| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 11 | = 1225 | NA (NA) | 62 (1.270) | 41/430 | 1.4 | 100% | intergenic (+41/–) | unknown/– | Translation elongation factor Tu/– |
| ? | 3 | 1 = | 0 (0.000) | intergenic (–/‑1246) | –/unknown | –/DNA transformation protein TfoX | |||||
ACCGTCCACAATTCTATTTCCGTACAACTGACGTAACCGGTACTATCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 11/979‑1225‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGCTGTACTTCCTTTTTAATTCATTATACACGACTAATTTTTATTTTAATTCTATTAAATAATCATTTAAGCCGATTTATCGTATTTTTCAATGTCTGAATCTGTATATCGTTCAGACGTGAATAATAGTCCATATTGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATA > 3/1‑216 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CAATTCTATTTCCGTACAACTGACGTAACCGGTACTATCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTT < 1:40296/251‑1 TCTATTTCCGTACAACTGACGTAACCGGTACTATCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTG < 1:508956/251‑1 CTATTTCCGTACAACTGACGTAACCGGTACTATCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGT < 1:59306/251‑1 CCGTACAACTGACGTAACCGGTACTATCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGA > 1:29320/1‑251 TACAACTGACGTAACCGGTACTATCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAA < 1:260125/250‑1 GACGTAACCGGTACTATCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGT < 1:357996/235‑1 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TACTATCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGC < 1:306924/251‑1 TACTATCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGC < 1:879223/251‑1 TACTATCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGC < 1:470508/251‑1 TCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGCTGTAC < 1:530582/251‑1 TCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGCTGTAC < 1:362296/251‑1 TCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGCTGTAC < 1:29958/251‑1 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CCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGCTGTACTTCCTTTTTAATTCATTATACACGACTAATT < 1:449237/250‑1 CCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATAC > 1:370918/1‑209 GATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATCGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGCTGTAC > 1:8223/1‑213 CATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCC < 1:888742/169‑1 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TGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATTGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTAGGCTGTACTTCCTTTTTAATTCATTATACACGACTAATTTTTATTTTAATTCTATTAAATAATCATTTAAGCCGATTTACCGTATTTTTCAATGTCTGAATCTGTATATCGTTCAGACGTGAATAATAGTCCATATTGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCC < 1:424828/251‑1 TGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGCTGTACTTCCTTTTTAATTCATTATACACGACTAATTTTTATTTTAATTCTATTAAATAATCATTTAAGCCGATTTACCGTATTTTTCAATGTCTGAATCTGTATATCGTTCAGACGTGAATAAT < 1:712266/208‑1 AGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGCTGTACTTCCTTTTTAATTCATTATACACGACTAATTTTTATTTTAATTCTATTAAATAATCATT > 1:289248/1‑143 AGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAA > 1:6564/1‑70 ACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGCTGTACTTCCTTTTTAATTCATTATACACGACTAATTTTTATTTTAATTCTATTAAATAATCATTTAAGCCGATTTACCGTATTTTTCAATGTCTGAATCTGTATATCGTTCAGACGTGAATAATAGTCCATATTGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATA < 1:385342/249‑1 AAGTAAAACTGAAAATGCGTATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATAC < 1:771937/64‑1 ATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGCTGTACTTCCTTTTTAATTCATTATACACGACTAATTTTTATTTTAATTCTATTAAATAATCATTTAAGCCGATTTACCGTATTTTTCAATGTCTGAATC < 1:889600/148‑1 ATCGAGAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGC < 1:18634/49‑1 ACCGTCCACAATTCTATTTCCGTACAACTGACGTAACCGGTACTATCGAGTTACCTGAAGGCGTGGAAATGGTTATGCCCGGTGATAACATCAAAATGACCGTATCCTTAATTCACCCAATTGCGATGGACCAAGGTTTACGTTTCGCTATCCGTGAAGGTGGCCGTACAGTGGGTGCCGGCGTGGTAGCTAAAATTATCAAATAATTGATAAGACAAACCAAAGTAAAACTGAAAAGGCGTATCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > 11/979‑1225‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GAGGTACGCCTTTTTGTTTATGAAATCTTTAATAAATACTATGCTGTACTTCCTTTTTAATTCATTATACACGACTAATTTTTATTTTAATTCTATTAAATAATCATTTAAGCCGATTTATCGTATTTTTCAATGTCTGAATCTGTATATCGTTCAGACGTGAATAATAGTCCATATTGTAACGGTCTAACTTTCAGCAACACCTCAAGCCTGATA > 3/1‑216 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |