| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,478,027 | (A)6→7 | intergenic (‑611/‑138) | unknown ← / → unknown | Metal‑dependent hydrolase YbeY, involved in rRNA and/or ribosome maturation and assembly/Flp pilus assembly protein, pilin Flp |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,478,021 | 1 | . | A | 100.0% | 40.5 / NA | 17 | intergenic (‑605/‑144) | unknown/unknown | Metal‑dependent hydrolase YbeY, involved in rRNA and/or ribosome maturation and assembly/Flp pilus assembly protein, pilin Flp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base A (10/7); total (10/7) | |||||||||||
TTCCTAC‑AAGGAAAAAGAAATAAATCGCGACATCTCTAAATCCACACATATTTAAGTATTTTTTGTAATTAAAGTTAAAAGTTGTAAATTTACTGTAAAATCAATAGGGAAAGTAGAAATAGCTCATTTACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAA‑TTTTCGCAATCACAATACATACATATACGTAGTGAATTTATTATTCT‑AAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTATAATGCCACTCGTTTATTTAATTCCACAAGATTATTAAATAAATGACATTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATACCTTAATTACGAAAGCATACATCAAAGCAACCGAAGCAATCCGTTCTTTCAAAAAAAATCAAGCAGGTGTGA > 1/1477814‑1478246 | ttCCTACAAAGAAAAAAGAAATAAATCGCGATATCTCTAAATCCACACATATTTAAGT‑GTTTTTGTAATTAAAGTTAAAAGTTGTAAATTTACTGTAAAATCAATAGAGAAAGTAGAAATAGCTCATTTACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACtatataccggt > 1:232544/1‑243 (MQ=255) agaaaaaaGAAATAAATCGCGATATCTCTAAATCCACACATATTTAAGT‑GTTTTTGTAATTAAAGTTAAAAGTTGTAAATTTACTGTAAAATCAATAGAGAAAGTAGAAATAGCTCATTTACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACtatatac < 1:56866/234‑4 (MQ=255) cgcgATATCTCTAAATCCACACATATTTAAGT‑GTTTTTGTAATTAAAGTTAAAAGTTGTAAATTTACTGTAAAATCAATAGAGAAAGTAGAAATAGCTCATTTACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCttatta < 1:354355/251‑1 (MQ=255) tCAATAGAGAAAGTAGAAATAGCTCATTTACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGAc < 1:225005/251‑1 (MQ=255) aGTAGAAATAGCTCATTTACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACtatatac > 1:268495/1‑132 (MQ=255) tACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATACTTTAACTACTAAAGCa > 1:484344/1‑251 (MQ=255) cAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAg < 1:151415/140‑1 (MQ=255) cccTTAACATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAg < 1:497732/213‑1 (MQ=255) aaCATACTGTTAATTAAAAAGTTTTCGCAATCACAATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGAc > 1:199993/1‑210 (MQ=255) caATACGTACATATACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACtatatac > 1:900580/1‑69 (MQ=255) tacatatacataGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATAc > 1:382401/1‑182 (MQ=255) cataTACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCcaca > 1:744965/1‑85 (MQ=255) cataTACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACac < 1:693226/106‑2 (MQ=255) cataTACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGAc > 1:566836/1‑168 (MQ=255) cataTACATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATACTTTAACTACTAAAGCATACATCAAAGCAGCTGAAGCAATCCGTTCTTTCAGAGAAAATCAAGCAGGTGTGa > 1:110562/1‑251 (MQ=255) tataCATAGTGAATTTATTATTCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACac > 1:666090/1‑103 (MQ=255) attCTAAAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTAT‑ATACCGGTCGTTTATTTAATTCCACAAGCTTATTAAATAAATGACACTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACaa < 1:568183/149‑1 (MQ=255) | TTCCTAC‑AAGGAAAAAGAAATAAATCGCGACATCTCTAAATCCACACATATTTAAGTATTTTTTGTAATTAAAGTTAAAAGTTGTAAATTTACTGTAAAATCAATAGGGAAAGTAGAAATAGCTCATTTACAATAACCCTTAACATACTGTTAATTAAAAA‑TTTTCGCAATCACAATACATACATATACGTAGTGAATTTATTATTCT‑AAAAAACTTGCATTTTAATTTTTCAGGACTATAATGCCACTCGTTTATTTAATTCCACAAGATTATTAAATAAATGACATTAAGTTCAAACTCAAGGATTCTTGAATTTTATTTTCTATAAACAACAAAGGAGCATTAAGACAATGTTAAATACCTTAATTACGAAAGCATACATCAAAGCAACCGAAGCAATCCGTTCTTTCAAAAAAAATCAAGCAGGTGTGA > 1/1477814‑1478246 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |