| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,529,928 | +T | coding (545/555 nt) | unknown → | Sodium‑dependent anion transporter family |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,529,925 | 1 | . | T | 100.0% | 142.8 / NA | 54 | N181I (AAT→ATT) | unknown | Sodium‑dependent anion transporter family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base T (19/35); total (19/35) | |||||||||||
TGATTTGGTTAATGGTATCGGCATTTGTTCTCACCTCGGCTATGATCAAATCGAATATCGCCCGCCGTTTTGCGCTTTGGATGATTACTCATTTTGGACAAACACCGAAGAAAGCCTTATTTGTGCTTGTATTAATTAATTTTATACTTGTTTTCTTTGTTCCTTCAACAACAGCACGAGCCTCATTAATGGTTCCTATTTGCTTAATTCTTTTAGAAATTTATAAAGCCATGCCAGGTGAAAGCAA‑TTTGGACGATTGATGATGTTACAAGGTGTACAGGCCGATGCGATTGCCACATCGGGTGTGATGACAGGTACTGCTGCCAACATTATTTCCGTTGGTTTTATCAATAGCCAAGAAAACGGCGATATCGGTTATATTGACTGGGTAATAGCCTCCTTCCCTATTGCCTTTATATCCATGATGATTTCTTTTATGGTGGGCTTTAAATTATTTTCTATTAAAAAAGAAACACAATTTATTGAGGCA > 1/1529679‑1530168 | tgATTTGGTTAATGGTATCGGCATTTGTTCTCCCCTCGGCTATGATCAAATCGAATATCGCCCGCCGTTTTGCGCTTTGGATGATTACTCATTTTGGACAAACACCGAAGAAAGCCTTATTTGTGCTTGTATTAATTAATTTTATACTTGTTTTCTTTGTTCCTTCAACAACAGCACGAGCCTCATTAATGGTTCCTATTTGCTTAATTCTTTTAGAAATTTATAAAGCCGTGCCAGGTGAAAGCAA‑ttt < 1:116722/250‑1 (MQ=255) 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TGATTTGGTTAATGGTATCGGCATTTGTTCTCACCTCGGCTATGATCAAATCGAATATCGCCCGCCGTTTTGCGCTTTGGATGATTACTCATTTTGGACAAACACCGAAGAAAGCCTTATTTGTGCTTGTATTAATTAATTTTATACTTGTTTTCTTTGTTCCTTCAACAACAGCACGAGCCTCATTAATGGTTCCTATTTGCTTAATTCTTTTAGAAATTTATAAAGCCATGCCAGGTGAAAGCAA‑TTTGGACGATTGATGATGTTACAAGGTGTACAGGCCGATGCGATTGCCACATCGGGTGTGATGACAGGTACTGCTGCCAACATTATTTCCGTTGGTTTTATCAATAGCCAAGAAAACGGCGATATCGGTTATATTGACTGGGTAATAGCCTCCTTCCCTATTGCCTTTATATCCATGATGATTTCTTTTATGGTGGGCTTTAAATTATTTTCTATTAAAAAAGAAACACAATTTATTGAGGCA > 1/1529679‑1530168 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |