| New junction evidence | |||||||||||
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GCCCTCGCATGTTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGT < 1:194049/223‑1 CCCTCGCATGTTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATAT < 1:191882/174‑1 CCCTCGCATGTTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGA > 1:209040/1‑75 CGCATGTTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATAT > 1:688254/1‑170 CATGTTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTC > 1:255901/1‑250 CATGTTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTC < 1:307412/250‑1 CATGTTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTC < 1:610462/250‑1 CATGTTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTC < 1:390538/250‑1 CATGTTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTC < 1:787860/250‑1 CATGTTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGC < 1:770976/147‑1 TTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCGTG < 1:130562/250‑1 GGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTAC > 1:853912/1‑61 TCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCGTGAGTACAAGGTGAAAA < 1:599036/249‑1 TTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCG < 1:514800/225‑1 TTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGC > 1:584429/1‑113 AACAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCGTGAGTACAAGGTGAAAATGCTGATTATTGA < 1:651983/251‑1 CAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCGTGAGTACAAGGTGAAAATGCTGATTATTGACG > 1:618375/1‑251 CAATGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCGTGAGTACAAGGTGAAAATGCTGATTATTGACG < 1:360594/251‑1 TGGTAAAACGACGCTTATTCTACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATAT > 1:203045/1‑132 TGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCGTGAGTACAAGGTGAAAATGCTGATTATTGACGAAT > 1:668966/1‑251 TGGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAAT > 1:830306/1‑188 GGTAAAACGACGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCGTGAGTACAAGGTGAAAATGCTGATTATTGACGAATT > 1:29180/1‑251 CGCTTATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCGTGAGTACAAGGT > 1:299193/1‑217 ATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCGTGAGTACAAGGTGAAAATGCTGATTATTGACGAATTCCATTCGTTGCTTGT > 1:131299/1‑251 ATTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAAT < 1:160503/172‑1 CGTTTGGAGATATTGAATAATGGAAAAACAATATGAGTATGTTCACGAAAAATTCCGTCATTTAGTGATTGCAAGCAATCAGGAACGGATTGAGTTTTTAGATGAACCACGTTGGGTAGGTTATGCCGTTGCAAATAAGATCATTGATAATTTGGTTTCCTTAATGAATAAGCCGAAACGCCCTCGCATGTTCAATTTGTTGGTAGTCGGTGATTCTAACAATGGTAAAACGACGCTTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 3/76346‑76584‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taTTCGACACTTTTATGATTTGTACGGCATACCTTTCGTGGACAGCCAGTCGGACGGTATACGCCCCATTATTTTGGCAGAAGCACCGCCGAGTGCAAATGAAAAAGAGCTTTATATCTCGTTACTGGAGCGTTTTTATGTTCCATATCGACCAACGGATAGCGTAGCTAAATTGCGTTATCAGACGATTCACTTATTCCGTGAGTACAAGGTGAAAATGCTGATTATTGACGAATTCCATTCGTTGCTTGT < 3/79621‑79372 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |