| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 2 | 132,269 | (T)6→7 | intergenic (+51/‑117) | unknown → / → unknown | Anaerobic C4‑dicarboxylate transporter/Heterodimeric efflux ABC transporter, permease/ATP‑binding subunit 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 2 | 132,263 | 1 | . | T | 100.0% | 163.2 / NA | 58 | intergenic (+45/‑123) | unknown/unknown | Anaerobic C4‑dicarboxylate transporter/Heterodimeric efflux ABC transporter, permease/ATP‑binding subunit 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (28/30); total (28/30) | |||||||||||
GTATTAGTTGGTGTGTTTGTGGCGGTAAACGGTTATTTCTTCATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTA‑TTTTTTATTTAACCGTTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGCATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGC > 2/132015‑132504 | gTATTAGTTGGTGTGTTTGTGGCGGTAAACGGGTTTTTTTTTATTTCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTTACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTTAATCACAGCTTCATGTTTCCGGGCTTTTTTAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTTGGCTTATTATTTTCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTTGGGGGATAATAGCGTCTTATTTTAGGCGCTA‑tt > 1:652867/1‑251 (MQ=255) ggTAAACGGTTATTTCTTCATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACg > 1:578459/1‑251 (MQ=255) cGGTTATTTCTTCATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATa > 1:48468/1‑250 (MQ=255) cGGTTATTTCTTCATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATa > 1:648578/1‑250 (MQ=255) tcttcATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTAtttt > 1:434543/1‑251 (MQ=255) tcttcATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTAtttt > 1:540130/1‑251 (MQ=255) aCTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACattattctgcttcttataaa > 1:284666/1‑237 (MQ=255) 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tGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGat > 1:371200/1‑251 (MQ=255) tGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGat < 1:813646/251‑1 (MQ=255) tGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGat < 1:886560/251‑1 (MQ=255) cTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGc < 1:338316/251‑1 (MQ=255) cTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGc < 1:459721/251‑1 (MQ=255) aCGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCAc < 1:503305/251‑1 (MQ=255) cGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCa > 1:236269/1‑249 (MQ=255) gggCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACtt > 1:602848/1‑251 (MQ=255) gCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACttt > 1:195269/1‑250 (MQ=255) 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1:578467/1‑197 (MQ=255) ggCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAgg < 1:186408/218‑1 (MQ=255) aTTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACg < 1:226229/146‑1 (MQ=255) aTTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGat < 1:288418/185‑1 (MQ=255) gAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGAc < 1:76665/212‑1 (MQ=255) 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ggCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTg > 1:541510/1‑172 (MQ=255) tatTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAAc > 1:672550/1‑178 (MQ=255) tCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAAc < 1:195722/251‑1 (MQ=255) gggAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTggcggaat > 1:482340/1‑248 (MQ=255) 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< 1:597742/124‑1 (MQ=255) gcgcTATTTTTTTATTTAACCGCTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGAATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGc < 1:898619/248‑1 (MQ=255) | GTATTAGTTGGTGTGTTTGTGGCGGTAAACGGTTATTTCTTCATTCCGAACTACGGTCCGATCATTGCCTCTATCGACTTTGACACTACGGGCACCACACGCATCGGTAAATACATTTTCAATCACAGCTTCATGTTGCCGGGCTTATTGAGTATGGCATTCAGCTTAGCCTTAGGCTTATTATTTGCAAATATTTTCCTATAACACGATTTTGCTTCGGGGAATAATAGCGTCTTATTTCAGGCGCTA‑TTTTTTATTTAACCGTTAAACACGAAATACATTATTTTTACGAATAAAATTAATTAGCATTTGTCATATAAATGTTATGATATAGCACTTTCATTGAGGTGATTTAAGGACAGATAAACATTATGATGATTGATAAACGGCTGATAAATACGGTCGCCAACAGCAAAAAATGGATTGCGATTAATGTATTGTGGAACTGGGTTGCATTAATTGGCGGCATTATTAGCGCAGTGGTGTTTGC > 2/132015‑132504 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |