| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 757,619 | (T)7→8 | intergenic (+21/‑51) | unknown → / → unknown | Molybdenum transport system protein ModD/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 757,612 | 1 | . | T | 100.0% | 103.1 / NA | 37 | intergenic (+14/‑58) | unknown/unknown | Molybdenum transport system protein ModD/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (15/22); total (15/22) | |||||||||||
ATATTATTCAGTTGGATAAATGGTCGCCGGAACAGGTTCAACAGGCATTGGCTTTGTTAAAAAAGCAAAGTAAAAAAACGCTCCTTTCTGTTGCCGGCGGGGTGAATAAAAACAACATAGCAGATTATGCCAAGTTAGGGATAAATTTATTTATCATCTCCGCGCCTTACTATGCACCGCCGGAAGATATTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCAC‑TTTTTTTAAATAGTTAAAAAACACAACGCAGAAATTCTTAAAAAAAAGTTATTAAAAGTGCGGTTAAAAAACAAATTAAAAATTCACCGCACTTTTTATTCCCCTCCACAATTCAACAAAATAGAATTTATACCCTTAAATAAATTGCGGATAAACCGCTCTTTTTCTTTGGAAAATATCGGATTTATTGCCATTTTCAGGTAACTTTCCTTTTCGGTTTTGGCGGAAAATACGTTATAATCC > 1/757369‑757855 | atatTATTCAGTTGGATAAATGGTCGCCGGAACAGGTTCAACAGGCATTGGCTTTGTTAAAAAAGCAAAGTAAAAAAACGCTCCTTTCTGTTGCCGGCGGGGTGAATAAAAACAACATAGCAGATTATGCCAAGTTAGGGATAAATTTATTTATCATCTCCGCGCCTTACTATGCACCGCCGGAAGATATTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCAC‑ttttttt > 1:73125/1‑251 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atatTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCACTTTTTTTTAAATAGTTAAAAAACACAACGCAGAAATTCTTAAAAAAAAGTTATTAAAAGTGCGGTTAAAAAACAAATTAAAAATTCACCGTACTTTTTATTcc > 1:392120/1‑161 (MQ=255) atatTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCACTTTTTTTTAAATAGTTAAAAAACACAACGCAGAAATTCTTAAAAAAAAGTTATTAAAAGTGCGGTTAAAAAACAAATTAAAAATTCACCGTACTTTTTATTCCCCTc > 1:750574/1‑165 (MQ=255) atatTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCACTTTTTTTTAAATAGTTAAAAAACACAACGCAGAAATTCTTAAAAAAAAGTTATTAAAAGTGCGGTTAAAAAACAAATTAAAAATTCACCGTACTTTTTATTCCCCTCCACAATTCAACAAAATAGAATTTATAccc > 1:479488/1‑194 (MQ=255) atatTAAAGTGGTGATTGAGCGGATGCAGAACAAAAACACTTAAAAAAATGACCGCACTTTTTTTTAAATAGTTAAAAAACACAACGCAGAAATTCTTAAAAAAAAGTTATTAAAAGTGCGGTTAAAAAACAAATTAAAAATTCACCGTACTTTTTATTCCCCTCCACAATTCAACAAAATAGAATTTATACCCTtaaat < 1:702181/200‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |