| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 4 | 3,671 | +A | intergenic (+7/‑63) | unknown → / → unknown | Inner membrane protein RclC associated with response to reactive chlorine species/Transcriptional regulator, AraC family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 4 | 3,668 | 1 | . | A | 100.0% | 242.7 / NA | 89 | intergenic (+4/‑66) | unknown/unknown | Inner membrane protein RclC associated with response to reactive chlorine species/Transcriptional regulator, AraC family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base A (43/46); total (43/46) | |||||||||||
CATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGGATGTCCATCGTTACCTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAAACCTGGGTGCCTAATTTGGGTGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATTATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCTGCCGCCGAATGCGCTAATCGATGGCTAAAGGCGAAACAATCCGTCTAATTGT‑AAATCTGGCTGAAGCTTATCACCTTGTGATAGGCTTCTTCGTTTAATCAGGGCAAACATTGAAATATGGACTATTTAGATCAGCTTATCCGATTATCGGGCATTGAGGGAGAAATCAATATCCTCTGCCGTTTCCGGGGAGACTGGCTGATTCATCACAAGCAGGAACCCAATTTAATCGGCAAATTTCACATTGTGTCACGCGGCGAATGTCAGATTCGGCTGAAAAATCAAACC > 4/3420‑3904 | cATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGAATGTCCATCGTCACTTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAGACCTGGGTGCCTAATTTGGGCGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATCATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCCGCCGCCGAATGTGCAAATCGGTGGTTAAAGGCGAAACAATCCGTCTAATTGT‑aa < 1:391655/251‑1 (MQ=255) 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CATTGGGCTTATTTGGCGGGTTGCTCACGTTCGGGATGTCCATCGTTACCTTGTCGTTCCTTATTTTCACACCGGAAACCTGGGTGCCTAATTTGGGTGGTGATTTACCAACGCCGAATTATGGTTTCCCTTATTTATCTGCGGCAGGGCGGCTGGTTATTAAAGATATTATCATGATGGCAGGAGGATTGGTTGCTGCCGCCGAATGCGCTAATCGATGGCTAAAGGCGAAACAATCCGTCTAATTGT‑AAATCTGGCTGAAGCTTATCACCTTGTGATAGGCTTCTTCGTTTAATCAGGGCAAACATTGAAATATGGACTATTTAGATCAGCTTATCCGATTATCGGGCATTGAGGGAGAAATCAATATCCTCTGCCGTTTCCGGGGAGACTGGCTGATTCATCACAAGCAGGAACCCAATTTAATCGGCAAATTTCACATTGTGTCACGCGGCGAATGTCAGATTCGGCTGAAAAATCAAACC > 4/3420‑3904 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |