| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
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GATAGCTGCTGTTAAAGTGGTTTTACCATGGTCAACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTT > 1:825582/1‑251 CTGCTGTTAAAGTGGTTTTACCATGGTCAACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTC < 1:707600/251‑1 CTGCTGTTAAAGTGGTTTTACCATGGTCAACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGT < 1:378681/250‑1 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ACCATGGTCAACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTG > 1:296409/1‑251 ACCATGGTCAACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTT > 1:354006/1‑164 GGTCAACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTGCGTAA > 1:518841/1‑251 GGTCAACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGGCTGGGAACGTAAGTCAGTTG > 1:319987/1‑246 GGTCAACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAA > 1:175247/1‑212 GGTCAACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGG < 1:838888/175‑1 TCAACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTGCGTAAC < 1:661858/250‑1 ACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTC > 1:214045/1‑186 ATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTGCGTAACCGAACATTTCTGA > 1:861529/1‑251 ATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAG < 1:101316/211‑1 TTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTC > 1:739991/1‑226 CACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTGCGTAACCGAACATTTCTGAAAGCGGAA > 1:33899/1‑251 ACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTG > 1:570054/1‑223 CGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTGCGTAACCGAACATTTCTGAAAGCGGAA > 1:11441/1‑249 GTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTt > 1:549177/1‑154 GTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTGCGTAACCGAACATTTCTGAAAGCGGAACTTCTGCATCGATT > 1:554229/1‑251 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1:178454/187‑1 ACACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTGCGTAACCGAACATTTCTGAAAGCGGAACTTCTGCATCGATTTTAACAACGAATTCGTTCGCTTCTTG < 1:787970/250‑1 CACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTGCGTAACCGAACATTTCTGAAAGCGGAACTTCTGCATCGATTTTAACAACGAATTCGTTCGCTTCTTGAC < 1:351244/251‑1 CACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTGCGTAACCGAACATTTCTGAAAGCGGAACTTCTGCATCGATTTTAACAACGAATTCGTTCGCTTCTTGAC < 1:371546/251‑1 CACGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTGCGTAACCGAACATTTCTGAAAGCGGAACTTCTGCATCGATTTTAACAACGAATTCGTTCGCTTCTTGAC < 1:420374/251‑1 GTCAACGTGTGCATAGTGACGGGTT‑GGGGTGTCATATTCAACGTGTGAAGTGTTGATGGTGATACCACGCGCTTTTTCTTCAGGTGCATTATCGATTTGGTCAAATGCACGTGCTGCACCGCCGTAGTGTTTTGCCAATACGGTAGTGATAGCTGCTGTTAAAGTGGTTTTACCATGGTCAACGTGGCCGATTGTACCCACGTTAACGTGCGGTTTTGTACGTTCAAATTTTTCTTTAGACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 11/242‑1‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGATTAAGTTTCCTCAATGTATAAGTCCACAAGCCGGAGTGGCTTGTGGATTAGTTAAACAAAATTATTTTTTACGAGCTTCAATTACGGCTTCAGCTACGTTTTTCGGTGCTTCAGCATATTTCAATGGTTCCATTGAGTAGGAAGCACGACCTTGAGTCTGGGAACGTAAGTCAGTTGCGTAACCGAACATTTCTGAAAGCGGAACTTCTGCATCGATTTTAACAACGAATTCGTTCGCTTCTTGAC < 5/38025‑37777 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |