| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | 669993 = | 77 (0.920) | 6 (0.100) +CGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTT |
6/258 | 4.2 | 20.7% | intergenic (+26/‑156) | unknown/unknown | tRNA‑Pro‑TGG/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| ? | 2 | = 176511 | 0 (0.000) | intergenic (‑277/–) | unknown/– | Transaldolase (EC 2.2.1.2)/– | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
CCGACTTGCATGTGTTAAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/670216‑669993‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACAT < 2/176511‑176425 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CCGACTTGCATGTGTTAAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGAC < 1:584570/228‑1 CGACTTGCATGTGTTAAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAAC < 1:9554/251‑1 CGACTTGCATGTGTTAAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAAC < 1:874366/251‑1 CGACTTGCATGTGTTAAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAAC < 1:292216/251‑1 ACTTGCATGTGTTAAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGG < 1:878778/251‑1 TGTGTTAAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCG > 1:159481/1‑251 GTGTTAAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGT > 1:408752/1‑251 TGTTAAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTT > 1:774167/1‑251 CCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCC < 1:4260/249‑1 CGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTAT > 1:638789/1‑251 GATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAAC < 1:575904/197‑1 AAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATCAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAG < 1:284246/251‑1 ATTAATCTTTTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAA < 1:318855/251‑1 ATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTC < 1:322458/191‑1 ATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTAT > 1:623293/1‑175 ATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAAC > 1:177098/1‑149 ATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAAC < 1:659370/122‑1 ATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAAC > 1:7718/1‑139 TAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGG > 1:672732/1‑165 CTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTC > 1:35627/1‑165 TCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTC < 1:26632/163‑1 CCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGG > 1:254132/1‑143 CTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATAT > 1:768798/1‑251 ATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAA < 1:323739/246‑1 ATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTAC > 1:741685/1‑108 ATTAAGTTCAATCTTAAAATTACTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTC < 1:447103/192‑1 GTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAAC < 1:281806/98‑1 TTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACAT < 1:552099/250‑1 ATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGGTATTTACTAATTCTTTGCAAGAGTTTTTTACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGC > 1:346118/1‑218 ATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAAC > 1:684045/1‑93 ATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAAC > 1:429961/1‑63 AATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAAC > 1:330093/1‑80 ATCTATAGGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGG > 1:801120/1‑108 ATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGG > 1:415310/1‑108 ATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGG < 1:866709/81‑1 ATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAA > 1:248562/1‑69 CTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAAC < 1:362714/77‑1 TGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTAC > 1:681431/1‑67 CAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAAC > 1:773667/1‑62 GTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAAC > 1:99035/1‑60 GTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACC < 1:198687/53‑1 GTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAAC > 1:780691/1‑52 GTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAA > 1:39251/1‑50 TTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAACGACGCGCTGTCTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGG < 1:217012/87‑1 CTATAAAACCCTACAACGGCGCGTCGTTGTGCCCGCGTATTATAGG > 1:427759/1‑46 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| CCGACTTGCATGTGTTAAGCCTGCCGCCAGCGTTCAATCTGAGCCATGATCAAACTCTTCAATTCAAAAAGCTTAATCCCTCAATAGCTGACTTAATTAATCTATTATAAATAATATAAATAAACGAATCTTCCGGCACCTATTAAGTTCAATCTTAAAATTATTTAAAACGAATCTATAAGTGCCCACACAGTTTGTATGATTGATTGTTAAAGAACAAAAAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < 1/670216‑669993‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ACAAAAAAATTGAACTTTTTTTCCAATTGCTAATAATTTGCATATCATGAAATTTTAGCCGCGCTAAAAAATACAAATATTTAACAT < 2/176511‑176425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |