| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 291,596 | (A)7→8 | intergenic (‑64/‑173) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/Cystathionine gamma‑synthase (EC 2.5.1.48) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 291,589 | 1 | . | A | 98.7% | 201.1 / ‑3.4 | 74 | intergenic (‑57/‑180) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/Cystathionine gamma‑synthase (EC 2.5.1.48) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base A (35/38); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
TGAGTGACTGGCTAGCTGCGTAGGGAGTTATGGAGGCGTGTCCCGGAGTCGAACCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATT‑AAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATACCCTATTAGCCCAAGCCGGCAA > 1/291345‑291815 | tGAGTGACTGGCTAGCTGCGTAGGGAGTTATGGAGGCGTGTCCCGGAGTCGAACCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATT‑aaaaaa < 1:55001/251‑1 (MQ=255) gCGTAGGGAGTTATGGAGGCGTGTCCCGGAGTCGAACCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGa > 1:818588/1‑251 (MQ=255) gCGTAGGGAGTTATGGAGGCGTGTCCCGGAGTCGAACCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGa > 1:754813/1‑251 (MQ=255) tATGGAGGCGTGTCCCGGAGTCGAACCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACaaa < 1:246403/251‑1 (MQ=255) gAGGCGTGTCCCGGAGTCGAACCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAgg < 1:494005/250‑1 (MQ=255) ggCGTGTCCCGGAGTCGAACCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTa > 1:605336/1‑251 (MQ=255) tCCCGGAGTCGAACCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTaaaaaa < 1:550746/250‑1 (MQ=255) gggAGTCGAACCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTc > 1:424756/2‑250 (MQ=255) gAGTCGAACCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGa > 1:496463/1‑251 (MQ=255) aaCCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAg > 1:228900/1‑209 (MQ=255) cTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATT‑aaaa > 1:246751/1‑191 (MQ=255) aCATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCt < 1:720140/251‑1 (MQ=255) ttGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTaaaa > 1:52667/1‑220 (MQ=255) ttGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAAt > 1:787507/1‑251 (MQ=255) ttGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAAt > 1:819452/1‑251 (MQ=255) cAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCa < 1:677092/250‑1 (MQ=255) aTCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAAtt < 1:21429/251‑1 (MQ=255) aTCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAAtt > 1:259455/1‑251 (MQ=255) tCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTc < 1:263477/251‑1 (MQ=255) gcacaaCCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATT‑aaaa < 1:699079/165‑1 (MQ=255) gCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAg < 1:519885/217‑1 (MQ=255) gCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAg < 1:479282/217‑1 (MQ=255) ccGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATAc > 1:165871/1‑174 (MQ=255) ccGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAggggg < 1:475534/251‑1 (MQ=255) gTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAg > 1:166820/1‑156 (MQ=255) tAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGtt < 1:396133/251‑1 (MQ=255) gTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGc < 1:240378/202‑1 (MQ=255) tGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGcc < 1:569162/251‑1 (MQ=255) ggAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCt < 1:790673/192‑1 (MQ=255) aaCGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGc < 1:198493/251‑1 (MQ=255) ggCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCt > 1:478901/1‑184 (MQ=255) aCCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATc > 1:702844/1‑179 (MQ=255) aCCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTg > 1:192926/1‑251 (MQ=255) aCCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGt > 1:181087/1‑114 (MQ=255) aCCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAAtt > 1:40310/1‑158 (MQ=255) aCCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGtat > 1:311312/1‑251 (MQ=255) tGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAAt > 1:671147/1‑184 (MQ=255) tGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATaaaa > 1:495498/1‑251 (MQ=255) gCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTTAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATaaaaa < 1:426157/250‑1 (MQ=255) gCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATaaaaa < 1:326604/250‑1 (MQ=255) gCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATaaaaa < 1:461122/250‑1 (MQ=255) cAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAata < 1:487305/251‑1 (MQ=255) cAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAat < 1:543490/250‑1 (MQ=255) cAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAat < 1:361336/250‑1 (MQ=255) gTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATaaaaa < 1:809795/245‑1 (MQ=255) gTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATAtg < 1:98997/249‑1 (MQ=255) ctACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCaa < 1:403469/156‑1 (MQ=255) cAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTaaaaa < 1:702327/119‑1 (MQ=255) aCTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCa > 1:666650/1‑149 (MQ=255) tATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGGTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGac < 1:431737/251‑1 (MQ=255) aTTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGaca > 1:189695/1‑251 (MQ=255) aTTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATAC‑AAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGacac < 1:482227/251‑1 (MQ=255) cgTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAata > 1:130602/1‑218 (MQ=255) cTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGtt < 1:338709/163‑1 (MQ=255) cTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATaaaaa > 1:97219/1‑209 (MQ=255) cGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATAccc < 1:302971/251‑1 (MQ=255) cGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATAcc < 1:540477/250‑1 (MQ=255) gTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATAccc > 1:460768/1‑249 (MQ=255) gCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATaaaa > 1:498007/1‑128 (MQ=255) gCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGcc < 1:206818/157‑1 (MQ=255) gCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATaaaaa > 1:249774/1‑197 (MQ=255) gCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATACCCTAtt > 1:882851/1‑251 (MQ=255) gCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATT‑AAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGac < 1:510077/223‑1 (MQ=255) tttACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATACCCTATTAGcc < 1:180525/251‑1 (MQ=255) ttACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATaaaaa < 1:625335/192‑1 (MQ=255) ttACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATAtgttg < 1:525915/199‑1 (MQ=255) ttACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATACCCTATTAGccc < 1:87653/251‑1 (MQ=255) ttACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATACCCTATTAGccc < 1:783879/251‑1 (MQ=255) cTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATACCCTATTAGCCCAAg > 1:319647/1‑251 (MQ=255) aCTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATAccc > 1:394878/1‑236 (MQ=255) aTCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATaaaaa > 1:525711/1‑182 (MQ=255) aTCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGAtt < 1:743223/203‑1 (MQ=255) aTCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATg > 1:318662/1‑207 (MQ=255) aTCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATACCCTATTAGCCCAAGCCGGCaa > 1:248987/1‑251 (MQ=255) aTCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATACCCTATTAGCCCAAGCCGGCaa > 1:281369/1‑251 (MQ=255) aTCTAAAACTGTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATACCCTATTAGCCCAAGCCGGCaa > 1:547456/1‑251 (MQ=255) gTCAACAAACAATTAAAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGtt < 1:447956/126‑1 (MQ=255) | TGAGTGACTGGCTAGCTGCGTAGGGAGTTATGGAGGCGTGTCCCGGAGTCGAACCGAGCTACATGGATTTGCAATCCAGTGCATAACCGCTTTGCTAACACGCCGTTAGTTTTGGAGCGGGAAACGAGGCTCGAACTCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTTTGTCTTTAGTGCGGTGCATTTTACTGACTTATCTAAAACTGTCAACAAACAATT‑AAAAAAACGATGAGTTTGTCGAAAAAATACAAAAGGTTAAAAAATTCCGAGGTTAAATTTTAGCTTGTGTAATCAATTCGTTATAAAATTTCCTTTTATCAAGGGGGAGTTTATGCCAGAATGAAGCACATTTTTTATAAAAAGTGCGGTATAAAAATATGTTGTTTCGTGGAGGATTTATGACACAAAAATATGCGATTGATACCCTATTAGCCCAAGCCGGCAA > 1/291345‑291815 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |