggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATAc > 1:266106‑M1/17‑251 (MQ=255) ggcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGgt < 1:245335‑M1/239‑1 (MQ=255) gcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAgg > 1:106492‑M1/12‑249 (MQ=255) gcgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAgg > 1:407303‑M1/12‑249 (MQ=255) cgaaacaggtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGgtg > 1:701868‑M1/11‑250 (MQ=255) gtTTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTaat > 1:379028‑M1/3‑247 (MQ=255) | GGTCGTCTTCGTAAAATTGGCATTGATATAGCCCGCAAGTGTGATTTATCAAAATTTAGCCCTGTTAAGGTGGTTTCAACCCGTGAAATTACAGTATCGAATTTAATTGTTCCGGATTGGTATAAATTACCGAATTCACGTTGTAAGCTCTCCGACAATTCGCGTTAAATCAGGCTCAAAGGGCAATTTTAGCGTTGGCTCTGATGTACCTATTCTTGGCTCGGTTACTTATGATAGAAATGGTCGTCCGGTGCAGTCCATTGAATACCGCTCAAGCGGTGTAATTTTTGACATATTGCCGACGATTAAAGCCGATAATATTGATATAAAAATTCAGCAACAACTATCTAATTTTGTTAAGACGGATACAGGTGTTAAT > 1/1069519‑1069897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |