| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 146,302 | (A)8→9 | intergenic (‑49/+190) | unknown ← / ← unknown | Hypoxanthine‑guanine phosphoribosyltransferase (EC 2.4.2.8)/TldE protein, part of TldE/TldD proteolytic complex |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | 1 | 146,294 | 1 | . | A | 99.2% | 333.5 / ‑3.5 | 119 | intergenic (‑41/+198) | unknown/unknown | Hypoxanthine‑guanine phosphoribosyltransferase (EC 2.4.2.8)/TldE protein, part of TldE/TldD proteolytic complex |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base A (45/73); total (46/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.87e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
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AGGTCGTCATAAATTCAATTTCTACCGGCAAATGCAGTTCGCGCACCAAATCCGCCATGAACATAAAGGAACCGCGCAATAAGCCTACCACAACCAAACGGCTGATATTTTTGTGTTGATAGAAGACGGTGATTTCTTTACCGAGTTCCCGGATACGGGAGCGGGCTTCTTGTTCGGAAATCAGAATATCAACGTGGTGTTTTTTCATTTAAGGTTACCTTTGGCAGATGAGGATGTCGCTATTCTAAC‑‑AAAAAAAAGACTGAAGCTTAAACTTCAGTCTTTTCAAATACCCTAACGAATTTACTTTCTACTCTACCTGTTTGGAGTACTATGCAGACTTCCAATGACTACCGTTCATCTTCATTGCAATACTTAACAGATGTGGCTTATGTTAGCAGAGTTTTAATTGTTGTCAATAAGAATTATTATCATTTACAAAAAATATTTTAATTACCGGAAATTTTCATATTTTCCAAGAGAATAGAAC > 1/146046‑146532 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |