| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 3 | 97,283 | Δ63 bp | coding (799‑861/867 nt) | unknown ← | AAA+ ATPase superfamily protein YifB/ComM, associated with DNA recombination |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 3 | 97283 | 97345 | 63 | 60 [0] | [0] 60 | unknown | AAA+ ATPase superfamily protein YifB/ComM, associated with DNA recombination |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 3 | = 97282 | 0 (0.000) | 60 (0.620) | 47/430 | 1.0 | 100% | coding (862/867 nt) | unknown | AAA+ ATPase superfamily protein YifB/ComM, associated with DNA recombination |
| ? | 3 | 97346 = | 0 (0.000) | coding (798/867 nt) | unknown | AAA+ ATPase superfamily protein YifB/ComM, associated with DNA recombination | |||||
GTGGCAACATACTCATGCTCTTTATTGTAAAAACCGCGAAGAGGTTTTTCAAAATACTTTTCTAAATTAAGCGAACAACGCCAGCGAACTTTCTCTAATTTATTTTCGTTGAAATATGACATAATCCACTTCCTTTTCAGCCACTTAAATAGGTAAGTAGATTATAAATGATTTGGGTTATAAGGCGACAATTATTTGTATCGTTTGACAGTTATTTGTAATTTTAACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 3/97054‑97282‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCAGTTATGAAAATTCAGTTCGTTTTGTACCAAACTTGCTACGGACGCGGTTTCAATGGCTTCCTGGTCGGTCATTTCCGGTAATAATCCGGTTAAACGGCTGGCAAGCATGGTTTTCCCGGTGCCGGGCGGACCGAGAAATAACAGATTGTGTTGCCCGGCGGCTGCGATCATGAGAGCACGTTTGGCGTGTTGTTGACCGATAATATCGGTGAGATCTTTCGGATTTTCAT > 3/97346‑97578 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TTGACAGTTATTTGTAATTTTAACACCAGTTATGAAAATTCAGTTCGTTTTGTACCAAACTTGCTACGGACGCGGTTTCAATGGCTTCCTGGTCGGTCATTTCCGGTAATAATCCGGTTAAACGGCTGGCAAGCATGGTTTTCCCGGTGCCGGGCGGACCGAGAAATAACAGATTGTGTTGCCCGGCGGCTGCGATCATGAGAGCACGTTTGGCGTGTTGTTGACCGATAATATCGGTGAGATCTTTCGGA < 1:509281/251‑1 CAGTTATTTGTAATTTTAACACCAGTTATGAAAATTCAGTTCGTTTTGTACCAAACTTGCTACGGACGCGGTTTCAATGGCTTCCTGGTCGGTCATTTCCGGTAATAATCCGGTTAAACGGCTGGCAAGCATGGTTTTCCCGGTGCCGGGCGGACCGAGAAATAACAGATTGTGTTGCCCGGCGGCTGCGATCATGAGAGCACGTTTGGCGTGTTGTTGACCGATAATATCGGTGAGATCTTTCGGATTTT > 1:343694/1‑251 CAGTTATTTGTAATTTTAACACCAGTTATGAAAATTCAGTTCGTTTTGTACCAAACTTGCTACGGACGCGGTTTCAATGGCTTCCTGGTCGGTCATTTCCGGTAATAATCCGGTTAAACGGCTGGCAAG > 1:474465/1‑129 GTTATTTGTAATTTTAACACCAGTTATGAAAATTCAGTTCGTTTTGTACCAAACTTGCTACGGACGCGGTTTCAATGGCTTCCTGGTCGGTCATTTCCGGTAATAATCCGGTTAAACGGCTGGCAAGCATGGTTTTCCCGGTGCCGGGCGGACCGAGAAATAACAGATTGTGTTGCCCGGCGGCTGCGATCATGAGAGCACGTTTGGCGTGTTGTTGAC < 1:78195/219‑1 GTTATTTGTAATTTTAACACCAGTTATGAAAATTCAGTTCGTTTTGTACCAAACTTGCTACGGACGCGGTTTCAATGGCTTCCTGGTCGGTCATTTCCGGTAATAATCCGGTTAAACGGCTGGCAAGCATGGTTTTCCCGGTGCCGGGCGGACCGAGAAATAACAGATTGTGTTGCCCGGCGGCTGCGATCATGAGAGC > 1:140868/1‑199 TTATTTGTAATTTTAACACCAGTTATGAAAATTCAGTTCGTTTTGTACCAAACTTGCTACGGACGCGGTTTCAATGGCTTCCTGGTCGGTCATTTCCGGTAATAATCCGGTTAAACGGCTGGCAAGCATGGTTTTCCCGGTGCCGGGCGGACCGAGAAATAACAGATTGTGTTGCCCGGCGGCTGCGATCATGAGAGCACGTTTGGCGTGTTGTTGACCGATAATATCGGTGAGATCTTTCGGATTTTCAT < 1:339274/251‑1 TTTTAACACCAGTTATGAAAATTCAGTTCGTTTTGTACCAAAATTGCTAAGGACGCGGTTTCAATGGCTTCCTGTTCGGTCATTTCCGGTAATAATCCGGTTAAACGGCTGGCAAGCATGGTTTTCCCGGTGCCGGGCGGACCGAGAAATAACAGATTGTGTTGCCCGGCGGCTGCGATCATGAGAGCACGTTTGGCGTGTTGTTGACCGATAATA > 1:581270/1‑216 TTTAACACCAGTTATGAAAATTCAGTTCGTTTTGTACCAAACTTGCTA < 1:539937/48‑1 GTGGCAACATACTCATGCTCTTTATTGTAAAAACCGCGAAGAGGTTTTTCAAAATACTTTTCTAAATTAAGCGAACAACGCCAGCGAACTTTCTCTAATTTATTTTCGTTGAAATATGACATAATCCACTTCCTTTTCAGCCACTTAAATAGGTAAGTAGATTATAAATGATTTGGGTTATAAGGCGACAATTATTTGTATCGTTTGACAGTTATTTGTAATTTTAACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 3/97054‑97282‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCAGTTATGAAAATTCAGTTCGTTTTGTACCAAACTTGCTACGGACGCGGTTTCAATGGCTTCCTGGTCGGTCATTTCCGGTAATAATCCGGTTAAACGGCTGGCAAGCATGGTTTTCCCGGTGCCGGGCGGACCGAGAAATAACAGATTGTGTTGCCCGGCGGCTGCGATCATGAGAGCACGTTTGGCGTGTTGTTGACCGATAATATCGGTGAGATCTTTCGGATTTTCAT > 3/97346‑97578 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |